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本发明一般地涉及基因组学和微生物学。
背景技术：
微生物组可以包括与生物体相关的共栖的(commensal)、共生的(symbiotic)和致病的微生物生态群落。人类微生物组的表征是一个复杂的过程。人类微生物组包括的微生物细胞比人类细胞多10倍以上，然而，由于样本处理技术、遗传分析技术以及用于处理大量数据的资源的限制，人类微生物组的表征仍处于新兴阶段。当前的知识已经清楚地确定了微生物组与多种健康状况的关系，已逐渐成为宿主遗传和环境因素在人类疾病发展中的媒介。微生物组被怀疑在许多健康/疾病相关状态中起着至少部分的作用。此外，微生物组可以介导环境因素对人类、植物和/或动物健康的影响。考虑到微生物组在影响使用者健康方面的深远意义，应该继续努力，确定微生物组表征，从表征中产生见解(insight)，并且开发用于矫正微生态失调状态的疗法。然而，用于分析人类微生物组和/或基于所获得的见解提供治疗措施的方法和系统，尚有许多问题未得到解答。
因此，在微生物学领域中，需要一种新的和有用的方法和/或系统，用于表征、监测、诊断和/或干预一种或多种微生物相关的健康状况，例如实现个性化(individualized)和/或人群广泛(population-wide)的使用。
附图说明
图1a-1b为方法的一个实施例的变体的流程图；
图2描述了方法和系统的一个实施例；
图3描述了在方法的一个实施例中，用于生成表征模型的过程的变体；
图4描述了基于益生菌的疗法在一种方法的实施例中操作机制的变体；
图5描述了在方法的一个实施例中样本处理的变体；
图6描述了通知规定的示例；
图7描述了该方法的一个实施例的变体的示意图；
图8a-8b描述了利用模型执行表征处理的变体；
图9描述了在方法的一个实施例中促进治疗。
具体实施方式
以下对实施例的描述并非旨在限制实施例，而是使本领域技术人员能够制造和使用。
1.概述
如图1a-1b所示，用于表征一个或多个与阑尾相关病症的方法100的实施例可以包括：确定微生物的数据集(例如，微生物序列数据集、例如基于微生物序列数据集的微生物组组成多样性数据集、例如基于微生物序列数据集的微生物组功能多样性数据集等)与一组使用者相关联(例如，基于来自一组受试者的样本确定微生物数据集)s110；和/或基于微生物数据集(例如，基于微生物组组成特征和/或微生物组功能特征，所述微生物组组成特征和/或微生物组功能特征从微生物数据集导出并且与一个或多个阑尾相关的情况相关联；等等)，执行与一种或多种阑尾相关病症相关联的表征处理(例如，预处理、特征确定、特征处理、阑尾相关表征模型处理，等等)s130，其中执行表征处理可以附加地或可替代地包括针对一种或多种阑尾相关病症，执行阑尾相关表征处理s135，和/或确定一种或多种治疗(例如，确定用于预防、改善、降低风险、和/或以其他方式改善一种或多种阑尾相关病症的等)s140。
方法100的实施例可以附加地或可替代地包括一项或多项：处理与一个或多个与阑尾相关病症相关联的补充数据(例如，提供有用信息的；描述性的；指示性的；与之相关的等)s120；处理与使用者(例如，受试者、人、动物、患者等)相关联的一个或多个生物样本s150；基于与使用者的生物样本相关联的使用者微生物数据集(例如，使用者微生物序列数据集；使用者微生物组组成数据集；使用者微生物组功能数据集；衍生自使用者微生物数据集的使用者微生物组特征，其中该使用者微生物组特征可以对应于由一个或多个表征处理确定的微生物组特征的特征值；等等)，通过一个或多个表征处理，为使用者确定一种或多种阑尾相关的病症的阑尾相关表征s160；为使用者促进对一种或多种阑尾相关病症的治疗干预(例如，基于阑尾相关表征和/或治疗模型)s170；随着时间的推移(例如随着时间的推移，为使用者评估使用者微生物组特征，例如使用者微生物组组成特征和/或与治疗相关联的功能特征，等等)，为使用者(例如，基于处理来自使用者的一系列生物样本)监测一种或多种治疗的有效性和/或监测其它合适的组分(例如，微生物组特征，等等)s180；和/或任何其它合适的处理。
在特定示例中，方法100可以包括确定与一组受试者相关联的微生物序列数据集(例如，包括具有阑尾相关病症的受试者；包括没有阑尾相关病症的受试者，其中与这些受试者相关联的样本和/或数据可以作为对照；等等)，基于与该组受试者相关联的样本中的微生物核酸，其中该样本包括至少一个与一种或多种阑尾相关病症相关联的样本；为该组受试者采集与一种或多种阑尾相关病症相关联的补充数据；基于微生物序列数据集，确定一组微生物组特征，该组微生物组特征包括一组微生物组组成特征和一组微生物组功能特征中的至少一项；基于补充数据和该组微生物组特征，生成阑尾相关表征模型，其中阑尾相关表征模型与一种或多种与阑尾相关病症相关联；基于该阑尾相关表征模型，为使用者确定一种或多种阑尾相关病症的阑尾相关表征；以及基于阑尾相关表征，为使用者促进一种或多种阑尾相关病症的治疗干预(例如，为使用者提供治疗，以促进一种或多种阑尾相关病症的改善等)。
在特定示例中，方法100可以包括从使用者采集样本(例如，通过样本试剂盒的提供和采集，等等)，其中样本包括微生物核酸，所述微生物核酸对应于与一种或多种阑尾相关病症相关联的微生物；基于样本的微生物核酸(例如，基于样本制备和/或样本排序，等等)，确定与使用者相关联的微生物数据集；基于微生物数据集，确定使用者微生物组特征(例如，包括使用者微生物组组成特征和使用者微生物组功能特征中的至少一项等)，其中使用者微生物组特征与一种或多种阑尾相关病症相关联；基于使用者微生物组特征，为使用者确定一种或多种阑尾相关病症的阑尾相关表征；和/或基于阑尾相关表征，为使用者促进治疗相关的治疗干预，以促进一种或多种阑尾相关病症的改善(例如，向使用者推广治疗；等等)。
方法100和/或系统200的实施例可以用于表征(例如，评估、评价、诊断、描述，等等)一种或多种阑尾相关病症(例如，对阑尾相关病症本身进行表征，例如确定与阑尾相关病症相关联的、和/或在其它方面相关联的微生物组特征；为一个或多个使用者表征一种或多种阑尾相关病症，例如为一个或多个使用者确定一种或多种阑尾相关病症的倾向性度量(propensitymetric)；等等)和/或表征一个或多个使用者的一种或多种阑尾相关病症。
附加地或可替代地，方法100和/或系统200的实施例可用于识别与一种或多种阑尾相关病症相关联的(例如，正相关、负相关等)微生物组特征和/或其它合适的数据，例如用作生物标记物(例如，用于诊断过程、用于治疗过程，等等)。
在示例中，阑尾相关表征可以与微生物组组成(例如，微生物组组成多样性等)、微生物组功能(例如，微生物组功能多样性等)、和/或其它合适的、微生物组相关的方面中的至少一项或多项相关联。在一个示例中，微生物特征(例如，描述可识别模式的组成、功能和/或多样性，例如与在使用者微生物组中存在的微生物的相对丰度相关的，例如对于表现出一种或多种阑尾相关病症的受试者；等等)，和/或可以用于表征(例如，诊断、风险评估，等等)的微生物数据集(例如，可以衍生出微生物组特征的，等等)、治疗干预的促进、监测和/或其它合适的目的，例如通过使用生物信息学管道、分析技术和/或本文所述的其它合适的方法。附加地或可替代地，方法100和/或系统200的实施例可以用于对多种阑尾相关病症进行交叉条件分析(cross-conditionanalyses)(例如，对多种阑尾相关病症进行表征处理，例如确定相关性、协方差、共病性(comorbidity)、和/或在不同阑尾相关病症之间的其它合适的关系，等等)，例如在上下文中的表征(例如，诊断；提供与之相关的信息；等等)和/或治疗使用者。
附加地或可替代地，实施例可以用于促进对于一种或多种阑尾相关病症的治疗干预(例如，治疗选择；治疗促进和/或提供；治疗监测；治疗评估等)，例如通过相关治疗的促进(例如，与特定身体部位，例如肠道部位、皮肤部位、鼻部位、口腔部位、生殖器部位、其它合适的身体部位、其它采集部位；通过治疗模型确定治疗；等等)。附加地或可替代地，实施例可以用于生成模型(例如，阑尾相关表征模型，如用于预测表型的；治疗模型，如用于确定治疗的；机器学习模型，如用于处理特征的；等等)，这样的模型可基于使用者的微生物组(例如，使用者微生物组特征；作为临床诊断的；作为伴随诊断的，等等)用于表征和/或诊断使用者、和/或可用于为与一种或多种阑尾相关病症相关联的受试者选择和/或提供治疗。附加地或可替代地，实施例可以执行本文描述的任何合适的功能。
如此，来自使用者群体的数据(例如，与一种或多种阑尾相关病症相关联的受试者群体；与一种或多种阑尾相关病症呈正相关或负相关的；等等)可用于表征随后的使用者，例如用于指示微生物相关的健康状况、和/或改善的地方、和/或促进治疗干预(例如，促进一种或多种治疗；促进使用者微生物组的组成和/或功能多样性调节为一组理想的平衡状态的一项或多项，例如与一种或多种阑尾相关病症相关联的改善的健康状态相关的状态；等等)，例如与一种或多种阑尾相关病症相关。方法100的变体可以进一步促进选择、监测(例如，功效监测等)、和/或调整提供给使用者的治疗，例如随着时间的推移(例如，在整个治疗方案的过程中，通过使用者对阑尾相关疾病的体验程度，等等)，通过采集和分析(例如，利用阑尾相关表征模型)来自使用者的附加样本、跨身体部位(例如，跨使用者的样本采集部位，例如对应于与特定的身体部位类型的采集部位，例如肠道部位、口腔部位、鼻部位、皮肤部位、生殖器部位；等等)，附加地或可替代地随时间的推移处理补充数据，例如对一种或多种阑尾相关病症。然而，方法100和/或系统200的实施例的任何合适的部分可以将来自种群、亚组、个体和/或其它合适的实体的数据用于任何合适的目的。
方法100和/或系统200的实施例可以优选地确定和/或推广(例如，提供；呈现；通知；等等)一种或多种与阑尾相关病症的表征和/或治疗、和/或可以关于阑尾相关病症，执行方法100和/或系统200的实施例的任何合适的部分。阑尾相关病症可以包括以下一项或多项：阑尾炎(appendicitis)(例如，急性阑尾炎；疑似阑尾炎；等等)、阑尾炎症(appendixinflammation)、阑尾癌(例如，阑尾肿瘤)、类癌、类癌综合征、粪石、卵巢黏液性肿瘤、克罗恩氏病(例如，阑尾克罗恩氏病)、淋巴样增生、先天性畸形(例如，先天性缺失；重复阑尾；等等)、阑尾子宫内膜异位、腹膜输卵管异位、血管炎(例如，阑尾血管炎，等等)、神经增生(例如，阑尾神经增生，等等)、间质肿瘤、非肌源性肿瘤、淋巴瘤、肠易激综合征、单核细胞增多症、麻疹、胃肠道感染、肠套叠、腺瘤、憩室病、肠道免疫相关病症、感染；共病，和/或与阑尾相关联的任何其它合适的病症。
附加地或可替代地，阑尾相关病症可以包括以下一项或多项：疾病、症状(例如，血流阻碍；组织死亡；细胞产量过剩；阑尾近端钝痛；食欲不振；组织破裂；疼痛；阑尾肿胀；腹部肿胀；无法通气；排尿疼痛；剧烈疼痛；抽筋；恶心；呕吐；发烧；反跳痛；身体部位如腹部肿胀；背部疼痛；便秘；腹泻；腹膜炎；脓肿；器官衰竭；肌肉僵硬；顽固性便秘；疤痕组织；等等)，原因(例如，触发因素；紧实的粪便物；淋巴增生；例如，由于大便、寄生虫、生长；腹部创伤等引起的阻塞)、疾病、相关的风险(例如倾向性评分等)、相关的严重程度、行为(例如，体育锻炼行为；酒精消耗；吸烟行为；与压力相关的特征；其它心理特征；疾病；社交行为；咖啡因消耗；酒精消耗；睡眠习惯；其它习惯；与饮食相关的行为，例如纤维摄入、水果摄入、蔬菜摄入；冥想和/或其它放松行为；与阑尾相关病症相关联的生活方式条件；对阑尾相关病症的诊断和/或治疗干预提供信息的、与之相关联的，指示性的、促进性的、和/或以其它方式与之相关联的生活方式条件；影响和/或以其它方式与阑尾和/或阑尾相关的病症相关联的行为；等等)、环境因素、与人口统计学相关的特征(例如年龄、体重、种族、性别，等等)、表型(例如可对人、动物、植物、真菌体进行测量的表型；与阑尾和/或其它相关方面相关联的表型，等等)，和/或与阑尾相关病症相关联的任何其它合适方面。在一个示例中，一种或多种阑尾相关病症会干扰正常的身体、心理、社交和/或情感功能。在示例中，可以通过计算机断层扫描(ct扫描)、超声、结肠镜检查、活检、验血、腹部检查(例如，检测炎症，等等)、验尿(例如，检测感染；等等)、诊断成像、医学问诊(medicalinterview)、病史、调查、传感器数据、和/或通过任何合适的技术(例如，可用于诊断阑尾相关病症的技术，等等)来表征和/或诊断一种或多种阑尾相关的病症。
方法100和/或系统200的实施例可以对单个使用者实施，例如与应用一种或多种样本处理过程和/或表征处理相关的，以处理来自使用者的一种或多种生物样本(例如，跨一个或多个采集部位采集，等等)、用于与阑尾相关表征、促进治疗干预、和/或任何其它合适的目的。附加地或可替代地，可以对受试者人群(例如，包括使用者、不包括使用者)实施实施例，其中对于任何合适类型的特征，受试者人群可以包括与任何其它受试者相似和/或不相似的受试者(例如，与阑尾相关病症、人口统计学特征、行为、微生物组组成和/或功能相关的，等等)；对使用者的一个亚组实施(例如，共享特征，例如影响阑尾相关表征和/或治疗确定的特征；等等)；对植物、动物、微生物、和/或任何其它合适实体实施。因此，衍生自一组受试者(例如，受试者人群、一组受试者、使用者的亚组等)的信息，可以用于为后续使用者提供额外的见解。在一个变体中，一组生物样本集合优选地与各种各样的受试者相关联，并且对这些受试者进行处理，例如包括以下一种或多种受试者：不同的人口统计学特征(例如性别、年龄、婚姻状况、种族、国籍、社会经济状况、性取向，等等)，不同的阑尾相关病症(例如健康和疾病状况、不同的遗传倾向；等等)、不同的生活情况(例如，独自生活、与宠物生活、与重要的其他生活、与孩子生活，等等)、不同的饮食习惯(例如杂食、素食、严格素食、糖消耗、酸消耗、咖啡因消耗，等等)、不同的行为倾向(例如，体育锻炼的水平、药物使用、酒精使用，等等)，不同水平的移动性(例如，与在给定时间段内行驶的距离相关)、和/或任何其它合适的特征(例如，影响的、相关联的、和/或在其它方面与微生物组的组成和/或功能相关联的特征，等等)。在示例中，随着受试者数量的增加，方法100和/或系统200的实施例部分实施过程的预测能力会增加，例如基于随后使用者的微生物组(例如，针对使用者样本的不同采集部位等)，与表征随后使用者相关联的(例如，具有变化的特征等)。然而，方法100和/或系统200的实施例的各部分可以对于任何合适的一个实体(entity)或多个实体(entities)，以任何合适的方式执行和/或配置。
本文所述的数据(例如，微生物组特征、微生物数据集、模型、阑尾相关表征、补充数据、通知等)，可以与任何合适的时间指标(例如，秒、分钟、小时、天、周等)相关联，包括一项或多项：指示数据何时采集(例如，指示样本采集的时间指标；等)、确定、传输、接收和/或其它过程的时间指标；提供数据(例如，阑尾相关表征相关联的时间指标，例如，阑尾相关表征描述了在特定时间内阑尾相关病症和/或使用者微生物组状态；等等)所描述内容的上下文的时间指标；时间指标的变化(例如，随着时间推移，阑尾相关表征的变化，例如对接受治疗的响应；样本采集、样本分析、提供阑尾相关表征或治疗使用者之间的时延；和/或方法100的实施例的其它合适部分；等等)；和/或其它与时间有关的合适指标。
附加地或可替代地，参数、指标、输入、输出和/或其它合适的数据可以与以下数值类型相关联，包括：评分(例如，阑尾相关病症的倾向性评分；特征相关性评分；相关性评分，协方差评分、微生物组多样性评分、严重程度评分等)，单值(例如，阑尾相关病症的单个评分，例如对于不同采集部位的病症倾向性评分等)，汇总值(例如，对于不同采集部位，单个微生物相关的评分的总体评分等)，二进制值(例如，微生物组特征的存在或不存在；阑尾相关病症的存在或不存在；等等)，相对值(例如，相对分类群丰度、相对微生物组功能丰度、相对特征丰度等)、分类(例如，阑尾相关病症的分类和/或针对使用者的诊断；特征分类；行为分类；人口统计学特征分类；等等)，置信度(例如，与微生物序列数据集相关联的、与微生物组多样性评分相关联的、与其它阑尾相关表征相关联的、与其它输出相关联的；等等)、标识符、图谱上的数值、和/或任何其它合适类型的数值。本文描述的任何合适类型的数据都可以用作输入(例如，用于本文描述的不同的分析技术、模型和/或其它合适的组件)、生成为输出(例如，不同分析技术、模型，等等)、和/或以任何合适的方式对方法100和/或系统200相关联的任何合适组件进行操作。
本文描述的方法100和/或过程的实施例的一个或多个实例和/或部分，可以异步地(asynchronously)(例如顺序地)、同时地(concurrently)进行，所述同时地(例如并行数据处理；同时交叉条件分析；多重样本处理，例如，多重微生物核酸片段扩增，所述微生物核酸片段对应于与阑尾相关病症相关联的靶序列；进行样本处理和分析以基本同时评估一组阑尾相关病症；计算确定微生物数据集、微生物组特征、和/或表征多个使用者并行的阑尾相关病症；例如同时在不同线程上并行计算，以提高系统处理能力；等等)，在与触发事件(例如方法100的部分表现)的时间关系上(例如，基本上同时地、响应、连续地、之前、之后等)、和/或以任何其它合适的顺序在任何合适的时间和频率，通过和/或使用本文描述的系统200、组件和/或实体的一个或多个实例执行。在一示例中，方法100可以包括基于利用的样本处理系统的下一代测序平台(和/或其它合适的测序系统)桥扩增底物，对一个或多个生物样本的微生物核酸进行处理，从而生成微生物数据集，以及可以在与下一代测序平台进行通信的计算设备上，确定微生物组特征和微生物组功能多样性特征。当然，可以以任何合适的方式配置方法100和/或系统200。
2.示例。
微生物组分析可以对阑尾相关病症实现准确和/或有效的表征和/或治疗提供(例如，根据方法100的实施例的部分等)，所述阑尾相关病症由与之相关联和/或在其它方面相关联的微生物引起的。该技术的特定示例可以克服传统方法在表征阑尾相关病症和/或促进治疗干预方面所面临的若干挑战。首先，常规方法可能需要患者去拜访一个或多个护理提供者，以接受阑尾相关病症的表征和/或治疗建议(例如，通过诊断性医疗程序)，这可能会导致与诊断和/或治疗之前时间流逝相关联的、与医疗保健质量不一致相关联的和/或与护理提供者的其它方面相关联的效率低下和/或健康风险。其次，当其应用于微生物组时，用于人类基因组测序的常规基因测序和分析技术可能不兼容和/或效率低下(例如，其中人类微生物组的微生物细胞数量可能是人类细胞的10倍以上；其中，可行的分析技术和利用分析技术的方式可以不同；其中，最佳样本处理技术可以不同(例如降低扩增偏差)；其中，可以采用阑尾相关表征的不同方法；其中，病症的类型和相关性可以不同；导致相关联病症的原因和/或相关病症的可行治疗可以不同；其中，序列参考数据库可以不同；其中，微生物群在使用者的不同身体区域(例如在不同的采集部位)可以不同；等等)。第三，测序技术(例如，下一代测序，相关的技术等)的兴起引起了技术问题(例如，针对过量生成的序列数据的数据处理和分析问题；以多重方式采集处理多种生物学样本；信息显示问题；治疗预测问题；治疗提供问题，等等)，但由于与遗传物质测序相关联的速度以及数据生成方面的空前发展，这些问题将不存在。方法100和/或系统200的特定示例可为至少上述挑战给予针对技术的解决方案。
首先，该技术的具体示例可以将实体(例如，使用者、生物样本、包括医疗设备的治疗促进系统，等等)转变为不同的状态或事物。例如，该技术可以将生物样本转化为能够进行测序和分析的组分，以生成微生物数据集和/或微生物组特征，所述特征可以用于表征与一种或多种阑尾相关病症相关联的使用者(例如，如通过使用下一代测序系统、多重扩增操作；等等)。在另一个示例中，该技术可以识别、阻碍和/或推广(例如，表现、建议、提供、实施，等等)，治疗(例如，基于阑尾相关表征的个性化治疗；等等)、和/或在其它方面促进治疗干预(例如，促进使用者微生物组组成的改变、微生物组功能，等等)，从而可以预防和/或改善一种或多种阑尾相关病症，例如从而改变微生物组和/或患者的健康(例如，改善与阑尾相关病症相关联的健康状况；等等)，例如应用一项或多项微生物组特征(例如，应用微生物组特征和与一种或多种阑尾相关病症之间关联、关系和/或其他合适的关联；等等)。在另一示例中，该技术可以改变使用者的一个或多个不同身体部位上微生物组组成和/或功能，所述不同身体部位(例如，一个或多个不同的采集部位，等等)例如靶向和/或改变与肠道、鼻、皮肤、口腔和/或生殖器的微生物组相关联的微生物(例如，通过促进与一种或多种部位特定的治疗相关联的治疗干预，等等)。在另一示例中，该技术可以控制治疗促进系统(例如饮食系统、自动药物分配器、行为矫正系统、诊断系统；疾病治疗促进系统；等等)，来促进治疗(例如，通过生成治疗促进系统的控制指令来执行；等等)，从而矫正治疗促进系统。
第二，该技术的具体示例可以改进计算机相关技术(例如，提高阑尾相关病症的微生物相关数据的存储、检索和/或处理的计算效率；与生物样本处理相关联的计算处理等)，例如通过促进计算机执行以前不能执行的功能。例如，该技术可以以非通用的方式，将一组分析技术应用于非通用的微生物数据集和/或微生物组特征(例如，由于样本处理技术和测序技术的进步，这些技术现今可以生成和/或可行等)，以改善阑尾相关表征和/或促进阑尾相关病症的治疗干预。
第三，该技术的具体示例可以在处理速度、阑尾相关表征、准确性、微生物组相关治疗的确定和推广、和/或与阑尾相关病症相关的其它合适方面带来改进。例如，该技术可以利用非通用的微生物数据集来确定、选择和/或以其它方式处理与一种或多种阑尾相关病症特别相关的微生物组特征(例如，与阑尾相关病症相关联的经过处理的微生物组特征；与多个与阑尾相关病症相关联的交叉条件微生物组特征，等等)，这可以促进准确性(例如，通过使用最相关的微生物组特征；通过利用定制的分析技术等)、处理速度(例如，通过选择相关的微生物组特征的子集、通过执行降维技术、通过利用定制的分析技术，等等)、和/或与表型预测相关的其它计算改进(例如，阑尾相关病症的指示等)、其它合适的表征、治疗干预促进和/或其它合适目的。在一特定示例中，该技术可以应用特征选择规则(例如，用于组成、功能的微生物组特征选择规则；用于从补充数据集中提取的补充特征；等等)来选择特定的优化子集(例如，与一种或多种阑尾相关病症相关的微生物组功能特征；微生物组组成多样性特征，例如参考相对丰度特征，指示与阑尾相关病症相关联的分类群的健康、存在、不存在和/或其它合适范围；使用者相对丰度特征，所述特征可以与阑尾相关病症相关联的参考相对丰度特征作比较、和/或治疗响应；等等)，这些特征来自巨大的潜在特征库(例如，可从大量的微生物组数据，例如序列数据，中提取；可通过单变量统计检验识别)以生成、应用和/或在其它方面促进表征和/或治疗(例如，通过模型，等等)。微生物群的潜在规模(例如，人类微生物群、动物微生物群等)可转化为大量数据，从而引发了如何处理和分析大量数据以产生与阑尾相关病症相关的可行微生物学见解的问题。然而，特征选择规则和/或其它合适的计算机可执行规则可以实现一项或多项：较短的生成和执行时间(例如，用于生成和/或应用模型；用于确定阑尾相关表征和/或相关联的治疗；等等)；优化的样本处理技术(例如，通过使用引物类型、其他生物分子和/或通过对分类组、序列和/或与附录相关条件相关的其他适当数据的计算分析而识别的其他样本处理组件，例如在优化以提高特异性、减少扩增偏差和/或其他适当参数的同时，改进来自生物样本的微生物核酸的转化)；模型简化，促进有效解释结果；减少过度拟合；与阑尾相关病症相关联的多个使用者随时间生成、存储和应用阑尾相关表征的网络效应(例如，通过采集和处理与越来越多使用者相关联的越来越多的微生物组相关数据，以提高阑尾相关表征的预测能力和/或治疗确定；等等)；数据存储和检索方面的改进(例如，存储和/或检索阑尾相关表征模型；存储特定模型，例如与不同使用者和/或一组使用者相关联的、与不同阑尾相关病症相关联的；储存与使用者帐户相关联的微生物数据集；存储与一种或多种治疗和/或接受治疗的使用者相关联的治疗监测数据；存储与使用者、一组使用者和/或其他实体相关联的特征、阑尾相关表征和/或其它合适的数据，以改善个性化表征和/或阑尾相关病症治疗间数据传递(delivery)，等等)，和/或对技术领域的其它合适改进。
第四，该技术的具体示例可以相当于跨组分的创造性的功能分布，所述组分包括样本处理系统、阑尾相关表征系统和多个使用者，其中样本处理系统可以基本上同时处理来自多个使用者的生物样本处理(例如，以多重方式)，其可以被阑尾相关表征系统利用，来针对阑尾相关病症生成个性化的表征和/或治疗(例如，根据使用者的微生物组定制，例如与使用者饮食行为、益生菌相关联的行为、病史、人口统计学特征、其它行为、偏好相关的，等等)。
第五，该技术的具体示例至少可以改善基因组学、微生物学、微生物组相关的计算、诊断学、治疗学、微生物组相关的数字医学、通用数字医学、建模和/或其它相关领域的技术领域。在一个示例中，该技术可以建模和/或表征不同的阑尾相关病症，例如，通过计算识别相关的微生物特征(例如，其可以用作诊断中使用的生物标记物、促进治疗干预，等等)。在另一示例中，该技术可以执行交叉病症分析，以识别和评估与多种阑尾相关病症(例如疾病、表型，等)相关联(例如，共享交叉、相关交叉等)的交叉病症微生物组特征。微生物组特征的这种识别和表征可以通过降低并发症和/或多病态的阑尾相关病症(例如，可能与环境因素相关联的，从而与微生物组等相关联的)的风险和患病率，来促进改善的医疗保健实践(例如，在人口和个人水平，例如通过促进诊断和治疗干预，等等)。在具体示例中，该技术可以应用非常规处理(例如，样本处理过程；计算分析处理，等等)，诸如在技术领域中进行改进。
第六，该技术可以利用专业化的计算设备(例如，与样本处理系统相关联的设备，例如下一代测序系统；阑尾相关表征系统；治疗促进系统；等等)执行与方法100和/或系统200的实施例中相关联的合适部分。
然而，该技术的具体示例可以在使用系统200的实施例的非通用的组件和/或合适组件为阑尾相关表征、微生物组调节和/或执行方法100的实施例的合适部分提供任何合适的改进。3.系统。
如图2所示，系统200的实施例(例如，用于表征阑尾有关病症)可以包括以下的任何一项或多项：处理系统(例如，样本处理系统等)210，其可操作用于从一个或多个使用者(例如，人类受试者、患者、动物受试者、环境生态系统、护理提供者等)采集和/或处理生物样本(例如，由使用者采集，并且包括在包含预处理试剂的容器中；等)，用于促进微生物数据集的确定(例如，微生物基因序列；微生物序列数据集；等等)；阑尾相关表征系统220，其可操作用于确定微生物组特征(例如，微生物组组成特征；微生物组功能特征；多样性特征；相对丰度范围；例如基于微生物数据集和/或其它合适的数据；等等)，确定阑尾相关表征(例如，阑尾相关病症的表征、治疗相关表征、使用者的表征等)；和/或治疗促进系统230，其可操作用于促进一种或多种阑尾相关病症(例如，基于一种或多种阑尾相关病症；用于改善一种或多种阑尾相关病症；等等)的治疗干预(例如，促进治疗等)。
系统200的实施例可以包括一个或多个处理系统210，其可用于接收和/或处理(例如，片段化、扩增、测序、生成相关联的数据集，等等)生物样本，以将微生物核酸和/或生物样本的其它组分转化为数据(例如，可以随后进行比对和分析的遗传序列；微生物数据集；等等)，以促进阑尾相关表征的生成和/或治疗干预。处理系统210可以附加地或可替代地用于向多个使用者(例如，响应于样本套件250的购买订单)提供样本套件250(例如，包括样本容器、用于从一个或多个采集部位采集样本的指令，等等)，例如通过邮件传递系统。处理系统210可以包括一个或多个测序系统215(例如，下一代测序系统、用于靶向扩增子测序，宏转录组测序、宏基因组测序、合成测序技术(sequencing-by-synthesistechnique)、毛细管测序技术，桑格测序、焦磷酸测序技术、纳米孔测序技术的测序系统，等等)，用于例如在生成微生物数据(例如，微生物序列数据，微生物数据集的其他数据，等等)时，对一个或多个生物样本进行测序(例如，对来自生物样本的微生物核酸进行测序，等等)。下一代测序系统(例如，下一代测序平台，等等)可以包括任何合适的测序系统(例如，测序平台，等等)，用于一个或多个高通量测序(例如，通过高通量测序来促进；大规模平行测序技术、聚合酶克隆测序、454焦磷酸测序、illumina测序、solid测序、离子激流半导体测序、dna纳米球测序、heliscope单分子测序、单分子实时(smrt)测序、纳米孔dna测序，等等)、任何世代的测序技术(例如第二代测序技术、第三代测序技术、第四代测序技术等)，与扩增子相关联的测序(例如靶向扩增子测序)、与宏基因组相关联的测序(例如宏转录组测序、宏基因组测序等)、合成测序(sequencing-by-synthesis)、隧道电流测序、杂交测序、质谱测序，基于显微的技术和/或任何合适的下一代测序技术。附加地或可替代地，测序系统215可以实施毛细管测序、桑格测序(例如，微流体桑格测序等)、焦磷酸测序、纳米孔测序(牛津纳米孔测序等)、和/或由任何合适的测序技术促进的任何其它合适类型测序的中一种或多种测序。
附加地或可替代地，处理系统210可以包括文库制备系统(librarypreparationsystem)，该文库制备系统可操作用于以多种方式自动制备生物样本(例如，使用与阑尾相关病症相关联的遗传靶标相容的引物，进行片段化和扩增)，以通过测序系统进行测序；和/或任何合适的组件。处理系统210可以执行本文所述的任何合适的样本处理技术。然而，可以以任何合适的方式来配置处理系统210和相关联的组件。
系统200的实施例可以包括一种或多种阑尾相关表征系统220，所述表征系统220可用于确定、分析、表征和/或以其它方式处理的微生物数据集(例如，基于经处理而得到微生物遗传序列的生物样本；与参考序列的比对；等等)；微生物组特征(例如，单个变量；变量组；用于统计描述的、与表型预测相关的特征；与从个体获得的样本相关联的变量；与阑尾相关病症相关联的变量；在相对或绝对量上，完全或部分描述样本的微生物组组成和/或功能的变量；等等)，模型和/或用于促进阑尾相关表征和/或治疗干预的其它合适的数据。在示例中，阑尾相关表征系统220可以识别与特征信息相关联的数据，所述特征信息统计地描述与一种或多种阑尾相关病症相关联的样本之间的差异(例如，与阑尾相关病症的存在、不存在、其风险、倾向和/或相关联的其它方面等)，例如，其中不同的分析可以为区分不同样本的特征提供补充视图(例如，区分与病症的存在或不存在相关联的亚组等)。在特定示例中，单个预测变量、特定生物学过程和/或统计推断的潜在变量可以在不同数据复杂性水平上提供补充信息，以促进与表征、诊断和/或治疗相关的各种下游机会(opportunities)。在另一特定示例中，阑尾相关表征系统220处理用于执行一个或多个表征处理的补充数据。
阑尾相关表征系统220可以包括、生成、应用和/或以其它方式的处理阑尾相关表征模型，所述表征模型可以包括阑尾相关病症模型中的任何一个或多个，以表征一种或多种阑尾相关病症(例如，确定一个或多个使用者的一种或多种阑尾相关病症的倾向性等)、用于确定治疗的治疗模型和/或用于与系统200和/或方法100的实施例相关的任何合适目的的任何其它合适模型。在一特定示例中，阑尾相关表征系统220可以生成和/或应用治疗模型(例如，基于交叉病症分析，等等)，以识别和/或表征用于治疗一种或多种阑尾相关病症的治疗。不同的阑尾相关表征模型(例如，阑尾相关表征模型的不同组合；应用不同分析技术的不同模型；不同的输入和/或输出类型；以不同的方式应用(例如与时间和/或频率相关的)；等)，可以基于以下一项或多项进行应用(例如执行、选择、检索、存储等)：阑尾相关病症(例如，根据正在表征的一种或多种阑尾相关病症而使用不同的阑尾相关表征模型，例如对于与不同的阑尾相关病症和/或病症组合相关的数据处理，不同的阑尾相关表征模型具有不同的适用性水平，等等)，使用者(例如，基于不同使用者的数据和/或特征、人口统计学特征、遗传学、环境因素，不同的阑尾相关表征模型，等等)、阑尾相关表征(例如，用于不同类型的表征的不同阑尾相关表征模型，例如治疗相关表征对于诊断相关表征，例如用于识别相关微生物组组成对于确定阑尾相关病症的倾向性评分；等等)、治疗(例如，用于监测不同治疗功效的不同阑尾相关表征模型，等等)、身体部位(例如，用于处理与对应于来自不同样本采集部位的生物样本的微生物数据集不同的阑尾相关表征模型；等等)、补充数据和/或任何其它合适的组件。然而，可以以任何合适的方式定制和/或使用阑尾相关表征模型，以促进与阑尾相关表征和/或治疗干预。
阑尾相关表征系统220可以优选地用于确定部位特定的阑尾相关表征(例如，部位特定的分析)。在示例中，阑尾相关表征系统220可以生成和/或应用不同部位特定的阑尾相关表征模型。在特定的示例中，可以基于不同的微生物组特征，生成和/或应用不同的部位特定的阑尾相关表征模型，例如与一个或多个身体部位相关联的部位特定特征，其中一个或多个身体部位与部位特定的阑尾相关表征模型相关联(例如，使用肠道部位特定特征，衍生自从受试者的肠道采集部位处采集的样本，和与一种或多种阑尾相关病症相关联，例如用于生成肠道部位特定的阑尾相关表征模型，所述模型可以基于在使用者肠道采集部位处采集的使用者样本，用于确定表征；等等)。部位特定的阑尾相关表征模型、部位特定的特征、样本、部位特定的治疗和/或其它合适的实体(例如，能够与身体部位相关联的等)，优选地与至少一个身体部位相关联(例如，与样本采集部位对应；等等)，身体部位包括一个或多个肠道部位(例如，基于粪便样本来表征等)、皮肤部位、鼻部位、生殖器部位(例如与生殖器、生殖系统相关联的部位)、口腔部位和/或任何合适的身体部位。在示例中，可以将不同的阑尾相关表征模型定制为不同类型的输入、输出、阑尾相关表征、阑尾相关病症(例如，需要表征的不同表型指标)和/或任何其它合适的实体。然而，部位特定的表征可以以任何方式配置，并且可以由阑尾相关表征系统220和/或其它合适的组件以任何方式确定。
阑尾相关表征模型、其他模型、系统200实施例的其他组件、和/或方法100实施例的合适部分(例如，表征处理、确定微生物组特征、确定阑尾相关表征，等等)可以采用分析技术，所述分析技术包括一项或多项：单变量统计测试、多变量统计测试、降维技术、人工智能方法(例如机器学习方法等)、对数据执行模式识别(例如，识别阑尾相关病症与微生物组特征之间的相关性)、融合来自多个来源的数据(例如，基于微生物组数据和/或补充数据，所述补充数据来自与一种或多种阑尾相关病症相关联的多个使用者，例如基于从数据中提取的微生物组特征，生成表征模型；等等)、值的组合(例如，平均值等)、压缩、转换(例如，数模转换、模数转换)、对数据进行统计估计(例如，普通最小二乘回归、非负最小二乘回归、主成分分析、岭回归，等等)、波调制、标准化、更新(例如，基于经过处理的生物样本随时间推移的表征模型和/或治疗模型；等等)、排序(例如，微生物组特征；治疗；等等)，加权(例如微生物组特征；等等)、验证、过滤(例如用于基线校正，数据裁剪，等等)、降噪、平滑、填充(例如，间隙填充)、校准、模型拟合、分箱(binning)、加窗(windowing)、剪辑、变换、数学运算(例如，导数、移动平均值、求和、减法、乘法、除法，等等)、数据关联、多路复用(multiplexing)、解多路复用(demultiplexing)、内插、外推、聚类、图像处理技术、其它信号处理操作、其它图像处理操作、可视化和/或任何其它合适的处理操作。人工智能方法可以包括以下一项或多项：监督学习(例如，使用逻辑回归、使用反向传播神经网络、使用随机森林、决策树，等等)、无监督学习(例如，使用先验算法、使用k-均值聚类)、半监督学习、深度学习算法(例如神经网络、受限玻尔兹曼机、深度信念网络方法、卷积神经网络方法、递归神经网络方法、堆叠式自动编码器方法，等等)、强化学习(例如，使用q学习算法、使用时间差分学习)、回归算法(例如，普通最小二乘法、逻辑回归、逐步回归、多变量自适应回归样条、局部估计散点图平滑，等等)、基于实例的方法(例如，k最近邻、学习矢量量化、自组织映射，等等)、正则化方法(例如，岭回归、最小绝对收缩、选择运算符、弹性网络等)、决策树学习方法(例如，分类和回归树、迭代二分法3、c4.5、卡方自动交互检测、决策树桩、随机森林、多变量自适应回归样条、梯度推进机，等等)、贝叶斯方法(例如朴素贝叶斯、平均单依赖估计量、贝叶斯信念网络，等等)、核方法(例如支持向量机、径向基函数、线性判别分析，等等)、聚类方法(例如k均值聚类、期望最大化，等等)、关联规则学习算法(例如先验算法，eclat算法，等等)、人工神经网络模型(例如感知器法、反向传播法、hopfield网络法、自组织映射方法、学习矢量量化方法，等等)、集成方法(例如增强、增强型聚合、自适应增强、堆叠泛化、梯度增强机器方法、随机森林方法，等等)和/或任何合适的人工智能方法。然而，可以以任何合适的方式使用数据处理。
阑尾相关表征系统220可以对多个阑尾相关病症进行交叉条件分析(例如，基于不同的阑尾相关表征模型的输出，例如多病症微生物组特征，生成多病症表征；等等)。例如，基于微生物数据、微生物组特征和/或与其他合适的使用者多个阑尾相关病症相关联的微生物组表征(例如，被诊断、被表征，等等)，阑尾相关表征系统可以表征阑尾相关病症之间的关系。在特定示例中，可以基于各个阑尾相关病症的表征(例如，各个阑尾相关病症的阑尾相关表征模型的输出，等等)，来执行交叉病症分析。交叉病症分析可以包括特定病症特征(例如，仅与单个阑尾相关病症相关联的，等)、多病症特征(例如，与两种或多种阑尾相关病症相关联的，等)、和/或任何其它合适类型的特征的识别。交叉病症分析可以包括确定报告相关性的参数、一致性和/或描述了两种或多种阑尾相关病症之间关系的其它类似的参数，例如通过评估不同对的阑尾相关病症。然而，可以以任何合适的方式配置阑尾相关表征系统和/或其他合适的组件，以促进交叉病症分析(例如，将分析技术应用于交叉病症分析目的；生成交叉病症表征，等等)。
阑尾相关表征系统220优选地包括远程计算系统(例如，用于应用阑尾相关表征模型，等等)，然而，可以附加地或可替代地，包括任何合适的计算系统(例如，本地计算系统、使用者设备、处理系统组件，等等)。然而，可以以任何合适的方式来配置阑尾相关表征系统220。
系统200的实施例可以包括一个或多个治疗促进系统230，其可以用于促进一种或多种阑尾相关病症(例如，促进使用者微生物组组成和功能多样性的调节，以改善与一种或多种阑尾相关病症相关联的使用者状态，等等)的治疗干预(例如，推广一种或多种治疗，等等)。治疗促进系统230可以促进与任何数量的身体部位(例如，与任意合适数量的样本采集部位对应的；等等)相关联的任何数量的阑尾相关病症的治疗干预，例如基于部位特定表征(例如，与多个身体部位相关联的多部位表征；等等)、多病症表征、其它表征和/或任何其它合适的数据。治疗促进系统230可以包括任何一项或多项：通信系统(例如，将治疗建议、选择、劝阻(discouragement)和/或其它合适的治疗相关的信息传达到计算设备(例如，使用者设备和/或护理提供者设备；移动设备；智能电话；台式计算机；在网站、网络应用程序和/或计算设备访问的移动应用程序中；等等)；以实现护理提供者与阑尾相关病症的受试者之间的远程医疗；等等)、使用者设备上可执行的应用程序(例如，指示使用者微生物组组成和/或功能；等等)、医疗设备(例如生物采样设备，例如用于从不同样本采集部位处采集样本；药物提供设备；手术系统；等等)、使用者设备(例如生物特征传感器)，和/或任何其它合适的组件。一种或多种治疗促进系统230可以是可控制的，与阑尾相关表征系统220通信的、和/或在其它方面与之相关联的。例如，阑尾相关表征系统220可以生成一种或多种阑尾相关病症的表征，以使治疗促进系统230呈现(例如，传输、通信，等等)给相应的使用者(例如，在界面240处，等等)。在另一示例中，治疗促进系统230可以更新和/或以另外修改应用和/或设备的其它软件(例如，使用者的智能手机)，以促进治疗(例如，在待办事项列表应用中推广生活方式改变，以改善与一种或多种阑尾相关病症相关联的使用者状态，等等)。然而，可以以任何其它方式配置治疗促进系统230。
如图9所示，系统200的实施例可以附加地或可替代地包括界面240，所述界面240可以改进微生物组特征、阑尾相关病症的信息(例如倾向性度量；治疗推荐；与其它使用者的比较；其它特征；等)、和/或与一种或多种阑尾相关特征相关联(例如，包括在其中、与之相关、衍生自等)的特定信息(例如，本文所述的任何合适数据)的呈现。在示例中，界面240可以呈现阑尾相关病症的信息，包括微生物组组成(例如，分类群；相对丰度；等等)，功能多样性(例如，与特定功能相关联的基因的相对丰度以及一种或多种阑尾相关病症的倾向性度量，例如相对于共享人口统计学特征的用户群体(例如，吸烟者、锻炼者、不同饮食方案的使用者、益生菌的消费者、抗生素使用者、正在接受特殊治疗的群体，等等))。然而，界面240可以以任何合适的方式进行配置。
尽管系统200的实施例的组件通常被描述为不同的组件，然而，它们可以以任何方式在物理和/或逻辑上集成。例如，计算系统(例如，远程计算系统、使用者设备，等等)可以实现部分和/或全部的阑尾相关表征系统220(例如，应用微生物组相关的病症模型，为使用者生成阑尾相关病症的表征，等等)和治疗促进系统230(例如，通过呈现与微生物组组成和/或功能相关的见解来促进治疗干预；呈现治疗建议和/或信息；在智能手机的日历应用上安排每日事件，以通知使用者关于改善阑尾相关的治疗，等等)。在一个示例中，系统200的实施例可以省略治疗促进系统230。然而，系统200的实施例的功能可以以任何合适的方式分布在任何合适的系统组件之间。然而，系统200的实施例的组件可以以任何合适的方式进行配置。
4.1确定微生物数据集。
方法100的实施例可以包括区块s110，所述区块s110可以包括确定与一组使用者s110相关联的微生物数据集(例如，微生物序列数据集、微生物群组成多样性数据集，例如基于微生物序列数据集、微生物组功能多样性数据集，例如基于微生物序列数据集)。区块s110可用于处理样本(例如，生物样本；非生物样本；与受试者群体、受试者亚组、共享人口统计学特征和/或其它合适特征的受试者亚组相关联的样本集合；使用者样本；等等)，以确定与相应的微生物组相关联的成分、功能、药物基因组学和/或其它合适方面，例如与一种或多种阑尾相关病症相关的。组成和/或功能方面可以包括在微生物水平(和/或其它合适的尺度)中的一个或多个方面，包括与微生物在不同的界、门、纲、目、科、属、种、亚种、品系和/或任何其它合适的种下分类单元之间的分布相关的参数(例如，以每组的总丰度、每组的相对丰度、所代表的组总数衡量，等等)。组成和/或功能方面也可以用操作分类单位(otu)表示。组成和/或功能方面可以附加地或可替代地包括遗传水平上的组成方面(例如，由多位点序列分型、16s序列、18s序列、its序列、其它遗传标记物、其它系统发育标记物等等确定的区域)。组成和功能方面可以包括与特定功能(例如酶活性、转运功能、免疫活性，等等)相关联的基因的存在或不存在或数量。因此，区块s110的输出可用于促进确定微生物组特征(例如，生成微生物序列数据集，可用于识别微生物组特征；等等)，以用于区块s110和/或方法100实施例的其它合适部分的表征处理(例如，在区块s110可以得到可以从中提取微生物组特征的微生物组组成数据集、微生物组功能数据集和/或其它合适微生物数据集的输出，等等)，其中特征可以是基于微生物的(例如，细菌属的存在)、基于遗传的(例如，基于特定遗传区域和/或序列的表示)、基于功能的(例如，特定的催化活性的存在)和/或任何其它合适的微生物组特征。
在一个变体中，区块s110可以包括基于源于细菌和/或古细菌的系统发育标记物(例如，用于生成微生物数据集，等等)的评估和/或处理，所述细菌和/或古细菌与一种或多种相关联的基因家族相关：核糖体蛋白s2、核糖体蛋白s3、核糖体蛋白s5、核糖体蛋白s7、核糖体蛋白s8、核糖体蛋白s9、核糖体蛋白s10、核糖体蛋白s11、核糖体蛋白s12/s23、核糖体蛋白s13、核糖体蛋白s15p/s13e、核糖体蛋白s17、核糖体蛋白s19，核糖体蛋白l1、核糖体蛋白l2、核糖体蛋白l3、核糖体蛋白l4/l1e、核糖体蛋白l5、核糖体蛋白l6、核糖体蛋白l10、核糖体蛋白l11、核糖体蛋白l14b/l23e、核糖体蛋白l15、核糖体蛋白l16/l10e、核糖体蛋白l18p/l5e、核糖体蛋白l22、核糖体蛋白l24、核糖体蛋白l25/l23、核糖体蛋白l29、翻译延伸因子ef-2、翻译起始因子if-2、金属内肽酶、ffh信号识别颗粒蛋白、苯丙氨酰trna合成酶β亚基、苯丙氨酰trna合成酶α亚基、trna假尿苷合酶b、胆色素原脱氨酶、核糖体蛋白l13、磷酸核糖甲酰甘氨脒环化连接酶和核糖核酸酶hii。附加地或可替代地，标记物可以包括靶序列(例如，与微生物分类组相关联的序列；与功能方面相关联的序列；与阑尾相关病症相关联的序列；指示使用者对不同治疗的响应性的序列；在群体和/或任何合适的受试者组中保持不变的序列，例如使用共享引物序列的引物类型以促进多重扩增；保守序列；包括突变、多态性的序列；核苷酸序列；氨基酸序列，等等)、蛋白质(例如血清蛋白、抗体，等等)、肽、碳水化合物、脂质、其它核酸、全细胞、代谢物、天然产物、遗传易感性生物标志物、诊断性生物标志物、预后性生物标志物、预测性生物标志物、其它分子生物标记物、基因表达标记物、成像生物标记物和/或其它合适的标记物。然而，标记物可以包括与微生物组组成、微生物组功能和/或阑尾相关病症相关联的任何其它合适的标记物。
因此，表征生物样本集合的微生物组组成和/或功能方面优选地包括样本处理技术的组合(例如，湿法实验室技术；如图5所示)，包括但不限于，扩增子测序(例如16s、18s、its)、umi、3步pcr、crispr、宏基因组学方法、宏转录组学，随机引物的使用和计算技术(例如利用生物信息学的工具)来定量地和/或定性地表征与每个来自受试者或受试者群体的生物样本相关联的微生物组和功能方面。例如，确定微生物数据集(例如，微生物序列数据集，等等)可以包括基于一个或多个样本(例如，样本中存在的微生物核酸的至少一个子集；等等)的微生物核酸，来确定宏基因组文库和宏转录组文库中的至少一个，并且在确定一组微生物组特征时，可以基于宏基因组文库和宏转录组文库中的至少一个。
在变体中，区块s110中的样本处理可以包括一项或多项：裂解生物样本、破坏生物样本细胞中的膜，从生物样本中分离不需要的元素(例如rna、蛋白质)、纯化生物样本中核酸(例如dna)、从生物样本中扩增核酸、进一步纯化生物样本中的扩增核酸、和对生物样本中的扩增核酸进行测序。在一个示例中，区块s110可以包括：从一组使用者中采集生物样本(例如，使用者使用包括样本容器的采样试剂盒采集的生物样本，等等)，其中，生物样本包括与阑尾相关病症相关联的微生物核酸(例如，微生物核酸，其包括与阑尾相关病症相关联的靶序列；等等)。在另一个示例中，区块s110可以包括向一组使用者提供一组采样试剂盒，该组采样试剂盒中的每个采样试剂盒包括样本容器(例如，包括预处理试剂、例如裂解试剂；等等)，该样本容器可操作以从一组使用者中的一个使用者接收生物样本。
在变体中，裂解生物样本和/或破坏生物样本细胞中的膜优选地包括物理方法(例如，珠击(beadbeating)、氮气减压、均质化，超声处理)，其省略了某些试剂，这些试剂在测序时在某些细菌群的表示上产生偏差。附加地或可替代地，在区块s110中的裂解或破坏可以涉及化学方法(例如，使用洗涤剂、使用溶剂、使用表面活性剂，等等)。附加地或可替代地，在区块s110中的裂解或破坏可以涉及生物学方法。在变体中，分离不需要的元素可以包括使用rnase去除rna和/或使用蛋白酶去除蛋白质。在变体中，核酸的纯化可以包括以下的一项或多项：从生物样本中沉淀核酸(例如，使用基于醇的沉淀方法)、基于液-液的纯化技术(例如，苯酚-氯仿萃取)、基于色谱的纯化技术(例如，柱吸附)、涉及部分结合颗粒的结合使用(例如，磁珠、浮珠，具有大小分布的珠、超声响应的珠，等等)的纯化技术，其配置为结合核酸以及配置为在洗脱环境(例如，具有洗脱溶液、提供ph值变化、提供温度变化，等等)释放核酸、和任何其它合适的纯化技术。
在变体中，纯化核酸的扩增可以包括以下的一种或多种：基于聚合酶链式反应(pcr)的技术(例如，固相pcr、rt-pcr、qpcr、多重pcr、降落pcr、nanopcr、嵌套pcr、热启动pcr等)、解旋酶依赖性扩增(hda)、环介导的等温扩增(lamp)、自我维持的序列复制(3sr)、基于核酸序列的扩增(nasba)、链置换扩增(sda)、滚环扩增(rca)、连接酶链式反应(lcr)和其它任何合适的扩增技术。在纯化核酸的扩增中，优选地选择所用的引物以防止或最小化扩增偏差，以及该引物被配置为扩增核酸区域/序列(例如，16s区域、18s区域、its区域等)，其在信息分类学、系统发生上是信息丰富的，用于诊断、制剂(例如，益生菌制剂)和/或任何其它合适的目的。因此，在扩增中，可以使用被配置为避免扩增偏差的通用引物(例如，用于16srna的f27-r338引物组，用于16srna的f515-r806引物组等)。附加地或可替代地，包括结合的条形码序列和/或特定于生物样本、使用者、阑尾相关表征、分类群、靶序列和/或任何其它合适的成分(其可以促进测序后识别过程，例如，用于将序列读数映射到微生物组组成和/或微生物组功能方面；等等)的umi。在blocks110的变体中使用的引物可以附加地或可替代地包括被配置为与涉及互补衔接子的测序技术(例如，illumina测序)配合。附加地或可替代地，blocks110可以实施被配置为促进处理的任何其它步骤(例如，使用nextera试剂盒)。在一个特定示例中，执行扩增和/或样本处理操作可以以多重方式进行(例如，对于单个生物样本、对于跨多个使用者的多个生物样本；等等)。在另一个特定的实例中，进行扩增可以包括标准化步骤，以平衡文库和检测混合物中所有扩增子，而独立于起始材料的量，例如3步pcr、基于磁珠的标准化和/或其它合适的技术。
在变体中，纯化核酸的测序可包括涉及靶向扩增子测序、宏转录组测序和/或宏基因组测序的方法，实施技术包括以下的一种或多种：合成测序技术(例如illumina测序)、毛细管测序技术(例如，桑格测序)、焦磷酸测序技术和纳米孔测序技术(例如，使用牛津纳米孔技术)。
在一个特定示例中，来自该组生物样本的生物样本的核酸扩增和测序包括：固相pcr，其涉及使用寡核苷酸衔接子在底物上桥接(bridge)生物样本的dna片段，其中扩增涉及引物，所述引物具有正向索引序列的(例如，对应于miseq/nextseq/hiseq平台的illumina正向索引)、正向条形码序列、转座酶序列(例如，对应于miseq/nextseq/hiseq平台的转座酶结合位点)、衔接物(例如，零碱基、一碱基或两碱基的片段，其配置用于减少均一性以及改善序列结果)、其它随机碱基、umi、用于靶向特定靶区域(例如16s区域、18s区域、its区域)的序列、反向索引序列(例如，对应于miseq/hiseq平台的illumina反向索引)和反向条形码序列。在该特定示例中，测序可以包括使用合成测序技术的illumina测序(例如，利用hiseq平台、利用miseq平台、利用nextseq平台，等等)。在另一特定示例中，方法100可以包括：识别一种或多种引物类型，所述引物类型与一种或多种阑尾相关病症相关联的一种或多种遗传靶标相兼容(例如，一种或多种阑尾相关病症的生物标记物；与之正相关的；与之负相关的；与之成因；等等)；基于一种或多种引物类型(例如，基于对应于一种或多种引物类型的引物，以及采集的生物样本中包含的微生物核酸)，为一个或多个使用者(例如，一组受试者)确定微生物数据集(例如，微生物序列数据集；例如，采用下一代测序系统；等等)，例如通过将微生物核酸片段化，和/或基于一种或多种已识别的引物类型(例如，对应于所述引物类型的引物，等等)，所述引物类型与阑尾相关病症相关联的一种或多种遗传靶标相兼容，对片段化微生物核酸进行单重扩增和/或多重扩增；和/或基于衍生自微生物数据集的阑尾相关表征，推广(例如，提供)使用者病症的治疗(例如，阑尾相关病症；能够选择性地调节使用者的微生物组，所述使用者与所需分类群的种群规模和所需微生物组功能中的至少一项相关)。在一个特定示例中，确定微生物数据集，可以包括通过微生物核酸的单重扩增处理和多重扩增处理中的至少一个，生成扩增的微生物核酸；利用下一代测序系统，基于扩增的微生物核酸确定微生物数据集。
在示例中，生物样本可以对应于一个或多个采集部位，包括肠道采集部位(例如，对应于肠道部位的身体部位类型)、皮肤采集部位(例如，对应于皮肤部位的身体部位类型)、鼻采集部位(例如，对应于鼻部位的身体部位类型)、口腔采集部位(例如，对应于口腔部位的身体部位类型)、和生殖器采集部位(例如，对应于生殖器部位的身体部位类型)中的至少一个。在一个特定示例中，确定微生物数据集(例如，微生物序列数据集等)可以包括识别第一引物类型，所述第一引物类型与一种或多种阑尾相关病症和该组采集部位中的第一采集部位相关联的第一遗传靶标相兼容；识别第二引物类型，所述第二引物类型与一种或多种阑尾相关病症和该组采集部位中的第二采集部位相关联的第二遗传靶标相兼容；基于微生物核酸、对应于第一引物类型的第一引物和对应于第二引物类型的第二引物，生成一组受试者的微生物数据集。
在变体中，在方法100实施例的区块s110和/或其它合适的部分中使用的引物(例如，对应于引物序列的引物类型；等等)，可以包括与蛋白质基因相关联的引物(例如，编码跨多个分类群的保守蛋白质基因序列，例如能够对多个靶标和/或分类群进行多重扩增；等等)。引物可以附加地或可替代地与阑尾相关病症(例如，与遗传靶标相兼容的引物，所述遗传靶标包括与阑尾相关病症相关的微生物的微生物序列生物标记物等)、微生物组组成特征(例如，识别出的引物与微生物组组成特征相对应的遗传靶标相容，所述微生物组组成特征与一组阑尾相关病症有关的分类群相关联；从中得出相对丰度特征的遗传序列，等等)、功能多样性特征、补充特征和/或其它合适的特征和/或数据相兼容。引物(和/或本文所述的其它合适的分子、标记物和/或生物材料)可以具有任何合适的大小(例如，序列长度、碱基对数目、保守的序列长度，可变区长度等)。附加地或可替代地，可以在样本处理中使用任何合适数量的引物，以进行表征(例如，阑尾相关表征；等)、改善样本的处理(例如，通过降低扩增偏差等)、和/或用于任何合适目的。该引物可以与任何合适数量的靶标、序列、分类群、病症和/或其它合适方面相关联。可以通过区块s110(例如，基于用于生成分类数据库的参数的引物选择)，和/或方法100实施例的任何其它合适的部分所描述的过程，选择区块s110和/或方法100实施例的其它合适的部分中使用的引物。附加地或可替代地，引物(和/或与引物相关联的处理)可以包括和/或类似于于2015年10月21日提交的、美国申请no.14/919,614(其全部内容通过引用合并于此)中所述。然而，可以以任何合适的方式配置引物的识别和/或使用。
样本处理的某些变体可以包括在测序之前，进一步纯化扩增的核酸(例如pcr产物)，其功能是去除过剩的扩增元素(例如引物、dntp、酶、盐等)。
在示例中，可以使用以下的任何一种或多种来促进额外的纯化：纯化试剂盒、缓冲液、醇、ph指示剂、离液盐、核酸结合过滤器、离心和/或任何其它合适的纯化技术。
在变体中，区块s110中的计算处理可以包括以下的任何一项或多项：微生物组衍生序列的识别(例如，与受试者序列和污染物相对的)，微生物组衍生序列的比对和映射(例如，使用单端比对、无缺口比对、缺口比对、配对中的一种或多种来比对片段化的序列)，并生成与微生物组(其与生物样本相关联)组成和/或功能方面相关联(例如，衍生自)的特征。
微生物组衍生序列的识别可以包括将来自样本处理的序列数据映射到受试者的参考基因组(例如，由基因组参考组织(genomereferenceconsortium)提供)，以便去除受试者基因组衍生序列。然后，可以基于序列相似性和/或基于参考的方法(例如，使用vamps、使用mg-rast、使用qiime数据库)，将序列数据映射到受试者参考基因组后剩余的未识别序列进一步聚类为可操作的分类单位(otu)，比对(例如，使用基因组散列方法、使用needleman-wunsch算法、使用smith-waterman算法)，使用比对算法(例如，基本局部比对工具、fpga加速比对工具、使用bwa进行bwt索引、使用soap进行bwt索引，使用bowtie进行bwt索引，等等)，映射到参考细菌基因组(例如，由国家生物技术信息中心(nationalcenterforbiotechnologyinformation)提供的)。未识别序列的映射可以附加地或可替代地包括对参考古细菌基因组、病毒基因组和/或真核基因组的映射。此外，分类单元的映射可以相对于现有数据库和/或相对于定制生成的数据库来执行。
然而，处理生物样本、生成微生物数据集和/或与区块s110相关联的其它方面可以以任何合适的方式执行。
4.2处理补充数据。
方法100的实施例可以附加地或可替代地包括区块s120，其可以包括处理(例如，接收、采集、变换、确定补充特征，对补充特征进行排序、识别相关性等)与一种或多种阑尾相关病症、一个或多个使用者和/或其它合适的实体相关联(例如，提供信息；进行描述；指示；与之相关；等)的补充数据(例如，一个或多个补充数据等)。区块s120可以用于处理补充微生物数据集、微生物组特征的数据(例如，与确定阑尾相关表征和/或促进治疗干预相关的等)，和/或可以用于补充方法100和/或系统200任何合适的部分(例如，处理用于促进一个或多个表征处理的补充数据；例如在区块s130中；例如用于促进训练、验证、生成、确定、应用和/或以其它方式处理的阑尾相关表征模型，等等)。在示例中，补充数据可以包括调查衍生的数据、使用者数据、部位特定数据和设备数据(和/或其它合适的补充数据)中的至少一个，其中方法100的示例可以包括基于调查衍生的数据、使用者数据、部位特定数据和设备数据(和/或其它合适的补充数据)中的至少一个来确定一组补充特征；以及基于补充特征、微生物组特征和/或其它合适的数据生成一个或多个阑尾相关表征模型。
补充数据可以包括以下的一项或多项：调查衍生的数据(例如，来自针对一种或多种阑尾相关病症进行调查的一项或多项调查的响应数据，本文所述的任何合适类型的数据；等等)；部位特定的数据(例如，为不同采集部位提供信息的数据，例如指示微生物群在特定采集部位和一种或多种阑尾相关病症之间的相关性的先验生物学知识；等等)；阑尾相关病症的数据(例如，为不同的阑尾相关病症提供信息的数据，例如与微生物组特征、治疗、使用者相关的，等等)；设备数据(例如，传感器数据；上下文的与阑尾相关联的传感器数据；可穿戴设备数据；医疗设备数据；使用者的设备数据，例如移动电话应用程序数据；网络应用程序数据等)；使用者的数据(例如，当前使用者的医疗数据和历史医疗数据，例如历史治疗、历史医学检查数据；医疗设备衍生的数据；生理数据；与医学检查相关的数据；社交媒体数据；人口统计学数据；家族史数据；描述行为的行为数据；描述环境因素的环境因素数据；与饮食相关的数据，例如来自食品企业登记的数据、来自分光光度分析的数据、使用者输入的数据、与益生菌和/或益生元食品相关联的营养数据、食品消耗类型、食品消耗量、热量数据、饮食方案数据和/或其它与饮食相关的合适数据；等等)；先前生物学知识(例如，为阑尾相关病症、微生物组特征、微生物组特征和阑尾相关病症之间的关联性提供信息的等)；和/或任何其它合适类型的补充数据。
在变体中，处理补充数据可以包括处理调查衍生的数据，其中调查衍生的数据可以提供生理数据、人口统计学数据、行为数据，环境因素数据(例如，描述环境因素的等)、其它类型补充数据和/或任何其它合适的数据。生理数据可以包括与生理特征相关的信息(例如身高、体重、体重指数、体脂百分比、体毛水平、病史，等等)。人口统计学数据可以包括与人口统计学特征相关的信息(例如，性别、年龄、种族、婚姻状况，兄弟姐妹数量、社会经济状况、性取向，等等)。行为数据可以描述以下的一种或多种行为：与健康相关的状态(例如，健康和疾病状态)、饮食习惯(例如，酒精消耗、咖啡因消耗、杂食、素食、严格素食、糖消耗、酸消耗、小麦、鸡蛋、大豆、坚果、花生、贝类的消耗、食物偏爱、过敏特征、其它食品项目消耗和/或避免，等等)、行为倾向(例如，体育锻炼水平、药物使用、酒精使用、习惯养成，等等)、不同程度的活动性(例如，运动量，例如低、中和/或极端的体育锻炼活动；与给定时间段内的行进距离相关的；由运动传感器指示的，例如运动和/或位置传感器；等等)，不同水平的性活动(例如，与伴侣的数量和性取向相关的)以及任何其它合适的行为数据。调查衍生的数据可以包括定量数据、定性数据和/或其它合适类型的调查衍生的数据，例如可以将定性数据转换为定量数据(例如，使用严重性等级，将定性分数反应映射到定量分数，等等)。处理调查衍生的数据可以包括例如通过向一个或多个使用者、受试者和/或其它合适的实体提供一项或多项调查，促进调查衍生的数据的采集。可以亲自(例如，与采样试剂盒的提供和/或样本的接收协调；等等)，电子方式(例如，在帐户设置期间；在受试者的电子设备上执行的应用程序、在可通过因特网连接访问的网络应用程序和/或网站处；等等)，和/或以任何其它合适的方式提供调查。
附加地或可替代地，处理补充数据可以包括处理传感器数据(例如，阑尾相关设备的传感器、可穿戴计算设备、移动设备；与使用者相关联的生物识别传感器，例如使用者智能手机的生物识别传感器；等等)。传感器数据可以包括以下的一项或多项：体育锻炼和/或与身体行动相关的数据(例如，加速度计数据、陀螺仪数据、位置传感器数据，例如gps数据和/或来自一个或多个设备的其它移动性传感器数据，例如移动设备和/或可穿戴电子设备，等等)，描述环境因素的传感器数据(例如温度数据、海拔数据、气候数据、光照参数数据、压力数据、空气质量数据，等等)、生物识别传感器数据(例如，血压数据；温度数据；与肿胀相关联的压力数据；心率传感器数据；指纹传感器数据；光学传感器数据，例如面部图像和/或视频；通过移动设备的传感器记录的数据；通过可穿戴设备或其它外围设备记录的数据，等等)、和/或与传感器相关联的任何其它合适的数据。附加地或可替代地，传感器数据可以包括在以下的一处或多处采样的数据：光学传感器(例如，图像传感器、光传感器、照相机，等等)、音频传感器(例如，麦克风，等等)、温度传感器、挥发性化合物传感器、空气质量传感器、重量传感器、湿度传感器、深度传感器、位置传感器(gps接收器；信标；室内定位系统；指南针，等等)、运动传感器(例如，加速器、陀螺仪、磁力计、由使用者佩戴的设备而集成的运动传感器)、生物识别传感器(例如，用于监测心率的心率传感器、指纹传感器、面部识别传感器，生物阻抗传感器，等等)，压力传感器、接近传感器(例如，用于监测运动和/或与使用者阑尾期间相关联的第三方对象的其他方面；等等)、流量传感器、功率传感器(例如，霍尔效应传感器)、与虚拟现实相关的传感器、与增强现实相关的传感器和/或任何其它合适的类型传感器。
附加地和可替代地，补充数据可以包括医疗记录数据和/或临床数据。这样，补充数据集的部分可以衍生自一个或多个电子健康记录(ehr)。附加地或可替代地，补充数据可以包括任何其它合适的诊断信息(例如，临床诊断信息)。任何合适的补充数据(例如，以提取的补充特征的形式等)可以与微生物组特征和/或其它合适的数据组合和/或用于执行方法100和/或系统200的实施例的部分(例如，执行表征处理等)。例如，与计算机断层扫描(ct扫描)、超声、结肠镜检查、活检、验血、腹部检查(例如，以检测炎症，等等)、验尿(例如，以检测感染，等等)、诊断成像、与阑尾相关病症相关联的其它合适的诊断程序、调查相关信息和/或任何其它合适的测试相关联(例如，衍生自)的补充数据可以用来补充(例如，用于方法100和/或系统200的实施例的任何合适部分)。
附加地或可替代地，补充数据可以包括治疗相关数据，包括以下的一项或多项：治疗方案、治疗类型、推荐治疗、使用者使用的治疗、治疗依从性和/或其其它治疗相关的合适数据。例如，补充数据可以包括与一种或多种治疗(例如，推荐治疗，等等)相关的使用者依从性度量(例如，药物依从性、益生菌依从性、体育锻炼依从性、饮食依从性等)。然而，处理补充数据可以以任何合适的方式执行。
4.3执行表征处理。
方法100的实施例可以包括区块s130，所述区块s130可以包括执行与一种或多种阑尾相关病症相关联的表征处理(例如，预处理；特征生成；特征处理；部位特定表征，例如特定于一个或多个特定身体部位的表征，例如对应于身体部位的采集部位处采集的样本，例如多个身体部位的多部位表征；多个阑尾相关病症的交叉病症分析；模型生成，等等)，例如基于微生物数据集(例如，衍生自区块s110，等等)和/或其它合适的数据(例如，补充数据集；等等)s130。区块s130可基于使用者微生物组组成(例如，微生物组组成多样性特征等)、功能(例如微生物组功能多样性特征等)和/或其它合适的微生物组特征(例如通过生成和应用表征模型，用于确定阑尾相关表征等)，用于识别、确定、提取和/或以其它方式处理可用于确定使用者或一组使用者阑尾相关表征的特征和/或特征组合。这样，表征处理可以用作诊断工具，可以基于微生物组组成和/或与一个或多个健康状况状态(例如，阑尾相关病症的状态)、行为特征、医学病症、人口统计学特征和/或任何其它合适的特征相关的功能特征来表征受试者。这样的表征可以用于确定、推荐和/或提供治疗(例如，如通过治疗模型等确定的个性化治疗)，和/或以其它方式促进治疗干预。
执行表征处理s130可以包括预处理微生物数据集、微生物组特征和/或其它合适的数据，以促进下游处理(例如，确定阑尾相关表征，等等)。在一示例中，执行表征处理可以包括：过滤微生物数据集(例如，过滤微生物序列数据集，例如在使用一套分析技术确定微生物组特征之前，等等)，通过以下的至少一项：a)去除与一组生物样本的第一样本离群值对应的第一样本数据(例如，与一种或多种阑尾相关病症相关联的，等等)，例如通过主成分分析、降维技术和多变量方法中的至少一项，确定第一样本离群值；b)去除与该组生物样本的第二样本离群值对应的第二样本数据，其中基于该组微生物组特征的对应数据质量，可以确定第二样本离群值(例如，在阈值条件以下，去除与具有高质量数据的一些微生物组特征对应的样本，等等)；c)基于微生物组特征的样本数不满足阈值样本数条件的样本数，从微生物组特征中去除一个或多个微生物组特征，其中样本数与微生物组特征的高质量数据相关联的一些样本对应。然而，可以使用任何合适的方式，利用分析技术执行预处理。
在执行表征处理中，区块s130可以使用计算方法(例如统计方法、机器学习方法、人工智能方法、生物信息学方法等)将受试者表征为展示一种或多种阑尾相关病症(例如，具有一种或多种阑尾相关病症的一组使用者的特征，等等)相关联的特征(例如，在确定使用者微生物组特征的情况下，可以包括通过表征处理，识别微生物组特征的特征值，所述表征处理与一种或多种阑尾相关病症相关或以其它方式相关联，等等)。
如图3所示，执行表征处理可以包括例如通过应用一种或多种分析技术，确定与一种或多种阑尾相关病症相关联的一种或多种微生物组特征(例如，确定与一种或多种阑尾相关病症最相关的微生物组特征；确定使用者微生物组特征，例如，使用者对应于所识别的微生物组特征的微生物组特征的存在、不存在和/或值等，其中所识别的微生物组特征与一种或多种阑尾相关病症相关联)。在一示例中，确定微生物组特征(例如，微生物组组成特征、微生物组功能特征，等等)可以应用一组分析技术，包括单变量统计检验，多变量统计检验、降维技术和人工智能方法中的至少一种，例如基于微生物数据集(例如微生物序列数据集等)，并且其中的微生物组特征可以配置为改进与计算系统相关的功能，所述功能与为使用者确定阑尾相关病症相关联(例如，与准确性、减少错误、处理速度、缩放比例相关等)。在一个示例中，确定微生物组特征(例如，使用者微生物组特征，等等)可以包括应用一组分析技术，确定微生物组组成多样性特征和微生物功能多样性特征中的至少一个的存在、微生物组组成多样性特征和微生物组功能多样性特征中的至少一个的不存在、描述与第一阑尾相关病症相关联的不同分类组的相对丰度的相对丰度特征、描述至少两种微生物组特征之间比例的比例特征、描述不同分类组之间相互作用的相互作用特征、描述不同分类组之间系统发育距离的系统发育距离特征中的至少一种，例如基于微生物数据集，以及其中该组分析技术可以包括单变量统计检验、多变量统计检验、降维技术和人工智能方法。
在变体中，一旦识别出与生物样本相关联的微生物组的微生物代表性组，就可以执行生成与生物样本相关联的微生物组组成和功能方面相关联(例如，衍生自)的特征。在一个变体中，生成特征可以包括基于多位点序列分型(mslt)生成特征，以便识别可用于方法100的后续区块中表征的标记物。附加地或可替代地，生成特征可以包括生成描述某些微生物分类组存在或不存在、和/或所显示的微生物分类组之间的比例的特征。附加地或可替代地，生成特征可以包括生成描述一项或多项的特征：代表性分类组的数量、代表性分类组的网络、不同分类组代表性的相关性、不同分类组之间的相互作用、不同分类组产生的产物、不同分类组产生的产物之间的相互作用、死微生物和活微生物之间的比例(例如，基于rna分析，对于不同的代表性分类组)，系统发育距离(例如，根据kantorovich-rubinstein距离、wasserstein距离，等等)、任何其它合适的分类组相关的特征、任何其它合适的遗传或功能方面。
附加地或可替代地，生成特征可以包括生成描述不同微生物组相对丰度的特征，例如，使用sparcc方法、使用基因组相对丰度和平均大小(genomerelativeabundanceandaveragesize，gaas)方法和/或使用混合模型理论的基因组相对丰度(genomerelativeabundanceusingmixturemodeltheory，grammy)方法，所述方法使用序列相似性数据对一组或多组微生物的相对丰度进行最大似然估计。附加地或可替代地，生成特征可以包括生成衍生自丰度度量的分类学变化的统计量度。附加地或可替代地，生成特征可以包括生成与相对丰度因子相关联(例如，衍生自)的特征(例如，与一个分类单元的丰度变化相关的，其影响其他分类单元的丰度)。附加地或可替代地，生成特征可以包括生成描述一个或多个分类组以孤立和/或组合的形式存在的定性特征。附加地或可替代地，生成特征可以包括表征微生物组(其与生物样本相关联)的微生物的遗传标记物(例如，代表性的16s，18s和/或its序列)相关的特征生成。附加地或可替代地，生成特征可以包括与特定基因和/或具有特定基因的生物功能性关联相关的特征生成。附加地或可替代地，生成特征可以包括与分类单元和/或归因于分类单元的产物的致病性相关的特征生成。然而，区块s130可以包括确定衍生自生物样本核酸的测序和映射的任何其它合适的特征确定。例如，一种或多种特征可以是组合的(例如，涉及两个一组、三个一组)、相关的(例如，与不同特征之间的相关性相关)和/或与特征的变化(例如，时间变化、跨样本部位的变化等、空间变化等)相关。然而，可以任何合适的方式来确定微生物组特征。
在变体中，执行表征处理可以包括执行与多个采集部位相关联的一个或多个多部位分析(例如，使用阑尾相关表征模型；生成多部位表征，等等)，例如基于一组部位特定特征，执行阑尾相关表征，所述部位特定特征包括与第一身体部位相关联的部位特定特征的第一子集，和与第二身体部位相关联的部位特定特征的第二子集。然而，可以以任何合适的方式执行多部位分析。
在变体中，执行表征处理可以包括针对多个阑尾相关病症执行一个或多个交叉病症分析(例如，使用阑尾相关表征模型等)。在一示例中，执行交叉病症分析可以包括基于一种或多种分析技术，确定与多种阑尾相关病症(例如，第一阑尾相关病症和第二阑尾相关病症等)相关联的一组交叉病症特征(例如，作为确定微生物组特征的一部分等)，其中确定阑尾相关表征可以包括基于一个或多个阑尾相关表征模型，为使用者确定多种阑尾相关病症(例如第一和第二阑尾相关病症等)的阑尾相关表征，以及该组交叉病症特征被配置为改善计算系统相关功能，所述功能与为使用者确定多种阑尾相关病症的阑尾相关表征相关联。执行交叉病症分析可以包括确定交叉病症的相关度量(例如，与不同阑尾相关病症相对应的数据之间的相关性和/或协方差，等等)和/或与交叉病症分析相关联的其他合适的度量。然而，可以以任何合适的方式执行交叉病症分析。
在一变体中，表征可以基于与显示目标状态(例如，阑尾相关病症)的第一组受试者和未显示目标状态(例如，“正常”状态)的第二组受试者之间的相似性和/或差异性的统计分析(例如，概率分布的分析)相关联(例如，衍生自)的特征。在实施该变体中，可以使用kolmogorov-smirnov(ks)检验、置换检验、cramér-vonmises检验、其它任何统计检验(例如t检验、z检验、卡方检验、与分布相关联的检验等)和/或其它合适的分析技术中的一种或多种。特别地，可以使用一个或多个这样的统计假设检验来评估在表现出目标状态(例如，生病状态)的第一组受试者和不表现出目标状态(例如，具有正常状态)的第二组受试者中具有不同丰度的特征集。。更详细地，可以基于与第一组受试者和第二组受试者相关联的丰度百分比和/或与多样性有关的任何其它合适的参数，来约束所评估的该组特征，以增加或降低表征的置信度。在该示例的特定实施中，特征可以衍生自细菌的分类单元，该细菌的分类单元在一定比例的第一组受试者和第二组受试者中是丰富的，其中第一组受试者和第二组受试者之间的分类单元的相对丰度可以通过ks检验确定，并且具有显著性指示(例如，以p值表示)。因此，区块s130的输出可以包括具有显著性指示(例如，p值为0.0013)的标准化的相对丰度值(例如，在患病受试者与健康受试者之间，患有阑尾相关病症的受试者与没患有阑尾相关病症的受试者相比，丰度提高了25％)。特征生成的变体可以附加地或可替代地实施，或衍生自其功能特征或元数据特征(例如，非细菌标记物)。附加地或可替代地，可以基于统计分析(例如，应用于微生物序列数据集和/或其它合适的微生物数据集等)，衍生任何合适的微生物组特征，所述统计分析包括以下的任何一项或多项：预测分析、多假设检验、随机森林测试、主成分分析和/或其它合适的分析技术。
在执行表征处理中，区块s130可以附加地或可替代地将输入数据从微生物组组成多样性数据集和微生物功能多样性数据集中的至少一个转换成特征向量，该特征向量可以被测试，用于预测受试者群体的表征的功效。来自补充数据集的数据可用于提供一组表征的一个或多个表征的指示，其中表征处理使用候选特征和候选分类的训练数据集进行训练，以识别以识别具有高度特征的特征和/或特征组合(或低度)预测能力，以准确地预测分类。。这样，利用训练数据集的表征处理的细化，识别与受试者的特定分类具有高度相关性的特征集(例如，受试者特征、特征组合的)。
在一种变体中，有效地预测表征处理分类的特征向量(和/或任何合适的特征组)可以包括与一项或多项相关的特征：微生物组多样性度量(例如，与跨生物分类组的分布相关、与在古细菌、细菌、病毒和/或真核生物群组的分布相关)、一微生物组中生物分类组的存在、一微生物组中特定遗传序列(例如16s序列)的表示、一微生物组中生物分类组的相对丰富度、微生物组抗逆性指数(例如，与从补充数据集而确定的扰动(perturbation)相应)、编码具有给定功能的蛋白质或rna(酶、转运蛋白、免疫系统中的蛋白质、激素、干扰rna等)的基因丰度、以及与微生物组多样性数据集和/或补充数据集相关联(例如，衍生自)的其它合适特征。在变体中，微生物组特征可以与至少一项相关联(例如，包括、对应、代表等)：来自微生物组特征(例如，使用者微生物组特征等)的微生物组特征的存在、来自该微生物组特征的微生物组特征的不存在、与阑尾相关病症相关联的不同分类组的相对丰度；与不同分类组相关联的至少两项微生物组特征之间的比例、不同分类组之间的相互作用、以及不同分类组之间的系统发育距离。在一特定示例中，微生物组特征可以包括与微生物组组成多样性特征(例如，与不同分类单元相关联的相对丰度等)和微生物组功能多样性特征(例如对应于不同功能特征的序列的相对丰度；等等)中的至少一项相关联的相对丰度特征。相对丰度特征和/或其它合适的微生物组特征(和/或本文所述的其它合适的数据)可以基于以下各项进行提取和/或以其它方式确定：归一化、衍生自线性潜变量分析和非线性潜变量分析中的至少一项的特征向量、线性回归、非线性回归、核方法、特征嵌入方法、机器学习方法、统计推断方法和/或其它合适的分析技术。附加地或可替代地，可以在特征向量中使用特征的组合，其中可以对特征进行分组和/或加权，以提供组合特征作为特征集的一部分。例如，一项特征或特征集可以包括以下项的加权组合：一微生物组中的代表性细菌纲的数量、一微生物组中的细菌特定属的存在、一微生物组中特定16s序列的表示、以及第一门细菌高于第二门细菌的相对丰度。然而，可以附加地或可替代地以任何其它合适的方式确定特征向量。
在一变体中，可以根据随机森林预测器(rfp)算法生成和训练表征处理，所述算法将套袋(bagging)(例如，引导聚合)和从训练数据集中随机选择的特征集进行组合，以构建决策树t，其与随机特征集相关联。在使用随机森林算法时，从决策树集中随机抽取n个案例进行替换，以创建决策树的子集，并且对于每个节点，从所有预测特征中选择m个预测特征进行评估。在节点处(例如，根据目标函数)提供最佳分割(split)的预测特征，用于执行分割(例如，在节点处为分叉，在节点处为三叉)。通过从一个大的数据集中多次采样，表征处理的强度在识别在预测分类中很强的特征时，可以大幅地提高。在该变体中，可以在处理期间包括防止偏差(例如，采样偏差)和/或解决偏差量的措施，例如以增加模型的稳健性。
在一变体中，方法100的实施例的区块s130和/或其它部分可以包括将计算机实施规则(computer-implementedrule)(例如，模型、特征选择规则，等等)应用于处理人口水平的数据，然而可以附加地或可替代地包括将计算机实施规则，应用于处理微生物组相关数据，在人口特征特定基础(例如，共享一种或多种人口统计学特征的亚组，例如治疗方案、饮食方案、体育锻炼方案、种族、年龄、性别、体重、行为，等等)、特定病症的基础(例如，显示特定阑尾相关病症的亚组、阑尾相关病症的组合、阑尾相关病症的触发因素、相关症状，等等)、特定类型样本基础(例如，应用不同的计算机实施规则来处理衍生自不同采集部位的微生物组数据，等等)、使用者基础(例如，针对不同使用者的不同计算机执行的规则；等等)、和/或任何其它合适的基础上。这样，区块s130可以包括将使用者群体中的使用者分配给一个或多个亚组；并且应用不同的计算机实施规则来确定不同亚组的特征(例如，使用该组特征类型；根据特征生成的表征模型的类型；等等)。然而，可以以任何合适的方式，执行应用计算机实施规则。
在另一变体中，区块s130可以包括处理(例如，生成、训练、更新、执行、存储，等等)一种或多种阑尾相关病症(例如，用于为使用者输出描述与阑尾相关病症相关的使用者微生物组特征的表征；用于针对一种或多种阑尾相关病症输出治疗确定的治疗模型；等等)的一个或多个阑尾相关表征模型(例如，阑尾相关病症模型、治疗模型，等等)。表征模型优选地利用微生物组特征作为输入，并且优选地输出阑尾相关表征和/或其任何合适的组件，然而表征模型可以使用任何合适的输入，以生成任何合适的输出。在一示例中，区块s130可以包括针对一种或多种阑尾相关病症，将补充数据、微生物组组成多样性特征和微生物组功能多样性特征、其它微生物组特征、阑尾相关表征模型的输出和/或其它合适的数据，转换成一个或多个表征模型(例如，基于补充数据和微生物组特征，训练阑尾相关表征模型；等等)。在另一示例中，方法100可以包括：基于来自使用者群体的一组样本(和/或基于与阑尾相关病症相关联的一种或多种引物类型；等等)，为与一种或多种阑尾相关病症相关联的使用者群体确定种群微生物序列数据集(例如，包括该群体的不同使用者的微生物序列输出；等等)；采集受试者群体的一种或多种阑尾相关疾病的诊断相关联的补充数据集；和基于群微生物序列数据集和补充数据集，生成阑尾相关表征模型。在一示例中，方法100可以包括基于来自使用者的样本，为使用者确定一组使用者微生物组特征，其中该组使用者微生物组特征与一组受试者相关联的微生物组特征(例如，基于处理生物学样本，所述样本对应于与一种或多种阑尾相关病症相关联一组受试者，确定微生物组特征与一种或多种阑尾相关病症相关联；一组微生物组组成特征和该组微生物组功能特征；等等)相关联；确定阑尾相关表征，包括基于治疗模型和该组使用者微生物组特征，为使用者确定一种或多种阑尾相关病症的治疗；提供治疗(例如，在与使用者相关联的计算设备上，向使用者提供治疗建议，等等)和/或以其它方式促进治疗干预。
在另一变体中，如图8a-8b所示，可以生成不同的阑尾相关表征模型和/或其它合适的模型(例如，用不同的算法、不同的特征集、不同的输入和/或输出类型生成，以不同的方式应用，例如与时间、频率、应用模型的组件相关，等等)，针对不同的阑尾相关病症、不同的使用者人口统计学特征(例如，基于年龄、性别、体重、身高、种族)、不同的身体部位(例如，肠道部位模型、鼻部位模型、皮肤部位模型、口腔部位模型、生殖器部位模型等)、个体使用者、补充数据(例如，合并微生物组特征、阑尾相关病症和/或其它合适的组件的先前知识的模型；与生物识别传感器数据和/或调查响应数据相关联的特征对比独立于补充数据的模型等)、和/或其它合适的标准。在一特定示例中，方法100可以包括采集与第一身体部位(例如，肠道部位；通过使用者在第一身体部位对应的身体采集部位处采集的样本；一处或多处合适的身体部位；等等)相关联的第一部位特定样本；基于部位特定样本，确定微生物数据集；基于该微生物数据集，确定第一部位特定微生物组特征(例如，部位特定的组合特征；部位特定的功能特征；与阑尾相关的病症相关的而在本文所述的合适的微生物组特征；与第一身体部位相关联的特征；等等)，基于第一部位特定微生物组特征，确定第一部位特定的阑尾相关表征模型(例如，肠道部位特定的阑尾相关表征模型；等等)；和基于该第一部位特定的阑尾相关表征模型，为使用者确定阑尾相关病症的相关病症(例如，使用第一部位特定的阑尾相关表征模型来处理使用者微生物组特征，例如使用者部位特定的微生物组特征，基于使用者样本而衍生，所述样本在第一身体部位对应的使用者身体采集部位处采集；等等)。在一特定示例中，方法100可以包括采集与第二身体部位(例如，皮肤部位、生殖器部位、口腔部位和鼻部位中的至少一处；一处或多处合适的身体部位；等等)相关联的第二部位特定样本；确定第二部位特定的微生物组特征(例如，部位特定的组成特征；部位特定的功能特征；与第二身体部位相关联的特征；等等)；基于第二部位特定的组成特征，生成第二部位特定的阑尾相关表征模型(例如，与第二身体部位相关联的；等等)；从附加的使用者采集使用者样本，该使用者样本与第二身体部位相关联(例如，通过附加的使用者在与第二身体部位对应的采集部位处采集；等等)；以及基于第二部位特定的阑尾相关表征模型(例如，从一组部位特定的阑尾相关表征模型中，基于使用者样本和身体部位之间的关联，选择第二部位特定的阑尾相关表征模型应用，例如，基于使用者皮肤采集部位采集的使用者样本为基础，选择特定皮肤部位的阑尾相关表征模型应用；等等)，为附加的使用者确定阑尾相关病症的附加的相关表征。
在变体中，确定阑尾相关表征和/或任何其它合适的表征可以包括确定部位特定的阑尾相关表征(例如，部位特定的分析)，所述部位特定的阑尾相关表征包括与特定身体部位(例如，肠道、健康的肠道、皮肤、鼻、口腔、生殖器、其它合适的身体部位、其它样本采集部位，等等)相关的阑尾相关表征，例如通过以下的任意一项或多项：基于阑尾相关表征模型，所述模型衍生自部位特定的数据，确定阑尾相关表征(例如，定义阑尾相关病症和一处或多处身体部位相关联的微生物组特征之间的相关性)；基于一处或多处身体部位采集的使用者生物样本和/或任何其它合适的相关部位的处理，确定阑尾相关表征。在示例中，机器学习方法(例如，分类器、深度学习算法、svm，随机森林)、参数优化方法(例如，贝叶斯参数优化)、验证方法(例如，交叉验证方法)、统计检验(例如，单变量统计技术、多变量统计技术、相关性分析，例如典型相关性分析，等等)、降维技术(例如pca)和/或其它合适的分析技术(例如本文所述的)，可以应用于确定部位相关(例如，身体部位相关的等)表征(例如，使用针对一处或多处样本采集部位的一种或多种方法，例如，针对每种类型的样本采集部位，等等)、其它合适的表征、治疗和/或任何其它合适的输出。在一特定示例中，执行表征处理(例如，确定阑尾相关表征；确定微生物组特征；基于阑尾相关表征模型；等等)可以包括应用以下的至少一种：机器学习方法、参数优化方法、统计检验、降维方法和/或其它合适的方法(例如，其中微生物组特征，例如一组微生物组组成多样性特征和/或一组微生物组功能多样性特征，可以与至少在以下至少一处采集的微生物相关联：肠道部位、皮肤部位、鼻部位、口腔部位、生殖器部位等)。在另一具体示例中，对多个样本采集部位执行的表征处理可以用于生成个体表征，这些表征可以组合起来以确定总体表征(例如，总体微生物组评分、例如针对本文所述的一种或多种病症等)。然而，方法100可以包括确定任何合适的部位相关的(例如，部位特定的)输出，和/或以任何合适的方式，利用部位特定和/或其它部位的相关性执行方法100实施例的任何合适的部分(例如，采集样本、处理样本、确定治疗)。
受试者的表征可以附加地或可替代地实施高假阳性测试和/或高假阴性测试的使用，以促进分析表征处理的敏感性，以支持根据方法100的实施例生成的分析。然而，可以以任何合适的方式，执行一个或多个表征处理s130。
4.3.a阑尾相关表征处理。
执行表征处理s130可以包括执行阑尾相关表征处理s135(例如，确定一种或多种阑尾相关病症的表征；确定和/或应用一种或多种阑尾相关表征模型；等等)，例如为一个或多个使用者(例如，来自一组受试者的样本对应的数据，用于生成一种或多种阑尾相关表征模型，例如其中一个或多个受试者与阑尾相关病症相关联，例如被诊断患有一种或种阑尾相关的病症的受试者；例如，通过使用一种或多种阑尾相关表征模型，例如通过将一种或多种阑尾相关表征模型，例如通过将一种或多种阑尾相关表征模型应用于使用者微生物组序列数据集，所述数据集衍生自对使用者的样本进行的测序，为单个使用者生成该使用者的阑尾相关表征；等)和/或针对一种或多种阑尾相关病症。
在变体中，执行阑尾相关表征处理可以包括确定一种或多种阑尾相关病症相关联的微生物组特征。在一示例中，执行阑尾相关表征处理可以包括应用一种或多种分析技术(例如统计分析)，以识别微生物组特征集(例如，微生物组组成特征、微生物组组成多样性特征、微生物组功能特征、微生物组功能多样性特征，等等)，所述微生物组特征集与一种或多种阑尾相关病症(例如，与单个阑尾相关病症相关联的特征、与多个阑尾相关病症相关联的交叉病症特征和/或其它合适的阑尾相关病症等)具有最高相关性(例如，正相关、负相关等)。在一特定示例中，确定一组微生物组特征(例如，与一种或多种阑尾相关病症相关联和/或以其它方式相关联的；用于生成一种或多种阑尾相关表征模型，等等)可以包括基于微生物序列数据，应用一组分析技术，以确定以下至少一项：微生物组组成多样性特征和微生物功能多样性特征中至少一项的存在、微生物组组成多样性特征和微生物功能多样性特征中至少一项的不存在、描述与阑尾相关病症相关联的不同分类组的相对丰度的相对丰度特征、描述与不同分类组相关联的至少两个微生物组特征之间比例的比例特征、描述不同分类组之间相互作用的相互作用特征、以及描述不同分类组之间系统发育距离的系统发育距离特征，和/或其中该组分析技术可以包括单变量统计检验、多变量统计检验、降维技术和人工智能方法中的至少一种。
在一特定示例中，执行阑尾相关表征处理可以促进一种或多种阑尾相关病症的治疗干预，例如通过促进治疗相关联的干预，所述治疗对与一种或多种阑尾相关病症相关的一个或多个使用者的状态具有积极影响。在另一特定示例中，执行阑尾相关表征处理(例如，确定与一种或多种阑尾相关病症具有最高相关性的特征等)，可以基于随机森林预测算法，所述算法利用衍生自受试者群体的子集(例如，患有一种或多种阑尾相关病症的受试者；不具有一种或多种阑尾相关病症的受试者；等等)的训练数据集而进行训练，和利用衍生自受试者群体的子集的验证数据集而进行验证。然而，可以以任何合适的方式来确定一种或多种阑尾相关病症相关联的微生物组特征和/或其它合适的方面。
在变体中，执行阑尾相关表征处理可以包括执行阑尾相关病症的阑尾相关表征处理，所述阑尾相关病症包括阑尾(例如，切除的阑尾；等等)的不存在和/或与阑尾相关联的炎症(例如，阑尾炎；靠近阑尾区域的大肠部分的炎症；等等)。在示例中，执行阑尾相关表征处理可以包括识别与阑尾的不存在和/或与阑尾相关联的炎症(和/或其它合适的阑尾相关病症，例如一种或多种治疗会产生积极效果的阑尾相关病症)相关的(例如，具有最高相关性、正相关、负相关等)微生物组特征，基于随机森林预测算法，所述算法利用衍生自受试者群体的子集的训练数据集进行训练，和利用衍生自受试者群体的子集中的验证数据集进行验证。在特定示例中，阑尾相关的病症可以包括通过验血、验尿、诊断性成像检查(例如超声、ct扫描，等等)和/或其它合适的诊断程序(例如，本文所述的，等等)中的一项或多项而可表征(例如，可诊断的)的病症。
与一种或多种阑尾相关病症相关联(例如，正相关；负相关；对诊断有用；等等)的微生物组特征(例如，微生物组组成特征；与一处或多处身体部位相关联的部位特定的组成特征；微生物组功能特征；与一处或多处身体部位相关联的部位特定的功能特征；等等)可以包括与以下的一个或多个分类单元(例如，描述丰度的特征；描述相对丰度的特征；描述功能方面相关联的特征；其所衍生自特征；描述存在和/或不存在的特征；等等)的任何组合相关联的特征，例如与一处或多处身体部位相关的(例如其中微生物组组成特征可以包括与一处或多处身体部位相关联的部位特定的组成特征，例如其中组成特征和一种或多种阑尾相关病症之间的相关性可以特定于一处或多处身体部位，例如，特定于在身体部位观察到的微生物组组成，该微生物组成从该身体部位对应的身体采集部位处采集的样本中得到；等等)：孪生球菌属(gemella)(属)(例如，生殖器部位)、非典型性韦荣氏菌(veillonellaatypica)(种)(例如，生殖器部位)、害肺小杆菌(dialisterpneumosintes)(种)(例如，生殖器部位)、弯曲乳杆菌(lactobacilluscrispatus)(种)(例如，生殖器部位)、叶杆菌科(phyllobacteriaceae)(科)(例如，生殖器部位)、水小杆菌属(aquabacterium)(属)(例如，生殖器部位)，厌氧菌(属)(例如，生殖器部位)、双生厌氧菌(种)(例如，生殖器部位)、苍白杆菌属(ochrobactrum)(属)(例如，生殖器部位)、克氏动弯杆菌(mobiluncuscurtisii)(种)(例如，生殖器部位)、纽氏放线菌(actinomycesneuii)(种)(例如，生殖器部位)、解乳厌氧球菌(anaerococcuslactolyticus)(种)(例如，生殖器部位)、约氏乳杆菌(lactobacillusjohnsonii)(种)(例如，生殖器部位)、疣微菌目(verrucomicrobiales)(目)(例如，生殖器部位)、疣微菌门(verrucomicrobia)(门)(例如，生殖器部位)、疣微菌纲(verrucomicrobiae)(纲)(例如，生殖器部位)、疣微菌科(verrucomicrobiaceae)(科)(例如，生殖器部位)、解琥珀酸菌(种)(例如，生殖器部位)、奇异菌属f0209(atopobiumsp.f0209)(种)(例如，生殖器部位)、费氏棒状杆菌(corynebacteriumfreiburgense)(种)(例如，生殖器部位)、乳杆菌属akhmro1(lactobacillussp.akhmro1)(种)(例如，生殖器部位)、厌氧球菌9401487(anaerococcussp.9401487)(种)(例如，生殖器部位)、中生根瘤菌属(mesorhizobium)(属)(例如，生殖器部位)、罗伊氏乳杆菌(lactobacillusreuteri)(种)(例如，生殖器部位)、巨球型菌属upii199-6(megasphaerasp.upii199-6)(种)(例如，生殖器部位)、乳杆菌属c30an8(lactobacillussp.c30an8)(种)(例如，生殖器部位)、消化球菌属s9pr-12(peptococcussp.s9pr-12)(种)(例如，生殖器部位)、海链球菌(种)(例如，生殖器部位)、奈瑟球菌科(neisseriaceae)(科)(例如，肠道部位)、粘液奈瑟球菌(neisseriamucosa)(种)(例如，肠道部位)、嗜性聚集杆菌(aggregatibacteraphrophilus)(种)(例如，肠道部位)、单形拟杆菌(bacteroidesuniformis)(种)(例如，肠道部位)、普通拟杆菌(bacteroidesvulgatus)(种)(例如，肠道部位)、狄氏副拟杆菌(parabacteroidesdistasonis)(种)(例如，肠道部位)、巨球型菌属(megasphaera)(属)(例如，肠道部位)、变形杆菌门(proteobacteria)(门)(例如，肠道部位)、微球菌科(micrococcaceae)(科)(例如，肠道部位)、嗜热链球菌(streptococcusthermophilus)(种)(例如，肠道部位)、副血链球菌(streptococcusparasanguinis)(种)(例如，肠道部位)、孪生球菌属(gemella)(属)(例如，肠道部位)、梭菌属(clostridium)(属)(例如，肠道部位)、龋齿放线菌(actinomycesodontolyticus)(种)(例如，肠道部位)、放线菌目(actinomycetales)(目)(例如，肠道部位)、放线菌科(actinomycetaceae)(科)(例如，肠道部位)、β-变形杆菌纲(betaproteobacteria)(纲)(例如，肠道部位)、麻疹孪生球菌(gemellamorbillorum)(种)(例如，肠道部位)、罗思氏菌属(rothia)(属)(例如，肠道部位)、弯曲乳杆菌(lactobacilluscrispatus)(种)(例如，肠道部位)、假单胞菌目(pseudomonadales)(目)(例如，肠道部位)、草酸杆菌科(oxalobacteraceae)(科)(例如，肠道部位)、伯克霍尔德氏菌目(burkholderiales)(目)(例如，肠道部位)、孪生球菌属933-88(gemellasp.933-88)(种)(例如，肠道部位)、微球菌目(micrococcales)(目)(例如，肠道部位)、产酸拟杆菌(bacteroidesacidifaciens)(种)(例如，肠道部位)、艰难杆菌属(mogibacterium)(属)(例如，肠道部位)、拟杆菌属ar20(bacteroidessp.ar20)(种)(例如，肠道部位)、拟杆菌属ar29(bacteroidessp.ar29)(种)(例如，肠道部位)、伯克霍尔德氏菌科(burkholderiaceae)(科)(例如，肠道部位)，丹毒丝菌科(erysipelotrichaceae)(科)(例如，肠道部位)、黄色单胞菌目(xanthomonadales)(目)(例如，肠道部位)、假单胞菌科(pseudomonadaceae)(科)(例如，肠道部位)、放线菌属口腔株hal-1065(actinomycessp.oralstrainhal-1065)(种)(例如，肠道部位)、肠道罗斯拜瑞氏菌(roseburiaintestinalis)(种)(例如，肠道部位)、紫单胞菌科(porphyromonadaceae)(科)(例如，肠道部位)、沙特尔沃思菌属(shuttleworthia)(属)(例如，肠道部位)、梭菌纲(clostridia)(纲)(例如，肠道部位)、梭菌目(clostridiales)(目)(例如，肠道部位)、消化链球菌科(peptostreptococcaceae)(科)(例如，肠道部位)、消化球菌科(peptococcaceae)(科)(例如，肠道部位)、肉杆菌科(carnobacteriaceae)(科)(例如，肠道部位)、小杆菌属e2_20(dialistersp.e2_20)(种)(例如，肠道部位)、奈瑟球菌目(neisseriales)(目)(例如，肠道部位)、巨球型菌属c1(megasphaeragenomosp.cl)(种)(例如，肠道部位)、moryella(属)(例如，肠道部位)、互养菌门(synergistetes)(门)(例如，肠道部位)、丹毒丝菌纲(erysipelotrichia)(纲)(例如，肠道部位)、丹毒丝菌目(erysipelotrichales)(目)(例如，肠道部位)、梭菌目科xiii.未知种(clostridialesfamilyxiii.incertaesedis)(科)(例如，肠道部位)、罗斯拜瑞氏菌属11se39(roseburiasp.11se39)(种)(例如，肠道部位)、拟杆菌属d22(bacteroidessp.d22)(种)(例如，肠道部位)、互养菌纲(synergistia)(纲)(例如，肠道部位)、互养菌目(synergistales)(目)(例如，肠道部位)、互养菌科(synergistaceae)(科)(例如，肠道部位)、乳杆菌属tab-22(lactobacillussp.tab-22)(种)(例如，肠道部位)、黄杆菌属(flavonifractor)(属)(例如，肠道部位)、萨特菌科(sutterellaceae)(科)(例如，肠道部位)、厌氧棒状菌属5_1_63faa(anaerostipessp.5_1_63faa)(种)(例如，肠道部位)、链球菌属2011_oral_ms_a3(streptococcussp.2011_oral_ms_a3)(种)(例如，肠道部位)、韦荣氏菌属2011_oral_vsa_d3(veillonellasp.2011_oral_vsa_d3)(种)(例如，肠道部位)、大芬戈尔德菌属s9aa1-5(finegoldiasp.s9aa1-5)(种)(例如，肠道部位)、弗氏杆菌属(fretibacterium)(属)(例如，肠道部位)，葡萄球菌属3348o2(staphylococcussp.3348o2)(种)(例如，肠道部位)、消化梭菌(属)(例如，肠道部位)、肠杆菌属(intestinibacter)(属)(例如，肠道部位)、不动杆菌属(acinetobacter)(属)(例如，肠道部位)、克雷伯氏菌属(klebsiella)(属)(例如，肠道部位)、多形拟杆菌(bacteroidesthetaiotaomicron)(种)(例如，肠道部位)、丁酸弧菌属(butyrivibrio)(属)(例如，肠道部位)、坏疽梭杆菌(fusobacteriumnecrogenes)(种)(例如，肠道部位)、草螺菌属(herbaspirillum)(属)(例如，肠道部位)、织片草螺菌(herbaspirillumseropedicae)(种)(例如，肠道部位)、片球菌属(pediococcus)(属)(例如，肠道部位)、大芬戈尔德菌(finegoldiamagna)(种)(例如，肠道部位)、blautiahansenii(种)(例如，肠道部位)、粪肠球菌(enterococcusfaecalis)(种)(例如，肠道部位)、乳酸乳球菌(lactococcuslactis)(种)(例如，肠道部位)、芽孢杆菌属(bacillus)(属)(例如，肠道部位)、艰难梭菌(clostridioidesdifficile)(种)(例如，肠道部位)、blautiacoccoides(种)(例如，肠道部位)、多枝梭菌(erysipelatoclostridiumramosum)(种)(例如，肠道部位)、融合魏斯氏菌(weissellaconfusa)(种)(例如，肠道部位)、植物乳杆菌(lactobacillusplantarum)(种)(例如，肠道部位)、副干酪乳杆菌(lactobacillusparacasei)(种)(例如，肠道部位)、青春双歧杆菌(bifidobacteriumadolescentis)(种)(例如，肠道部位)、短双歧杆菌(bifidobacteriumbreve)(种)(例如，肠道部位)、齿双歧杆菌(bifidobacteriumdentium)(种)(例如，肠道部位)、动物双歧杆菌(bifidobacteriumanimalis)(种)(例如，肠道部位)、假小链双歧杆菌(bifidobacteriumpseudocatenulatum)(种)(例如，肠道部位)、卵形拟杆菌(bacteroidesovatus)(种)(例如，肠道部位)、蛋白胨泪菌(peptoniphiluslacrimalis)(种)(例如，肠道部位)、阴道厌氧球菌(anaerococcusvaginalis)(种)(例如，肠道部位)、拉恩氏菌属(rahnella)(属)(例如，肠道部位)、沃氏嗜胆菌(bilophilawadsworthia)(种)(例如，肠道部位)、sneathiasanguinegens(种)(例如，肠道部位)、解琥珀酸菌属(succiniclasticum)(属)(例如，肠道部位)、孢菌属(sporobacter)(属)(例如，肠道部位)、瘤胃假丁酸弧菌(pseudobutyrivibrioruminis)(种)(例如，肠道部位)、魏斯氏菌属(weissella)(属)(例如，肠道部位)、粪便拟杆菌(bacteroidesstercoris)(种)(例如，肠道部位)，鼠李糖乳杆菌(lactobacillusrhamnosus)(种)(例如，肠道部位)、泛菌属(pantoea)(属)(例如，肠道部位)、霍尔德曼氏菌属(holdemania)(属)(例如，肠道部位)、丝状霍尔德曼氏菌(holdemaniafiliformis)(种)(例如，肠道部位)、耐热厌氧细菌目(thermoanaerobacterales)(目)(例如，肠道部位)、没食子双歧杆菌(bifidobacteriumgallicum)(种)(例如，肠道部位)、白痢双歧杆菌(bifidobacteriumpullorum)(种)(例如，肠道部位)、明串珠菌科(leuconostocaceae)(科)(例如，肠道部位)、迟缓埃格特菌(eggerthellalenta)(种)(例如，肠道部位)、乳头状杆菌(属)(例如，肠道部位)、粪厌氧棒杆菌(anaerostipescaccae)(种)(例如，肠道部位)、pseudoflavonifractorcapillosus(种)(例如，肠道部位)、厌氧杆菌属(anaerovorax)(属)(例如，肠道部位)、八迭球菌属(parasporobacterium)(属)(例如，肠道部位)、少食八迭球菌(parasporobacteriumpaucivorans)(种)(例如，肠道部位)、颤螺菌属(oscillospira)(属)(例如，肠道部位)、吉氏颤螺菌(oscillospiraguilliermondii)(种)(例如，肠道部位)、放线菌图列茨亚种(种)(例如，肠道部位)、anaerosinus(属)(例如，肠道部位)、纤毛菌属(sneathia)(属)(例如，肠道部位)、少食短杆菌(brevibacteriumpaucivorans)(种)(例如，肠道部位)、乳杆菌属cr-609s(种)(例如，肠道部位)、耐热厌氧细菌科(thermoanaerobacteraceae)(科)(例如，肠道部位)、芽孢杆菌科(bacillaceae)(科)(例如，肠道部位)、gelria(属)(例如，肠道部位)、酸杆菌目(acidobacteriales)(目)(例如，肠道部位)、马赛拟杆菌(bacteroidesmassiliensis)(种)(例如，肠道部位)、红环菌目(rhodocyclales)(目)(例如，肠道部位)、人粪便厌氧菌(种)(例如，肠道部位)、alistipesfinegoldii(种)(例如，肠道部位)、颤螺菌科(oscillospiraceae)(科)(例如，肠道部位)、嗜胨菌属2002-38328(peptoniphilussp.2002-38328)(种)(例如，肠道部位)、hespellia(属)(例如，肠道部位)、拟杆菌属35ae37(bacteroidessp.35ae37)(种)(例如，肠道部位)、marvinbryantia(属)(例如，肠道部位)、运动厌氧芽孢杆菌(种)(例如，肠道部位)、厌氧菌(属)(例如，肠道部位)、卡他菌(属)(例如，肠道部位)、普氏黄曲霉(种)(例如，肠道部位)、嗜蛋白菌属(proteiniphilum)(属)(例如，肠道部位)、粪罗斯拜瑞氏菌(roseburiafaecis)(种)(例如，肠道部位)、链球菌属s16-11(streptococcussp.s16-11)(种)(例如，肠道部位)、拟杆菌属4072(bacteroidessp.4072)(种)(例如，肠道部位)、沙氏另支菌(alistipesshahii)(种)(例如，肠道部位)、肠杆菌(bacteroidesintestinalis)(种)(例如，肠道部位)、长形乳杆菌(种)(例如，肠道部位)、鹤见双歧杆菌(bifidobacteriumtsurumiense)(种)(例如，肠道部位)、多雷类杆菌(种)(例如，肠道部位)、木糖降解拟杆菌(bacteroidesxylanisolvens)(种)(例如，肠道部位)、克罗诺杆菌属(cronobacter)(属)(例如，肠道部位)、异斯卡多维亚菌属(alloscardovia)(属)(例如，肠道部位)、异斯卡多维亚菌(alloscardoviaomnicolens)(种)(例如，肠道部位)、lactonifactor(属)(例如，肠道部位)、卡他杆菌科(科)(例如，肠道部位)、产液阿德勒克罗伊茨菌(adlercreutziaequolifaciens)(种)(例如，肠道部位)、阿德勒克罗伊茨菌属(adlercreutzia)(属)(例如，肠道部位)、另支菌属eba6-25cl2(alistipessp.eba6-25cl2)(种)(例如，肠道部位)、拟杆菌属eba5-17(bacteroidessp.eba5-17)(种)(例如，肠道部位)、颤杆菌属(oscillibacter)(属)(例如，肠道部位)、帕梅莱氏戈尔戈登氏杆菌(种)(例如，肠道部位)、另支菌属nml05a004(种)(例如，肠道部位)、人类排泄性副沙门氏菌(种)(例如，肠道部位)、光冈菌属djf_rr21(mitsuokellasp.djf_rr21)(种)(例如，肠道部位)、丁酸弧菌属(butyricimonas)(属)(例如，肠道部位)、粪双歧杆菌(bifidobacteriumstercoris)(种)(例如，肠道部位)、alistipesindistinctus(种)(例如，肠道部位)、戈登氏杆菌属(gordonibacter)(属)(例如，肠道部位)、阿氏厌氧菌(种)(例如，肠道部位)、克雷伯氏菌属b12(klebsiellasp.b12)(种)(例如，肠道部位)、另支菌属rma9912(alistipessp.rma9912)(种)(例如，肠道部位)、厌氧孢杆菌属(anaerosporobacter)(属)(例如，肠道部位)、粪拟杆菌(bacteroidesfaecis)(种)(例如，肠道部位)、布劳特氏菌属ser5(blautiasp.ser5)(种)(例如，肠道部位)、中华拟杆菌(种)(例如，肠道部位)、嗜胆菌属4_1_30(bilophilasp.4_1_30)(种)(例如，肠道部位)、钙镁杆菌科(科)(例如，肠道部位)、肠杆菌属udc345(enterobactersp.udc345)(种)(例如，肠道部位)、双乳双歧杆菌(bifidobacteriumbiavatii)(种)(例如，肠道部位)、嗜胨菌属1-14(peptoniphilussp.1-14)(种)(例如，肠道部位)、另支菌属hgb5(alistipessp.hgb5)(种)(例如，肠道部位)、拟杆菌属slc1-38(bacteroidessp.slc1-38)(种)(例如，肠道部位)、乳杆菌属akhmro1(lactobacillussp.akhmro1)(种)(例如，肠道部位)、克雷伯氏菌属sor89(klebsiellasp.sor89)(种)(例如，肠道部位)、肠球菌属c6i11(enterococcussp.c6i11)(种)(例如，肠道部位)、pseudoflavonifractor(属)(例如，肠道部位)、拟杆菌属dnlkv9(bacteroidessp.dnlkv9)(种)(例如，肠道部位)、巨球型菌属bv3c16-1(megasphaerasp.bv3c16-1)(种)(例如，肠道部位)、粪杆菌属犬口分类群147(faecalibacteriumsp.canineoraltaxon147)(种)(例如，肠道部位)、弯曲短杆菌属ccug45114(varibaculumsp.ccug45114)(种)(例如，肠道部位)、丁酸弧菌属214-4(butyricimonassp.214-4)(种)(例如，肠道部位)、鼠李氏厌氧菌(种)(例如，肠道部位)、阴性球菌属s5-a15(negativicoccussp.s5-a15)(种)(例如，肠道部位)、[collinsella]massiliensis[柯林斯氏菌]马赛种(种)(例如，肠道部位)、棒状杆菌属jw37(corynebacteriumsp.jw37)(种)(例如，肠道部位)、罗斯拜瑞氏菌属499(roseburiasp.499)(种)(例如，肠道部位)、小杆菌属s7msr5(dialistersp.s7msr5)(种)(例如，肠道部位)、厌氧球菌属s887-3(anaerococcussp.s887-3)(种)(例如，肠道部位)、大芬戈尔德菌属s8f7(finegoldiasp.s8f7)(种)(例如，肠道部位)、墨氏杆菌属s9pr-10(murdochiellasp.s9pr-10)(种)(例如，肠道部位)、嗜胨菌属s9pr-13(peptoniphilussp.s9pr-13)(种)(例如，肠道部位)、拟杆菌属j1511(bacteroidessp.j1511)(种)(例如，肠道部位)、棒状杆菌属713182/2012(corynebacteriumsp.713182/2012)(种)(例如，肠道部位)、拉恩氏菌属bsp18(rahnellasp.bsp18)(种)(例如，肠道部位)、肠单胞球菌属(intestinimonas)(属)(例如，肠道部位)、罗宾逊菌属knhs210(种)(例如，肠道部位)、立方假丝酵母(属)(例如，肠道部位)、粪性丁酸单胞菌(种)(例如，肠道部位)、senegalimassilia(属)(例如，肠道部位)、嗜胨菌属dnf00840(peptoniphilussp.dnf00840)(种)(例如，肠道部位)、romboutsia(属)(例如，肠道部位)、塞孔杜斯协概率菌(种)(例如，肠道部位)、莫拉氏菌科(moraxellaceae)(科)(例如，口腔部位)、莫拉氏菌属(moraxella)(属)(例如，口腔部位)、艾肯菌属(eikenella)(属)(例如，口腔部位)、侵蚀艾肯菌(eikenellacorrodens)(种)(例如，口腔部位)、漫游球菌属(vagococcus)(属)(例如，口腔部位)、叶杆菌属(phyllobacterium)(属)(例如，口腔部位)、殊异韦荣氏菌(veillonelladispar)(种)(例如，口腔部位)、华德萨特菌(sutterellawadsworthensis)(种)(例如，口腔部位)、懒惰约翰森菌(johnsonellaignava)(种)(例如，口腔部位)、酸性拟杆菌(bacteroidesacidifaciens)(种)(例如，口腔部位)、赫氏纤毛菌(leptotrichiahofstadii)(种)(例如，口腔部位)、沙氏纤毛菌(leptotrichiashahii)(种)(例如，口腔部位)、噬二氧化碳细胞菌属ahn9756(capnocytophagasp.ahn9756)(种)(例如，口腔部位)、伯杰菌属af14(bergeyellasp.af14)(种)(例如，口腔部位)、欧陆森氏菌属f0004(olsenellasp.f0004)(种)(例如，口腔部位)、拟杆菌属d22(bacteroidessp.d22)(种)(例如，口腔部位)、叶杆菌属t50(phyllobacteriumsp.t50)(种)(例如，口腔部位)、放线菌属icm47(actinomycessp.icm47)(种)(例如，口腔部位)、梭杆菌属as2(fusobacteriumsp.as2)(种)(例如，口腔部位)、纤毛菌科(leptotrichiaceae)(科)(例如，口腔部位)、丛毛单胞菌属(comamonas)(属)(例如，鼻部位)、消化链球菌属(peptostreptococcus)(属)(例如，鼻部位)、粘性放线菌(actinomycesviscosus)(种)(例如，鼻部位)、龋齿放线菌(actinomycesodontolyticus)(种)(例如，鼻部位)、双歧杆菌属(bifidobacterium)(属)(例如，鼻部位)、双歧杆菌科(bifidobacteriaceae)(科)(例如，鼻部位)、红螺菌科(rhodospirillaceae)(科)(例如，鼻部位)、双歧杆菌目(bifidobacteriales)(目)(例如，鼻部位)、肠道罗斯拜瑞氏菌(roseburiaintestinalis)(种)(例如，鼻部位)、海旋菌属(thalassospira)(属)(例如，鼻部位)、长双歧杆菌(bifidobacteriumlongum)(种)(例如，鼻部位)、聚集杆菌属(aggregatibacter)(属)(例如，鼻部位)、链球菌属11atha1(streptococcussp.11atha1)(种)(例如，鼻部位)、萨特菌科(sutterellaceae)(科)(例如，鼻部位)、黄杆菌属(flavobacterium)(属)(例如，鼻部位)、苍白杆菌属(ochrobactrum)(属)(例如，鼻部位)、阪崎肠杆菌(cronobactersakazakii)(种)(例如，鼻部位)、阴道厌氧球菌(anaerococcusvaginalis)(种)(例如，鼻部位)、鞘脂杆菌纲(sphingobacteriia)(纲)(例如，鼻部位)、布鲁氏菌科(brucellaceae)(科)(例如，鼻部位)、鞘脂杆菌目(sphingobacteriales)(目)(例如，鼻部位)、艾克曼菌属(akkermansia)(属)(例如，鼻部位)、嗜胨菌属gpaco18a(peptoniphilussp.gpaco18a)(种)(例如，鼻部位)、柠檬酸杆菌属bw4(citrobactersp.bw4)(种)(例如，鼻部位)、克罗诺杆菌属(cronobacter)(属)(例如，鼻部位)、棒状杆菌属jw37(corynebacteriumsp.jw37)(种)(例如，鼻部位)、金黄色葡萄球菌(staphylococcusaureus)(种)(例如，鼻部位)、短波单胞菌属(brevundimonas)(属)(例如，鼻部位)、柄杆菌科(caulobacteraceae)(科)(例如，鼻部位)、柄杆菌目(caulobacterales)(目)(例如，鼻部位)、嗜碱重氮营养厌氧杆菌(种)(例如，鼻部位)、厌氧芽胞杆菌属(anaerobacillus)(属)(例如，鼻部位)、不动杆菌属wb22-23(acinetobactersp.wb22-23)(种)(例如，鼻部位)、假单胞菌属(pseudomonas)(属)(例如，皮肤部位)、奈瑟球菌科(neisseriaceae)(科)(例如，皮肤部位)、狄氏副拟杆菌(parabacteroidesdistasonis)(种)(例如，皮肤部位)、普雷沃氏菌属(prevotella)(属)(例如，皮肤部位)、普拉梭菌(faecalibacteriumprausnitzii)(种)(例如，皮肤部位)、副血链球菌(streptococcusparasanguinis)(种)(例如，皮肤部位)、痤疮皮肤杆菌(种)(例如，皮肤部位)、韦荣氏菌科(veillonellaceae)(科)(例如，皮肤部位)、纤毛菌属(leptotrichia)(属)(例如，皮肤部位)、考拉杆菌属(phascolarctobacterium)(属)(例如，皮肤部位)、黄杆菌科(flavobacteriaceae)(科)(例如，皮肤部位)、代尔夫特菌属(delftia)(属)(例如，皮肤部位)、黄杆菌纲(flavobacteriia)(纲)(例如，皮肤部位)、普雷沃氏菌科(prevotellaceae)(科)(例如，皮肤部位)、毛螺菌科(lachnospiraceae)(科)(例如，皮肤部位)、消化链球菌科(peptostreptococcaceae)(科)(例如，皮肤部位)、杜尔氏菌属(dorea)(属)(例如，皮肤部位)、黄杆菌目(flavobacteriales)(目)(例如，皮肤部位)、奈瑟球菌目(neisseriales)(目)(例如，皮肤部位)、副拟杆菌属(parabacteroides)(属)(例如，皮肤部位)、链球菌属口腔分类群g63(streptococcussp.oraltaxong63)(种)(例如，皮肤部位)、氨基酸球菌科(acidaminococcaceae)(科)(例如，皮肤部位)、韦荣氏菌属cm60(veillonellasp.cm60)(种)(例如，皮肤部位)、葡萄球菌属c9i2(staphylococcussp.c9i2)(种)(例如，皮肤部位)、纤毛菌科(leptotrichiaceae)(科)(例如，皮肤部位)、嗜糖嗜糖杆菌(种)(例如，皮肤部位)、fusicatenibacter(属)(例如，皮肤部位)、葡萄球菌3348o2(staphylococcussp.3348o2)(种)(例如，皮肤部位)、粪副拟杆菌(parabacteroidesmerdae)(种)(例如，皮肤部位)、产气柯林斯菌(collinsellaaerofaciens)(种)(例如，皮肤部位)、鞘脂杆菌纲(sphingobacteriia)(纲)(例如，皮肤部位)、鞘脂杆菌目(sphingobacteriales)(目)(例如，皮肤部位)、嗜胨菌属1-14(peptoniphilussp.1-14)(种)(例如，皮肤部位)、厌氧芽胞杆菌属(anaerobacillus)(属)(例如，皮肤部位)、丙酸杆菌属kpl1844(propionibacteriumsp.kpl1844)(种)(例如，皮肤部位)、长亚甲基杆菌(methylobacteriumlongum)(种)(例如，皮肤部位)、葡萄球菌属c5i16(staphylococcussp.c5i16)(种)(例如，皮肤部位)和/或其它合适的分类单元(例如，与任何合适的身体部位相关联的，等等)。
附加地或可替代地，与一种或多种阑尾相关病症相关联的微生物组特征可以包括与一个或多个以下的分类单元(例如，一处或多处身体部位相关的，等等)的任何组合相关联的特征(例如，微生物组组成特征等)：厚壁菌门(firmicutes)(门)、棉子糖肠球菌(enterococcusraffinosus)(种)、葡萄球菌属c9i2(staphylococcussp.c9i2)(种)、孪生球菌属933-88(gemellasp.933-88)(种)、韦荣氏菌属(veillonella)(属)、γ-变形菌纲(gammaproteobacteria)(纲)、肠球菌属si-4(enterococcussp.si-4)(种)、肠杆菌目(enterobacteriales)(目)、肠杆菌科(enterobacteriaceae)(科)、考拉杆菌属(phascolarctobacterium)(属)、嗜臭菌(属)、瘤胃菌科(ruminococcaceae)(科)、氨基酸球菌科(acidaminococcaceae)(科)、嗜胆菌属4_1_30(bilophilasp.4_1_30)(种)、厌氧棒状菌属5_1_63faa(anaerostipessp.5_1_63faa)(种)、脱硫弧菌科(desulfovibrionaceae)(科)、粪考拉杆菌(phascolarctobacteriumfaecium)(种)、脱硫弧菌纲(desulfovibrionales)(纲)、粪杆菌属(faecalibacterium)(属)、δ-变形菌纲(deltaproteobacteria)(纲)、伯克霍尔德氏菌科(burkholderiaceae)(科)、另支菌属rma9912(alistipessp.rma9912)(种)、甲烷短杆菌属(methanobrevibacter)(属)、内脏臭杆菌(种)、另支菌属hgb5(alistipessp.hgb5)(种)、孪生球菌属(gemella)(属)、subdoligranulumvariabile(种)、史氏甲烷短杆菌(methanobrevibactersmithii)(种)、intestinimonas(属)、乳杆菌属7_1_47faa(lactobacillussp.7_1_47faa)(种)、甲烷杆菌科(methanobacteriaceae)(科)、嗜胆菌属(bilophila)(属)、甲烷杆菌目(methanobacteriales)(目)、梭菌科(clostridiaceae)(科)、广古菌门(euryarchaeota)(门)、甲烷杆菌纲(methanobacteria)(纲)、普氏黄曲霉(种)、肉杆菌科(carnobacteriaceae)(科)、克吕沃尔氏菌属(kluyvera)(属)、佐治亚克吕沃尔氏菌(kluyverageorgiana)(种)、粪布劳特氏菌(blautiafaecis)(种)、普拉梭菌(faecalibacteriumprausnitzii)(种)、长形乳杆菌(种)、罗斯拜瑞氏菌属11se39(roseburiasp.11se39)(种)、拟杆菌属ar29(bacteroidessp.ar29)(种)、柯林斯氏菌属(collinsella)(属)、另支菌nml05a004(alistipessp.nml05a004)(种)、提蒙类普雷沃菌(种)、厌氧棒状菌属(anaerostipes)(属)、lactonifactor(属)、厌氧棒状菌属3_2_56faa(anaerostipessp.3_2_56faa)(种)、红蝽杆菌科(coriobacteriaceae)(科)、克雷伯氏菌属sor89(klebsiellasp.sor89)(种)、巨球型菌属dnf00912(megasphaerasp.dnf00912)(种)、殊异韦荣氏菌(veillonelladispar)(种)、粘膜乳杆菌(lactobacillusmucosae)(种)、脆弱拟杆菌(bacteroidesfragilis)(种)、马肠链球菌(streptococcusequinus)(种)、普通拟杆菌(bacteroidesplebeius)(种)、丙酸杆菌属msp09a(propionibacteriumsp.msp09a)(种)、巴氏链球菌(streptococcuspasteurianus)(种)、厌氧弧菌属765(anaerovibriosp.765)(种)、嗜粘蛋白-艾克曼菌(akkermansiamuciniphila)(种)，放线菌图列茨亚种(种)、阪崎肠杆菌(cronobactersakazakii)(种)、黄绿脓杆菌(种)、葡萄球菌(种)、氨基酸球肠菌(acidaminococcusintestini)(种)、颗粒丙酸杆菌(propionibacteriumgranulosum)(种)、多形拟杆菌(bacteroidesthetaiotaomicron)(种)、梭杆菌属cm21(fusobacteriumsp.cm21)(种)、片球菌属mfc1(pediococcussp.mfc1)(种)、血绿脓杆菌(种)、胃八叠球菌(sarcinaventriculi)(种)、巨球型菌属c1(megasphaeragenomosp.c1)(种)、链球菌属bs35a(streptococcussp.bs35a)(种)、嗜热链球菌(streptococcusthermophilus)(种)、溃疡梭杆菌(fusobacteriumulcerans)(种)、摩氏摩根氏菌(morganellamorganii)(种)、拟杆菌属slc1-38(bacteroidessp.slc1-38)(种)、埃氏拟杆菌(bacteroideseggerthii)(种)、鸡粪类杆菌(种)、拟杆菌属cb57(bacteroidessp.cb57)(种)、粪双歧杆菌(bifidobacteriumstercoris)(种)、非典型韦荣氏菌(veillonellaatypica)(种)、坏疽梭杆菌(fusobacteriumnecrogenes)(种)、弯曲乳杆菌(lactobacilluscrispatus)(种)、韦荣氏菌属msa12(种)、asaccharosporairregularis(种)、多枝梭菌(erysipelatoclostridiumramosum)(种)、乳杆菌属tab-22(种)、人类排泄性副沙门氏菌(种)、乳杆菌属c4i2(lactobacillussp.c4i2)(种)、拟杆菌属157(parabacteroidessp.157)(种)、克雷伯氏菌属(klebsiella)(属)、刺骨鱼菌属(epulopiscium)(属)、链球菌属(streptococcus)(属)、丙酸杆菌属(propionibacterium)(属)、克罗诺杆菌属(cronobacter)(属)、厌氧弧菌属(anaerovibrio)(属)、肠杆菌(intestinibacter)(属)、葡萄球菌属(staphylococcus)(属)、苏黎世杆菌属(turicibacter)(属)，拟普雷沃氏菌属(alloprevotella)(属)、片球菌属(pediococcus)(属)、摩根氏菌属(morganella)(属)、氨基酸球菌属(acidaminococcus)(属)、琥珀酸弧菌属(succinivibrio)(属)、细杆菌属(属)、巨球型菌属(megasphaera)(属)、asaccharospora(属)、丁酸弧菌属(butyrivibrio)(属)、大芬戈尔德菌属(finegoldia)(属)、厌氧球菌属(anaerococcus)(属)、链球菌科(streptococcaceae)(科)、丙酸杆菌科(propionibacteriaceae)(科)、韦荣氏菌科(veillonellaceae)(科)、葡萄球菌科(staphylococcaceae)(科)、鞘脂杆菌科(sphingobacteriaceae)(科)、梭菌目科xi.未知种(clostridialesfamilyxi.incertaesedis)(科)、消化链球菌科(peptostreptococcaceae)(科)、琥珀酸弧菌科(succinivibrionaceae)(科)、皮杆菌科(dermabacteraceae)(科)、棒状杆菌科(corynebacteriaceae)(科)、红螺菌科(rhodospirillaceae)(科)、硒单胞菌(目)、乳杆菌目(lactobacillales)(目)、梭菌目(clostridiales)(目)、黄色单胞菌目(xanthomonadales)(目)、芽孢杆菌目(bacillales)(目)、宽球藻目(pleurocapsales)(目)、气单胞菌目(aeromonadales)(目)、假单胞菌目(pseudomonadales)(目)、芽孢杆菌纲(bacilli)(纲)、negativicutes(纲)、梭菌纲(clostridia)(纲)、变形菌门(proteobacteria)(门)、蓝细菌(cyanobacteria)(门)、细金拟杆菌(种)、alistipesputredinis(种)、放线菌纲(纲)、乳杆菌科(lactobacillaceae)(科)、双歧杆菌科(bifidobacteriaceae)(科)、双歧杆菌属(bifidobacterium)(属)、双歧杆菌目(bifidobacterium)(目)、颤螺菌科(oscillospiraceae)(科)和/或其它合适的分类单元(例如，与任何合适的身体部位相关联的，等等)。
附加地或可替代地，与一种或多种阑尾相关病症相关联的微生物组特征可以包括微生物组功能特征(例如，描述与一种或多种微生物相关联的功能的特征，例如以本文所述的分类群分类的微生物；描述功能多样性的特征；描述存在、不存在、丰度和/或相对丰度的特征；等等)，该微生物组功能特征与来自以下的一项或多项的功能相对应和/或以其它方式与相关联(例如，与一处或多处身体部位相关，其中微生物组功能特征可以包括与一处或多处身体部位相关联的部位特定的功能特征，例如其中功能特征和一种或多种阑尾相关病症之间的相关性可以特定于身体部位，例如特定于微生物组功能，该微生物组功能对应于在身体部位观察到的微生物，其中微生物来自对应于身体部位的身体采集部位处采集的样本；等等)：神经退行性疾病(例如，kegg通路2级)(例如，肠道部位)、信号分子和相互作用(例如，kegg通路2级)(例如，肠道部位)、外源物质的生物降解和代谢(xenobioticsbiodegradationandmetabolism)(例如，kegg通路2级)(例如，肠道部位)、抗坏血酸和醛酸代谢(ascorbateandaldaratemetabolism)(例如，kegg通路3级)(例如，肠道部位)、亨廷顿舞蹈病(例如，kegg通路3级)(例如，肠道部位)、磷酸肌醇代谢(例如，kegg通路3级)(例如，肠道部位)、丙酸代谢(例如，kegg通路3级)(例如，肠道部位)、淀粉和蔗糖代谢(例如，kegg通路3级)(例如，肠道部位)、己内酰胺降解(例如，kegg通路3级)(例如，肠道部位)、细胞运动和分泌(例如，kegg通路3级)(例如，肠道部位)、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸降解(例如，kegg通路3级)(例如，肠道部位)、色氨酸代谢(例如，kegg通路3级)(例如，肠道部位)、i型糖尿病(例如，kegg通路3级)(例如，肠道部位)，苯丙氨酸代谢(例如，kegg通路3级)(例如，肠道部位)、硒化合物代谢(例如，kegg通路3级)(例如，肠道部位)、赖氨酸降解(例如，kegg通路3级)(例如，肠道部位)，多环芳烃降解(例如，kegg通路3级)(例如，肠道部位)、多糖的生物合成和代谢(例如，kegg通路3级)(例如，肠道部位)、肾细胞癌(例如，kegg通路3级)、丁酸酯代谢(例如，kegg通路3级)(例如，肠道部位)，原核生物中的碳固定途径(例如，kegg通路3级)(例如，肠道部位)、柠檬酸循环(tca循环)(例如，kegg通路3级)(例如，肠道部位)、脂多糖的生物合成(例如，kegg通路3级)(例如，肠道部位)、rna转运(例如，kegg通路3级)(例如，肠道部位)、硫胺素代谢(例如，kegg通路3级)(例如，肠道部位)、1,1,1-三氯-2,2-双(4-氯苯基)乙烷(ddt)降解(例如，kegg通路3级)(例如，肠道部位)、电子转移载体(例如，kegg通路3级)(例如，肠道部位)、肌萎缩性侧索硬化症(als)(例如kegg通路3级)(例如，肠道部位)、朊病毒病(例如，kegg通路3级)(例如，肠道部位)、甲苯降解(例如，kegg通路3级)(例如，肠道部位)、和α-亚麻酸代谢(例如，kegg通路3级)(例如，肠道部位)。附加地或可替代地，与一种或多种阑尾相关病症相关联的微生物组特征可以包括微生物组功能特征，该微生物组功能特征与来自以下的一项或多项的功能对应和/或以其它方式相关联：[v]防御机制(cog2)、[o]翻译后修饰、蛋白质转换和伴侣(cog2)、[r]仅一般功能预测(cog2)、[i]脂质转运和代谢(cog2)、[h]辅酶转运和代谢(cog2)、能量代谢(kegg2)、神经系统(kegg2)、信号转导(kegg2)、细胞过程和信号转导(kegg2)、翻译(kegg2)、代谢(kegg2)、细胞生长和死亡(kegg2)、内分泌系统(kegg2)、氨基酸代谢(kegg2)、辅因子和维生素的代谢(kegg2)、外源物质的生物降解和代谢(kegg2)、复制和修复(kegg2)、萜类化合物和聚酮化合物(kegg2)的代谢、传染病(kegg2)、氨基酸相关的酶(kegg3)、多环芳烃降解(kegg3)、光合作用(kegg3)、泛酸和coa生物合成(kegg3)、光合作用蛋白(kegg3)、谷氨酸能突触(kegg3)、结核病(kegg3)、两组分系统(kegg3)、氨基酰基-trna生物合成(kegg3)、硫胺素代谢(kegg3)、核糖体(kegg3)、其它离子偶联转运体(kegg3)、萜类骨架生物合成(kegg3)、细胞周期-柄杆菌属(kegg3)、其它转运体(kegg3)、碱基切除修复(kegg3)、肽聚糖生物合成(kegg3)、霍乱弧菌致病周期(kegg3)、柠檬烯和蒎烯降解(kegg3)、分泌系统(kegg3)、核苷酸切除修复(kegg3)、翻译因子(kegg3)、丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢(kegg3)、核糖体生物发生(kegg3)、丁酸酯代谢(kegg3)、其它(kegg3)、真核生物中的核糖体生物发生(kegg3)、聚酮糖单元生物合成(kegg3)、链霉素生物合成(kegg3)、抗坏血酸和醛酸代谢(kegg3)、同源重组kegg3)、氧化磷酸化(kegg3)、未知功能(kegg3)、光合生物的固碳作用(kegg3)、细胞骨架蛋白(kegg3)、dna修复和重组蛋白(kegg3)、赖氨酸降解(kegg3)、无机离子转运和代谢(kegg3)、氨基酸代谢(kegg3)、香叶醇降解(kegg3)、蛋白质输出(kegg3)、苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸生物合成(kegg3)、赖氨酸生物合成(kegg3)、乙苯降解(kegg3)、转录机制(kegg3)，rna聚合酶(kegg3)、万古霉素类抗生素生物合成(kegg3)、错配修复(kegg3)、萘降解(kegg3)、嘧啶代谢(kegg3)、色氨酸代谢(kegg3)、d-谷氨酰胺和d-谷氨酸代谢(kegg3)、玉米素生物合成(kegg3)、k02004(kegg4)、k03100(kegg4)和/或其它合适的功能特征。附加地或可替代地，微生物组功能特征可以与直源同源群集(clustersoforthologousgroups，cog)数据库(例如，cog，cog2等)、京都基因与基因组百科全书(kyotoencyclopediaofgenesandgenomes，kegg)数据库(例如kegg2、kegg3、kegg4等)和/或任何其它合适的可用数据库(例如具有微生物功能数据的数据库等)相关。然而，微生物组特征可以包括与任何合适的微生物功能、人类功能和/或其它合适的功能相关联的任何合适的微生物组功能。
在变体中，可以基于本文所述的部位特定的微生物组特征(例如，与一处或多处身体部位相关联的；等等)(例如部位特定的组成特征；部位特定的功能特征；等等)，确定部位特定的阑尾相关表征模型(例如，用于基于处理与一处或多处身体部位相关联的、也与部位特定的阑尾相关表征模型相关联的使用者部位特定的微生物组特征，确定阑尾相关表征的)和/或阑尾相关表征(例如与身体部位相关联的；等等)。在示例中，方法100可以包括确定使用者微生物组特征(例如，为可以确定和/或推广阑尾相关表征和/或治疗的使用者；为使用者确定微生物组特征的特征值，其中微生物组特征被确定与一种或多种阑尾相关病症相关联，例如相关的；等等)，该使用者微生物组特征包括与一处或多处身体部位相关联的部位特定微生物组特征。
在变体中，可以基于包括微生物组组成特征(例如部位特定的组成特征；等等)和微生物组功能特征(例如部位特定的功能特征)的微生物组特征(例如，与一种或多种阑尾相关病症相关联；等等)，确定阑尾相关表征模型和/或阑尾相关表征。在一示例中，方法100可以包括确定部位特定的组成特征(例如，与肠道部位相关联的；本文所述的组成特征；等等)和部位特定的功能特征(例如，与肠道部位相关联的；本文所述的功能特征；等等)；和基于部位特定的组成特征、部位特定的功能特征和/或其它合适的数据(例如补充数据，等等)，生成部位特定的阑尾相关表征模型(例如，与肠道部位相关联的；用于处理衍生自肠道采集部位处采集的样本的数据；等等)；和/或基于部位特定的阑尾相关表征模型和使用者微生物组特征(例如，衍生自肠道采集部位处采集的使用者样本)，为一个或多个使用者确定一种或多种阑尾相关表征。
在特定示例中，可以基于一个或多个微生物数据集(例如，微生物序列数据集，等等)，确定本文所述的微生物组组成特征(例如，包括部位特定的组成特征，等等)、本文所述的微生物组功能特征和/或其它合适的微生物组特征，该微生物数据集基于来自与阑尾相关病症相关联的一组受试者(例如，一组受试者包括具有阑尾相关病症的受试者，例如不存在阑尾和/或其它合适的阑尾相关病症；包括没有阑尾相关病症的受试者，例如具有阑尾的受试者，其中此类样本和/或相关数据可以作为对照；一群受试者；等等)的样本(例如，对样本中微生物核酸进行测序等)而确定。
在变体中，本文所述的微生物组特征的任何合适的组合可以用于阑尾炎表征处理(例如，确定和/或应用阑尾炎表征模型，以进行阑尾炎病症的诊断和/或合适的表征；促使阑尾炎病症的治疗模型和/或治疗的确定和/或应用；等等)。在一示例中，微生物组特征的组合可以以他/她自身的肠道微生物组样本为基础，预测个体阑尾炎的可能性，包括存在、不存在，相对丰度或衍生自肠道样本分析的任何其它微生物组特征。
在变体中，本文所述的微生物组特征的任何合适的组合可以用于一种或多种与微生物相关联的阑尾相关病症的预防、治疗和/或合适的治疗干预促进，例如用于使肠道微生物群(microbiota)恢复到健康的行列中(例如，改善微生物组多样性)，例如包括调节人类肠道微生物组和/或与合适身体部位相关联的其它合适微生物组中的微生物的存在、不存在或相对丰度(例如，针对目标微生物组组成和/或与使用者相关联的功能，该使用者具有阑尾而没有与炎症性肠道疾病和/或与其它合适的阑尾相关病症相关联的症状)。然而，与阑尾相关病症相关联的微生物组特征可以以任何合适的方式应用于一种或多种阑尾相关病症的预防、治疗和/或合适的治疗干预促进。
在一示例中，方法100可以包括：基于第一组组成特征(例如，包括上述与第一变体相关的至少一种或多种微生物组特征；包括微生物组特征的任何合适的组合；等等)、第一阑尾相关表征模型、第二组组成特征(例如，包括上述与第二变体相关的至少一种或多种微生物组特征；包括微生物组特征的任何合适的组合；等等)，和第二阑尾相关表征模型，为使用者确定第一阑尾相关病症和第二阑尾相关病症的阑尾相关表征，其中第一阑尾相关表征模型与第一阑尾相关病症相关联(例如，第一阑尾相关表征模型确定第一阑尾相关病症的表征，等等)，以及其中第二阑尾相关表征模型与第二阑尾相关病症相关联(例如，其中第二阑尾相关表征模型确定第二阑尾相关病症的表征，等等)。在该示例中，确定使用者微生物组特征可以包括从直源同源群集(cog)数据库和京都基因与基因组百科全书(kegg)数据库中的至少一个确定与第一功能相关联的第一使用者微生物组功能特征，其中第一使用者微生物组功能特征与第一阑尾相关病症相关联；从cog数据库和kegg数据库中的至少一个确定与第二功能相关联的第二使用者微生物组功能特征，其中第二使用者微生物组功能特征与第二阑尾相关病症相关联，其中确定阑尾相关表征可以包括基于第一组组成特征、第一使用者微生物组功能特征、第一阑尾相关表征模型、第二组组成特征、第二使用者微生物组功能特征和第二阑尾相关表征模型，为使用者确定第一阑尾相关病症和第二阑尾相关病症的相关表征。附加地或可替代地，微生物组特征的任何组合可以与任何合适数量和类型的阑尾相关表征模型一起使用，以任何合适的方式来确定一种或多种阑尾相关病症的相关表征。
在示例中，方法100可以包括基于上述和/或本文所述的微生物组特征的任何合适的组合(例如，基于包括与本文所述的分类单元中的至少一个相关联的一组微生物组组成特征；和/或基于本文所述的微生物组功能特征，例如与本文所述的数据库的功能对应的)，生成一种或多种阑尾相关表征模型。在一示例中，对使用者执行表征处理可以包括将使用者表征为具有一种或多种阑尾相关病症，例如基于本文所述的微生物组特征(例如，上述的微生物组特征等)的检测、与之对应的值和/或与之相关的其它方面，以及例如以典型的诊断方法、其它表征(例如与治疗相关的表征)、治疗、监测和/或与阑尾相关病症相关联的其它合适的方法作为附加(例如，补充、互补等)或可替代的方式。在变体中，微生物组特征可以用于诊断、其它表征、治疗、监测和/或任何其它合适的目的和/或与阑尾相关病症相关联的方法。然而，确定一种或多种阑尾相关表征可以以任何合适的方式来执行。
4.3.b确定治疗。
执行表征处理s130(例如，执行阑尾相关治疗)可以包括区块s140，所述区块s140可以包括确定一种或多种治疗(例如，配置成调节微生物组组成、功能、多样性和/或其它合适方面的治疗，例如，用于改善与阑尾相关病症相关联的一个或多个方面，例如基于一个或多个表征处理而在使用者中进行表征；等等)。区块s140可以用于识别、选择、排序、划分优先次序、预测、劝阻和/或以其它方式确定治疗(例如，促进治疗的确定，等等)。例如，区块s140可以包括确定基于益生菌的治疗、基于噬菌体的治疗、基于小分子的治疗和/或其它合适的治疗中的一种或多种，例如可以将受试者的微生物组组成、功能、多样性、和/或其他特征(例如，在任何合适部位的微生物组，等等)转变为期望状态(例如，平衡状态等)，以促进使用者的健康，从而改善一种或多种阑尾相关的病症，和/或用于其它合适的目的。
治疗(例如，阑尾相关的治疗，等等)可以包括以下的任何一种或多种：消耗品(例如，益生菌治疗、益生元治疗、药物，如抗生素、过敏或感冒药、基于噬菌体的治疗，基本情况的消耗品、小分子治疗，等等)；与设备相关的治疗(例如，监测设备；基于传感器的设备；医疗设备；可植入医疗设备，等等)；外科手术(例如，阑尾切除术、预防性阑尾切除术、腹部手术、腹腔镜手术，切口手术等)；心理相关的治疗(例如，认知行为治疗、焦虑治疗、谈话治疗、心理动力学治疗、行动导向治疗、理性情绪行为治疗、人际心理治疗、放松训练、深呼吸技术、渐进性肌肉放松、阑尾限制治疗、冥想，等)；行为矫正治疗(例如，避免使用止痛药、抗酸剂、泻药、加热垫和/或其它合适的治疗和/或活动；体育锻炼建议，例如增加运动；饮食建议，例如减少糖摄入、增加蔬菜摄入、增加鱼类摄入量、减少咖啡因消耗、减少酒精消耗、减少碳水化合物摄入；吸烟建议，例如减少烟草摄入；体重相关建议；睡眠习惯建议等)；局部给药治疗(例如局部益生菌、益生元和/或抗生素；基于噬菌体的治疗)；环境因子修改治疗；与一种或多种阑尾相关病症相关联的任何其它合适方面的修改；和/或任何其它合适的治疗(例如，用于改善与一种或多种阑尾相关病症相关联的健康状况，例如用于改善一种或多种阑尾相关病症的治疗、用于降低一种或多种阑尾相关病症的风险的治疗等)。在示例中，治疗的类型可以包括以下的任何一种或多种：益生菌治疗、基于噬菌体的治疗、基于小分子的治疗、认知/行为治疗、物理康复治疗、临床治疗、基于药物的治疗、饮食相关治疗、和/或设计为以任何其它合适方式操作以促进使用者健康的任何其它合适治疗。
在变体中，治疗可以包括与一处或多处身体部位相关联的部位特定治疗，例如用于在使用者的一处或多处不同身体部位(例如，一处或多处不同的采集部位)，促进微生物组组成和/或功能的修改，例如靶向和/或转变与肠道部位、鼻部位、皮肤部位、口腔部位和/或生殖器部位相关联的微生物(例如，通过促进与一种或多种治疗相关的治疗干预，其中所述治疗配置为特定针对一处或多处使用者身体部位，例如在一处或多处使用者身体部位的微生物组；等等)，例如用于促进一种或多种阑尾相关病症的改善(例如，通过将特定使用者身体部位的使用者微生物组组成和/或功能修改为目标微生物组组成和/或功能，例如在特定身体部位处的微生物组组成和/或功能，并且其与健康的阑尾状态和/或缺乏一种或多种阑尾相关病症相关联；等等)。部位特定的治疗可以包括任何的一种或多种消耗品(例如，靶向肠道部位的微生物组和/或与任何合适的身体部位相关联的微生物组；等等)；局部治疗(例如用于修改皮肤微生物组、鼻微生物组、口腔微生物组、生殖器微生物组等)；和/或任何其它合适类型的治疗。在一示例中，方法100可以包括采集来自使用者的、与第一身体部位(例如，包括肠道部位、皮肤部位、生殖器部位、口腔部位和鼻部位中的至少一处，等等)相关联的样本；确定与第一身体部位相关联的部位特定的组成特征；基于部位特定的组成特征，为使用者确定阑尾相关病症的阑尾相关表征；以及基于阑尾相关表征，促进使用者第一部位特定治疗相关的治疗干预(例如，向使用者提供第一部位特定治疗，等等)，以促进阑尾相关病症的改善，其中第一部位特定治疗与第一身体部位相关联。在一示例中，方法100可以包括在促进与第一部位特定治疗相关的治疗干预后(例如，在提供第一部位特定治疗后；等等)，从使用者采集治疗后样本，其中治疗后样本与第二身体部位相关联(例如，包括肠道部位、皮肤部位、生殖器部位、口腔部位和鼻部位中的至少一处；等等)；基于与第二身体部位相关联的部位特定特征，为使用者确定阑尾相关病症的治疗后阑尾相关的特征；以及基于治疗后阑尾相关表征，为使用者促进与第二部位特定治疗相关的治疗干预(例如，向使用者提供第二部位特定的治疗，等等)，以促进阑尾相关病症的改善，其中第二部位特定治疗与第二身体部位相关联。
在一变体中，治疗可以包括一种或多种基于噬菌体的治疗(例如，以消耗品的形式，以局部给药治疗的形式，等等)，其中特定于受试者中代表性的某些细菌(或其它微生物)的一个或多个噬菌体群体(例如，以菌落形成单位计)，可以用于下调或以其它方式消除某些细菌群体。这样，基于噬菌体的治疗可以用于减少受试者中代表性的细菌的不期望群体的大小。附加地或可替代地，基于噬菌体的治疗可以用于增加未被使用的噬菌体的靶向细菌群体的相对丰度。然而，基于噬菌体的治疗可以以任何合适的方式用于调节微生物组的特征(例如，微生物组组成、微生物组功能，等等)，和/或可以用于任何合适的目的。
在变体中，治疗可包括一种或多种益生菌治疗和/或益生元治疗，该益生菌治疗和/或益生元治疗与本文所述任何合适的分类群(例如，与一种或多种阑尾相关病症相关联的微生物组组成特征，等等)中的至少一种或多种的任何组合(例如，包括一种或多种的任何组合、以任何合适的量和/或浓度、例如任何合适的相对量和/或浓度；等等)和/或以下的一种或多种相关联：棉子糖肠球菌(enterococcusraffinosus)、葡萄球菌属c9i2(staphylococcussp.c9i2)、孪生球菌属933-88(gemellasp.933-88)、肠球菌属si-4(enterococcussp.si-4)、嗜胆菌属4_1_30(bilophilasp.4_1_30)、厌氧棒状菌属5_1_63faa(anaerostipessp.5_1_63faa)、粪考拉杆菌(phascolarctobacteriumfaecium)、另支菌属rma9912(alistipessp.rma9912)、内脏臭杆菌、另支菌属hgb5(alistipessp.hgb5)、subdoligranulumvariabile、史氏甲烷杆菌(methanobrevibactersmithii)、乳杆菌属7_1_47faa(lactobacillussp.7_1_47faa)、普氏黄曲霉、佐治亚克吕沃尔菌(kluyverageorgiana)、粪布劳特氏菌(blautiafaecis)、普拉梭菌(faecalibacteriumprausnitzii)、长形乳杆菌、罗斯拜瑞氏菌属11se39(roseburiasp.11se39)、拟杆菌属ar29(bacteroidessp.ar29)、另支菌属nml05a004(alistipessp.nml05a004)、提蒙类普雷沃菌、厌氧棒状菌属3_2_56faa(anaerostipessp.3_2_56faa)、克雷伯氏菌属sor89(klebsiellasp.sor89)、巨球型菌属dnf00912(megasphaerasp.dnf00912)、殊异韦荣氏菌(veillonelladispar)、粘膜乳杆菌(lactobacillusmucosae)、脆弱拟杆菌(bacteroidesfragilis)、马肠链球菌(streptococcusequinus)、普通拟杆菌(bacteroidesplebeius)、丙酸杆菌属msp09a(propionibacteriumsp.msp09a)、巴氏链球菌(streptococcuspasteurianus)、厌氧弧菌属765(anaerovibriosp.765)、嗜粘蛋白-艾克曼菌(akkermansiamuciniphila)、放线菌图列茨亚种、阪崎肠杆菌(cronobactersakazakii)、黄绿脓杆菌、葡萄球菌、氨基酸球肠菌(acidaminococcusintestini)、颗粒丙酸杆菌(propionibacteriumgranulosum)、多形拟杆菌(bacteroidesthetaiotaomicron)、梭杆菌属cm21(fusobacteriumsp.cm21)、片球菌属mfc1(pediococcussp.mfc1)、血绿脓杆菌，胃八叠球菌(sarcinaventriculi)、megasphaeragenomosp.cl、链球菌属bs35a(streptococcussp.bs35a)、嗜热链球菌(streptococcusthermophilus)、溃疡梭杆菌(fusobacteriumulcerans)、摩氏摩根菌(morganellamorganii)、拟杆菌属slc1-38(bacteroidessp.slc1-38)、埃氏拟杆菌(bacteroideseggerthii)、鸡粪类杆菌、拟杆菌属cb57(bacteroidessp.cb57)、粪双歧杆菌(bifidobacteriumstercoris)、非典型韦荣氏菌(veillonellaatypica)、坏疽梭杆菌(fusobacteriumnecrogenes)、弯曲乳杆菌(lactobacilluscrispatus)、韦荣氏菌属msa12(veillonellasp.msa12)、asaccharosporairregularis、多枝梭菌(erysipelatoclostridiumramosum)、乳杆菌属tab-22(lactobacillussp.tab-22)、人类排泄性副沙门氏菌、乳杆菌属c4i2(lactobacillussp.c4i2)、拟杆菌属157(parabacteroidessp.157)、细金拟杆菌、alistipesputredinis和/或与任何合适的生物分类组相关联的任何其它合适的微生物(例如，来自本文所述的分类单元的微生物，例如微生物组特征相关的；与本文所述的功能特征相关联的分类单元，等等)。对于一种或多种益生菌治疗和/或其它合适的治疗，与给定分类组相关联的微生物和/或任何合适的微生物组合可以以10万到100亿个cfu的剂量和/或任何合适的量提供(例如，根据治疗模型而确定，所述模型可以预测患者微生物组在治疗响应中产生积极调节；不同分类单元的不同量；不同分类单元的相同或相似量；等等)。在一实例中，可以指示受试者根据他/她的一个或多个以下的定制方案摄取包括益生菌制剂的胶囊：生理学(例如体重指数、体重、身高)、人口统计学特征(例如性别、年龄)，营养不良的严重程度、对药物的敏感性以及其它任何合适的因素。在示例中，益生菌治疗和/或益生元治疗可以用于调节使用者微生物组(例如，与组成、功能相关的，等等)，以促进一种或多种阑尾相关病症的改善。在示例中，促进治疗干预可以包括向使用者推广(例如，推荐、通知使用者有关的、提供、给予、促进其获得收益，等等)一种或多种益生菌治疗和/或益生元治疗，例如以促进一种或多种阑尾相关病症的改善。
在益生菌治疗的一具体示例中，如图4所示，该治疗模型的候选治疗可以执行以下一项或多项：通过提供物理屏障(例如，通过定植抗力)，阻止病原体进入上皮细胞)、通过刺激杯状细胞诱导粘液屏障的形成、增强受试者上皮细胞之间的顶端紧密连接的完整性(例如，通过促进闭合小环蛋白1(zona-occludens1)的上调，通过防止紧密连接蛋白(tightjunctionprotein)的重新分布)、产生抗菌因子、刺激抗炎细胞因子的产生(例如，通过树突状细胞的信号传导和调节性t细胞的诱导)、触发免疫反应，和执行任何其它合适的、能够调整受试者的微生物组使其远离营养不良状态的功能。然而，可以以任何合适的方式来配置益生菌治疗和/或益生元治疗。
在另一具体示例中，治疗可以包括基于医疗设备的治疗(例如，与人类行为矫正相关联的，与疾病相关病症的治疗相关联的，等等)。
在变体中，治疗模型优选地以来自大的受试者群体的数据为基础，该受试者群体可以包括衍生自区块s110的微生物组多样性数据集的受试者群体，其中该微生物组组成和/或功能特征或健康状况，在暴露于各种治疗措施之前和之后都得到了很好的表征。此类数据可以用于训练和验证治疗提供模型，从而基于不同的阑尾相关表征，识别为受试者提供所需结果的治疗措施。在变体中，支持向量机，作为一种监督的机器学习算法，可以用于生成治疗提供模型。然而，上述任何其它合适的机器学习算法都可以促进治疗提供模型的生成。
附加地或可替代地，该治疗模型可以与识别“正常”或基线微生物组成和/或功能特征相关而衍生，如从一识别为健康状况良好的受试者群体中评估的受试者。在识别出表征为良好健康的受试者群体中的受试者的子集后(例如，使用表征处理的特征)，将微生物组分和/或功能特征调节为良好健康受试者中的那些治疗，可以在区块s140中生成。区块s140因此可以包括识别一种或多种基线微生物组组成和/或功能特征(例如，针对一组人口统计学特征中的每一个的一个基线微生物组)，和潜在治疗方式和治疗方案(其能将处于营养不良状态中的受试者的微生物组转变为识别的基线微生物组成和/或功能特征中的一种)。然而，可以以任何其它合适的方式来生成和/或改进治疗模型。
与益生菌治疗和/或益生元治疗(例如，与益生菌治疗相关联的，所述治疗由治疗促进系统应用的治疗模型确定，等等)相关联的微生物组成可以包括可培养(例如，能够扩大至提供可扩展的治疗)和/或非致死性(例如，其所需的治疗剂量为非致死性)的微生物。此外，微生物组成可以包括对受试者的微生物组有急性或缓和作用的单一类型的微生物。附加地或可替代地，微生物组成可以包括多种类型的微生物的平衡组合，其被配置为在驱使受试者的微生物组达到所需状态时相互配合。例如，益生菌治疗中多种细菌类型的组合可以包括第一类型细菌，该第一类型细菌产生第二类型细菌所用的产物，该第二类型细菌在积极地影响受试者的微生物组中具有很强的作用。附加地或可替代地，在益生菌治疗中，多种类型细菌的组合可以包括一些细菌类型，它们产生的蛋白质具有相同的功能，可以对受试者的微生物组产生积极影响。
益生菌和/或益生元组合物可以是天然的或合成衍生的。例如，在一应用中，益生菌组合物可以天然衍生自粪便或其它生物物质(例如，使用表征处理和治疗模型识别，具有基线微生物组组成和/或功能特征的一个或多个受试者)。附加地或可替代地，可以基于基线微生物组组成和/或功能特征，合成衍生(例如，使用台阶法(benchtopmethod)衍生)益生菌组合物。在变体中，可以用于益生菌治疗的微生物试剂可以包括一种或多种：酵母菌(例如，布拉酵母菌(saccharomycesboulardii))、革兰氏阴性菌(例如，大肠杆菌nissle(e.colinissle))、革兰氏阳性菌(例如，双歧双歧杆菌(bifidobacteriabifidum)、婴儿双歧杆菌(bifidobacteriainfantis)、鼠李糖乳杆菌(lactobacillusrhamnosus)、乳酸乳球菌(lactococcuslactis)、植物乳杆菌(lactobacillusplantarum)、嗜酸乳杆菌(lactobacillusacidophilus)、干酪乳杆菌(lactobacilluscasei)、发酵芽孢杆菌(bacilluspolyfermenticus)等)、和任何其它合适类型的微生物制剂。然而，益生菌治疗、益生元治疗和/或其它合适的治疗可以包括与本文所述的任何合适的分类群相关联的微生物的任何合适的组合，和/或可以以任何合适的方式配置治疗。
区块s140可以包括执行、存储、检索和/或以其它方式处理一种或多种治疗模型，所述治疗模型用于确定一种或多种治疗。处理一个或多个治疗模型优选地基于微生物组特征。例如，生成治疗模型可以基于与一种或多种阑尾相关病症、治疗相关方面(例如与微生物组特征相关的治疗功效，和/或其它合适的数据)相关联的微生物组特征。附加地或可替代地，处理治疗模型可以基于任何合适的数据。在一示例中，处理治疗模型可以包括基于一个或多个治疗模型、使用者微生物组特征(例如，将使用者微生物组特征值输入到一个或多个治疗模型等)、补充数据、(例如与治疗相关联的先前知识，例如与微生物相关代谢相关的；使用者病史；使用者人口统计学数据，例如描述人口统计学特征的，等等)、和/或任何其它合适的数据，为使用者确定一种或多种治疗。然而，处理治疗模型可以以任何合适的方式，基于任何合适的数据。
阑尾相关表征模型可以包括一种或多种治疗模型。在一示例中，确定一种或多种阑尾相关表征(例如，为一个或多个使用者，针对一种或多种阑尾相关病症，等等)，可以包括确定一种或多种治疗，例如基于一种或多种治疗模型，例如，应用一个或多个治疗模型，等等)、和/或其它合适的数据(例如，微生物组特征，例如使用者微生物组特征、微生物数据集，例如使用者微生物数据集，等等)。在一特定示例中，确定一种或多种阑尾相关表征可以包括为使用者确定第一阑尾相关表征(例如，描述一种或多种阑尾相关病症的倾向性；等等)；和基于第一阑尾相关病症，为该使用者确定第二阑尾相关表征(例如，基于一种或多种阑尾相关病症的倾向性，确定一种或多种治疗，例如向使用者推荐；等等)。在一特定示例中，阑尾相关表征可以包括倾向性相关数据(例如，诊断数据；相关联的微生物组组成、功能、多样性和/或其它特征；等等)和治疗相关数据(例如，推荐的治疗、潜在的治疗；等等)。然而，阑尾相关表征可以包括任何合适的数据(例如，本文所述数据的任何组合，等等)。
处理治疗模型可以包括处理多个治疗模型。例如，可以针对不同的治疗处理不同的治疗模型(例如，针对不同个体治疗的不同模型；针对治疗的不同组合和/或类别的不同模型，例如用于确定消耗品治疗的第一治疗模型和用于确定心理相关治疗的第二治疗模型；等等)。在一示例中，可以针对不同的阑尾相关病症处理不同的治疗模型，例如，针对不同个体阑尾相关病症的不同模型；针对阑尾相关病症的不同组合和/或类别的不同模型，等等)。附加地或可替代地，可以针对任何合适类型的数据和/或实体，执行(例如基于其；针对其处理不同的治疗模型；等等)处理多个治疗模型。然而，可以以任何合适的方式执行处理多个治疗模型，以及确定和/或应用一个或多个治疗模型可以以任何合适的方式执行。
4.4处理使用者生物样本。
方法100的实施例可以附加地或可替代地包括区块s150，该区块s150可以包括处理来自使用者的一种或多种生物样本(例如，来自使用者不同采集部位的生物样本，等等)。区块s150可以用于促进使用者生成微生物数据集，例如用于导出表征处理的输入，例如，如通过应用一种或多种阑尾相关表征模型，为使用者生成阑尾相关表征，等等)。这样，区块s150可以包括接收、处理和/或分析来自一个或多个使用者的一个或多个生物样本(例如，随着时间的推移，同一使用者的多个生物样本、不同使用者的不同生物样本，等等)。在区块s150中，优选地以非侵入性方式(non-invasivemanner)，从使用者和/或使用者的环境产生生物样本。在变体中，样本接收的非侵入性方式可以使用以下的任何一种或多种：渗透性基底(例如，配置为擦拭使用者身体区域的拭子、卫生纸、海绵，等等)、非渗透性基底(例如，载玻片、胶带，等等)、被配置为从使用者的身体区域接收样本的容器(例如，瓶子、试管、袋子，等等)和任何其它合适的样本接收元件。在一特定示例中，可以以非侵入性方式(例如，使用拭子和瓶子)，从使用者的鼻、皮肤、生殖器、口腔和肠道(例如，通过粪便样本，等等)中的一处或多处采集生物样本。然而，可以附加地或可替代地，以半侵入方式(semi-invasivemanner)或侵入方式(invasivemanner)接收生物样本。在变体中，样本接收的侵入性方式可以使用以下的任何一种或多种：针、注射器、活检元件、柳叶刀以及用于以半侵入性或侵入性方式采集样本的任何其它合适的仪器。在特定示例中，样本可以包括血液样本、血浆/血清样本(例如，使得能够提取无细胞的dna)和组织样本。
在以上变体和示例中，生物样本可以不通过另一实体(例如，与使用者相关联的看护人、医疗保健专业人员，自动化或半自动化样本采集装置，等等)的协助下从使用者的身体获取，也可以可替代地在另一实体的帮助下从使用者的身体获取。在一示例中，在样本提取过程中，没有其他实体帮助下从使用者处获取生物样本的情况下，可以将样本准备试剂盒提供给使用者。在该示例中，该试剂盒可以包括一个或多个用于获得样本的拭子、配置为接收该拭子的以进行存储的一个或多个容器、用于样本准备和设置使用者帐户的说明、配置为关联样本和使用者的元件(例如，条形码标识符、标签。等等)、接收器，所述接收器允许将来自使用者的样本递送到样本处理操作中，例如，通过邮件递送系统)。在另一示例中，在另一实体的帮助下从使用者处提取生物样本的情况下，可以在临床或研究环境中从使用者处采集一个或多个样本(例如，在临床预约期间)。然而，可以以任何其它合适的方式从使用者处接收生物样本。
此外，优选地以类似于实施例、变体和/或与上述区块s110相关的所述样本接收示例、和/或方法100和/或系统200实施例的任何其它合适部分之一的方式，执行来自使用者的生物样本的处理和分析(例如，以生成使用者微生物数据集，等等)。这样，区块s150中生物样本的接收和处理可以为使用者而执行，使用与那些用于接收和处理生物样本类似的处理，所述样本用于执行方法100的表征处理，例如以便提供处理的一致性。然而，可以附加地或可替代地以任何其它合适的方式来执行区块s150中生物样本的接收和处理。
4.5确定阑尾相关表征。
方法100的实施例可以附加地或可替代地包括区块s160，该区块s160可以包括利用一种或多种表征处理(例如，与区块s130相关的所述一个或多个表征处理，等等)，为使用者确定阑尾相关表征，例如基于处理衍生自使用者的生物样本的一个或多个微生物数据集(例如，使用者微生物序列数据集、微生物组组成数据集、微生物组功能多样性数据集；处理微生物数据集以提取使用者微生物组特征(例如，提取特征值，等等)，该使用者微生物组特征可以用于确定一种或多种阑尾相关表征；等等)。区块s160可以用于为使用者表征一种或多种阑尾相关病症，例如通过从使用者的微生物组衍生的数据中提取特征，以及使用该特征作为上述区块s130中描述的表征处理的实施例、变体或示例的输入(例如，使用使用者微生物组特征值作为与微生物组相关病症的表征模型的输入，等等)。在一示例中，区块s160可以包括基于使用者微生物组特征和阑尾相关病症模型(例如，在区块s130中生成)，为使用者生成阑尾相关表征。阑尾相关表征可以针对阑尾相关病症的任何数量和/或组合(例如，阑尾相关病症的组合、单个阑尾相关病症和/或其它合适的阑尾相关病症；等等)、使用者、采集部位和/或其它合适的实体。阑尾相关表征可以包括以下的一项或多项：诊断(例如，阑尾相关病症的存在或不存在；等等)；风险(例如，发生和/或存在阑尾相关病症的风险评分；关于阑尾相关表征的信息(例如，症状、体征、触发因素、相关病症，等等)；比较(例如，与其它亚组、群体、使用者、使用者的历史健康状况，例如历史微生物组组成和/或功能多样性的比较；与阑尾相关病症相关联的比较；等等)；治疗确定；与表征处理相关联的其它合适的输出；和/或任何其他合适的数据。
在另一变体中，阑尾相关表征可以包括微生物组多样性评分(例如，与微生物组组成、功能相关的，等等)，其与一种或多种阑尾相关病症相关联的微生物组多样性评分相关联(例如，与之相关；与之成负相关；与之成正相关；等等)。在示例中，阑尾相关表征可以包括随时间推移的微生物组多样性得分(例如，对随时间推移而采集使用者的多个生物学样本进行计算)、其他使用者的微生物组多样性评分的比较和/或任何其它合适类型的微生物组多样性评分。然而，可以以任何合适的方式来处理微生物组多样性评分(例如，确定微生物组多样性评分；使用微生物组多样性评分来确定和/或提供治疗；等等)。
在区块s160中确定阑尾相关表征优选地包括确定与使用者的微生物组组成和/或功能特征相关联的特征和/或特征的组合(例如，确定与使用者相关联的特征值，所述特征值对应于在区块s130中确定的微生物组特征，等等)，将特征输入至表征处理，以及接收将使用者表征为以下的一项或多项的输出：行为组别、性别组别、饮食组别、疾病状态组别，以及能够通过表征处理识别的任何其它合适的组别。区块s160可以附加地或可替代地包括与使用者表征相关联的置信度的生成和/或输出。例如，置信度可以衍生自用于生成该表征的特征的数量、用于生成该表征的特征的相对权重或等级、表征处理中偏差的测量和/或与表征处理方面相关联的任何其它合适的参数。然而，可以以任何合适的方式利用使用者微生物组特征，以生成任何合适的阑尾相关特征。
在一些变体中，从使用者的微生物数据集中提取的特征可以补充特征补充(例如，从为使用者采集的补充数据中提取的；例如，调查衍生的特征、病史衍生的特征、传感器数据，等等)，其中此类数据、使用者微生物组数据和/或其它合适的数据可以用于进一步完善的区块s130的表征处理、区块s160和/或方法100的实施例的其它合适部分。
确定阑尾相关表征优选地包括针对使用者(例如，基于使用者微生物数据集)、特征模型和/或其它合适的成分，提取和应用使用者微生物组特征(例如，使用者微生物组组成多样性特征；使用者微生物组功能多样性特征；提取特征值，等等)，例如通过采用区块s130中描述的过程、和/或通过采用本文所述的任何合适的方法。
在变体中，如图6所示，区块s160可以例如在网络界面、移动应用和/或任何其它合适的界面上呈现阑尾相关表征(例如，从表征中提取的信息；作为促进治疗干预的一部分；等等)，然而，信息的呈现可以以任何合适的方式执行。然而，使用者微生物数据集可以附加地或可替代地以任何其它合适的方式，用于增强方法100的模型，以及区块s160可以以任何合适的方式执行。
4.6促进治疗干预。
如图9所示，方法100的实施例可以附加地或可替代地包括区块s170，该区块s170可以包括为一个或多个使用者(例如，基于阑尾相关的特征和/或治疗模型)促进一种或多种阑尾相关病症的治疗干预(例如，推广治疗、提供治疗、促进治疗的提供，等等)。区块s170可用于为使用者推荐、推广、提供和/或以其它方式促进一种或多种治疗相关的治疗干预，例如将使用者的微生物组组成和/或功能多样性转变为期望的平衡状态(和/或以其它方式改善一种或多种阑尾相关病症的状态，等等)，该平衡状态与一种或多种阑尾相关病症相关。区块s170可以包括根据使用者的微生物组组成和功能特征，向使用者提供定制的治疗，其中定制的治疗可以包括微生物制剂，该微生物制剂被配置为纠正使用者(其具有所识别的特征)营养不良的特征。这样，基于训练的治疗模型，区块s140的输出可以用于直接向使用者推广定制的治疗制剂和方案(例如剂量、使用说明)。附加地或可替代地，治疗的提供可以包括推荐用于可用治疗措施(其配置为使微生物组组成和/或功能特征转变为期望状态)。在变体中，治疗可以包括以下的任何一种或多种：消耗品、局部治疗(例如洗剂、软膏、防腐剂等)、药物(例如与任何合适的药物类型和/或剂量相关联的药物等)、噬菌体、环境治疗、行为矫正(例如饮食改变治疗、减轻压力的治疗，与体育锻炼相关的治疗等)、诊断程序、其它医学相关的程序和/或与阑尾相关病症相关联的任何其它合适的治疗、消耗品可以包括以下的任何一种或多种：食品和/或饮品(例如益生菌和/或益生元食品和/或饮品，等等)、营养补品(例如维生素、矿物质、纤维、脂肪酸、氨基酸、益生元、益生菌，等等)、消耗性药物和/或其它任何合适的治疗措施。在一示例中，提供一种或多种治疗和/或以其它方式促进治疗干预，可包括在与一个或多个使用者相关联的一个或多个计算设备上(例如，在如网络应用的使用者界面上，在计算设备处呈现；等等)，向一个或多个使用者提供一种或多种治疗的推荐。
例如，根据治疗模型的输出，可商购的益生菌补充品的组合可以包括针对使用者的合适益生菌治疗。在另一示例中，方法100可以包括基于阑尾有关病症模型(例如，和/或使用者微生物组特征)，为使用者确定阑尾相关病症的阑尾相关病症风险；以及基于阑尾相关病症风险，向使用者推广治疗。
在一变体中，促进治疗干预可以包括推广诊断程序(例如，以促进阑尾相关病症的检测，其可以推动随后其它治疗的推广，例如调节使用者微生物组，以改善与一种或多种阑尾相关病症相关联的使用者健康状况；等等)。诊断程序可以包括以下的任何一项或多项：病史分析、影像学检查、细胞培养试验、抗体试验、皮肤点刺试验、斑贴试验、血液试验、挑战试验、执行方法100的实施例的部分和/或任何其它促进检测(例如观察、预测，等等)阑尾相关病症的合适程序。附加地或可替代地，可以将诊断设备相关的信息和/或其它合适的诊断信息作为补充数据集的一部分来处理(例如，与区块s120相关的，其中可以将这些数据用于确定和/或应用表征模型、治疗模型和/或其它合适的模型；等等)、和/或采集、使用、和/或以其它与方法100的实施例的任何合适部分相关的方式处理(例如为使用者管理诊断程序，用于监测与区块s180相关的治疗功效；等等)。
在另一变体中，区块s170可以包括推广基于噬菌体的治疗。更详细地，针对使用者中某些代表性细菌(或其它微生物)特异的噬菌体的一个或多个群体(例如，以菌落形成单位而言)，可以用于下调或以其它方式消除某些细菌群体。这样，基于噬菌体的治疗可以用于减少使用者中代表性细菌的不期望群体的大小。互补地，基于噬菌体的治疗可以用于增加未被使用的噬菌体靶向细菌种群相对丰度。
在另一变体中，促进治疗干预(例如，提供治疗，等等)可以包括向使用者提供有关推荐的治疗、其它治疗的形式、阑尾相关表征和/或其它合适数据的通知。在一特定示例中，向使用者提供治疗可以包括提供治疗建议(例如，基本上与为使用者提供通过阑尾相关表征得到的信息同时进行)和/或其它合适的治疗相关信息(例如，疗效；与其它个别使用者、使用者亚组和/或使用者群体的比较；治疗比较；历史治疗和/或与治疗相关的相关联的信息；心理治疗指导，例如认知行为治疗；等等)，例如通过在网络界面上呈现通知(例如，通过与使用者相关联并识别使用者的使用者帐户，等等)。可以通过执行配置为用于提供通知的应用程序、网络界面、和/或信息客户端的电子设备(例如，个人计算机、移动设备、平板电脑、可穿戴式、头戴式可穿戴式计算设备、腕戴式可穿戴式计算设备，等等)，向使用者提供通知。在一示例中，与使用者相关联的个人计算机或笔记本电脑的网络界面可以通过使用者，向使用者提供使用者账户的访问，其中该使用者账户包括有关使用者的阑尾相关表征、使用者微生物组方面的详细表征的信息(例如，与阑尾相关表征的相关性相关的；等等)、和/或有关建议的治疗措施的通知(例如，在区块s140和/或s170中生成的通知，等等)。在另一示例中，在个人电子设备(例如，智能电话、智能手表、头戴式智能设备)上执行的应用程序可以配置为提供关于通过区块s170的治疗模型而生成的治疗建议的通知(例如，在显示器上、以触觉方式，以听觉方式，等等)。通知和/或益生菌治疗可以附加地或可替代地通过与使用者相关联的实体(例如，看护人、配偶、重要的其他人、医疗保健专业人员，等等)而直接提供。在一些附加的变型中，可以附加地或可替代地将通知提供给与使用者相关联的实体(例如，医疗保健专业人员)，例如，其中该实体能够促进治疗的提供(例如，通过处方，通过进行治疗会议、通过使用计算设备的光学和/或音频传感器的数字远程医疗会议，等等)。然而，以任何合适的方式执行提供通知和/或以其它方式促进治疗。
4.7监测治疗效果。
如图7所示，该方法可以附加地或可替代地包括区块s180，该区块s180可以包括：随时间的推移，为使用者(例如，基于处理来自使用者的一系列生物样本)监测一种或多种治疗的效果和/或监测其它合适的成分(例如，微生物组特征，等等)。区块s180可以用于收集关于一种或多种治疗(例如，给定表征的使用者的治疗模型所建议的，等等)的积极作用、消极作用和/或缺乏效果，和/或监测微生物组特征的附加数据(例如，在一组时间点，为使用者评估微生物组组成和/或功能特征。等等)。
因此，在通过治疗模型促进的治疗过程中，对使用者进行监测(例如，在整个治疗过程中，通过接收和分析来自使用者的生物样本、通过在整个治疗过程中，接收来自使用者的调查衍生的数据)，来针对通过区块s130的表征处理提供的每个表征和在区块s140和s170中提供的每个推荐的治疗措施，生成治疗效果模型。
在区块s180中，可以提示使用者在结合该治疗的治疗方案的一个或多个关键时间点内，提供附加的生物样本、补充数据和/或其它合适的数据，以及该附加的生物样本可以被处理和分析(例如，以类似于区块s120相关所描述的方式)，以生成表征使用者微生物组组成和/或功能特征调制的度量。例如，与以下的一项或多项有关的度量：在较早的时间点，使用者微生物组中代表性的一个或多个分类组的相对丰度变化、使用者微生物组中特定分类组的代表的变化、使用者微生物组中细菌的第一分类组丰度和细菌的第二生物分类组丰度两者之间的比例、使用者微生物组中一个或多个功能族群的相对丰度的变化、以及可以用于从微生物组组成和/或功能特征变化中评估治疗效果的任何其它合适的度量。附加地或可替代地，来自使用者的、与使用者在治疗时的经历(例如，经历的副作用、个人改善评估、行为改变，症状改善，等等)有关的调查衍生的数据，可以用于确定在区块s180中的治疗效果。例如，方法100可以包括，接收来自使用者的治疗后生物样本；采集来自使用者的补充数据集，其中所述补充数据集描述使用者对治疗(例如，确定和推广的治疗)的依从性和/或其它合适的使用者特征(例如行为、病症，等等)；基于阑尾相关表征模型和治疗后生物样本，生成与阑尾相关病症相关的第一使用者的治疗后阑尾相关表征；基于治疗后阑尾相关表征(例如，基于治疗后阑尾相关表征与治疗前阑尾相关表征之间的比较；等等)和/或使用者对治疗的依从性(例如，基于与阑尾相关病症相关的使用者微生物组的阳性或阴性结果修改治疗；等等)，向使用者推广阑尾相关病症的更新治疗。附加地或可替代地，其它合适的数据(例如，描述与一种或多种阑尾相关病症相关联的使用者行为的补充数据；描述阑尾相关病症的补充数据，如观察到的症状，；等等)可以用于确定治疗后的表征(例如，与阑尾相关病症相关的治疗前至治疗后的变化程度；等等)、更新的治疗(例如，基于效果和/或对所推广治疗的依从性，确定更新的治疗，等等)。
在一示例中，方法100可以包括：采集补充数据(例如，调查衍生的数据；通知阑尾相关病症状态，如与症状严重性有关的；等等)；基于使用者微生物组特征和补充数据，确定使用者的阑尾相关表征；基于该阑尾相关表征，促进与阑尾相关病症治疗相关的治疗干预(例如，向使用者推广治疗，等等)；采集来自使用者的治疗后生物学样本(例如，在促进治疗干预之后；等等)；采集后续的补充数据(例如，至少包括第二调查衍生的数据和设备数据；等等)；基于后续的补充数据和与治疗后生物样本相关联的治疗后使用者微生物组特征，为使用者确定阑尾相关病症的治疗后阑尾相关表征。在该示例中，方法100可以包括：基于治疗后阑尾相关表征，为使用者提供更新治疗(例如，治疗的修改；不同的治疗；等等)相关的治疗干预，以改善阑尾相关病症，例如其中更新治疗可以包括以下至少一项：消耗品、设备相关的治疗、手术操作、心理相关联的治疗、行为改变治疗和环境因素改变治疗。在该示例中，确定治疗后阑尾相关表征可以包括：基于治疗后的微生物组特征，确定使用者的微生物组特征与参考微生物组特征之间的比较，该参考微生物组特征对应于使用者亚组，所述使用者亚组共享与阑尾相关疾病相关联的行为和环境因素(和/或其它合适的特征)中的至少一项，并且其中与更新治疗相关的促进治疗干预可以包括：向使用者呈现比较结果，以促进行为改变治疗和环境改变治疗和/或其它合适的治疗中的至少一种。然而，可以以任何合适的方式，与附加的生物样本、附加的补充数据和/或其它合适的附加数据相关地执行区块s180。
治疗效果，附加的生物样本的处理(例如，确定附加的阑尾相关表征、治疗，等等)、和/或阑尾相关病症相关的生物样本的持续采集、处理和分析相关联的其它合适方面，可以在任何合适的时间和频率下执行，以生成、更新和/或以其它方式处理模型(例如，表征模型、治疗模型，等等)和/或任何其它合适的目的(例如，作为与方法100的实施例其他部分相关联的输入端)。当然，可以以任何合适的方式执行区块s180。
当然，方法100的实施例可以包括任何其它合适的区块或步骤，其被配置为促进接收来自受试者生物样本、处理来自受试者的生物样本、分析衍生自生物样本的数据以及生成模型，该模型可以用于根据受试者的特定的微生物组组成和/或功能特征，提供定制的诊断和/或基于益生菌的治疗。
方法100和/或系统200的实施例可以包括各种系统组件和各种方法处理的每种组合和排列，包括任何变体(例如，实施例、变体、示例、特定示例、附图，等等)，其中方法100的实施例的部分和/或处理可以异步地(例如顺序地)、同时地(例如并列地)或以任何其它合适的顺序通过和/或使用一个或多个示例、元素、系统200的组件和/或其它方面和/或本文所述的其它实体来执行。
本文所述的任何变体(例如，实施例、变体、示例，特定示例、附图，等等)和/或本文所述的变体的任何部分可以附加地或可替代地组合、聚集、排除、使用、连续地执行、并列地执行和/或以其它方式应用。
方法100和/或系统200的实施例的一些部分可以至少部分地体现和/或实施为机器，该机器配置为接收存储计算机可读指令的计算机可读媒介。指令可以通过与该系统集成的计算机可执行的组件而执行。可以将计算机可读媒介存储在任何合适的计算机可读媒介上，例如ram、rom、闪存、eeprom、光学设备(cd或dvd)、硬盘驱动器、软盘驱动器或任何合适的设备。该计算机可执行组件可以是通用的处理器或专用的处理器，然而，任何合适的专用硬件或硬件/固件组合设备都可以可替代地或附加地执行指令。
如本领域技术人员将从之前的详细描述以及从附图和权利要求中认识到的，可以对方法100的实施例、系统200和/或变体进行修改和改变，而不脱离权利要求中定义的范围。
1.一种用于表征与微生物相关联的阑尾相关病症的方法，所述方法包括：
基于来自于一组受试者相关联的样本的微生物核酸，确定与该组受试者相关联的微生物序列数据集，其中所述样本包括至少一个与阑尾相关病症相关联的样本；
为该组受试者采集与阑尾相关病症相关联的补充数据；
基于所述微生物序列数据集，确定一组微生物组特征，所述组微生物组特征包括一组微生物组组成特征和一组微生物组功能特征中的至少一种；
基于所述补充数据和该组微生物组特征，生成阑尾相关表征模型，其中，所述阑尾相关表征模型与所述阑尾相关病症相关联；
基于所述阑尾相关表征模型，为使用者确定所述阑尾相关病症的相关表征；和
基于所述阑尾相关表征，向所述使用者提供助于阑尾相关病症改善的疗法。
2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述样本包括与肠道部位相关联的第一部位特定样本；其中，基于所述微生物序列数据集，确定该组微生物组特征，该组微生物组组成特征包括肠道部位和奈瑟球菌科(科)、粘液奈瑟球菌(种)、嗜性聚集杆菌(种)、单形拟杆菌(种)、普通拟杆菌(种)、狄氏副拟杆菌(种)、巨球型菌属(属)、变形菌门(门)、微球菌科(科)、嗜热链球菌(种)、副血链球菌(种)、孪生球菌属(属)、梭菌属(属)、龋齿放线菌(种)、放线菌目(目)、放线菌科(科)、β-变形菌纲(纲)、麻疹孪生球菌(种)、罗思氏菌属(属)、弯曲乳杆菌(种)、假单胞杆菌目(目)、草酸杆菌科(科)、伯克霍尔德氏菌目(目)、孪生球菌属933-88(种)、微球菌目(目)、产酸拟杆菌(种)、艰难杆菌属(属)、拟杆菌属ar20(种)、拟杆菌属ar29(种)、伯克霍尔德氏菌科(科)、丹毒丝菌科(科)、黄单胞菌目(目)、假单胞菌科(科)、放线菌属hal-1065(种)、肠道罗斯拜瑞氏菌(种)、紫单胞菌科(科)、沙特尔沃思菌属(属)、梭菌纲(纲)、梭菌目(目)、消化链球菌科(科)、消化球菌科(科)、肉杆菌科(科)、小杆菌属e2_20(种)、奈瑟球菌目(目)、巨球型菌属cl(种)、moryella(属)、互养菌门(门)、丹毒丝菌纲(纲)、丹毒丝菌目(目)、梭菌目科xiii.未知种(科)、罗斯拜瑞氏菌属11se39(种)、拟杆菌属d22(种)、互养菌纲(纲)、互养菌目(目)、互养菌科(科)、乳杆菌属tab-22(种)、黄杆菌属(属)、萨特氏菌科(科)、厌氧棒状菌属5_1_63faa(种)、链球菌属2011_oral_ms_a3(种)、韦荣氏球菌属2011_oral_vsa_d3(种)、大芬戈尔德菌属s9aa1-5(种)、弗氏杆菌属(属)、葡萄球菌属3348o2(种)、消化梭菌(属)、肠杆菌属(属)、不动杆菌属(属)、克雷伯氏菌属(属)、多形拟杆菌(种)、丁酸弧菌属(属)、坏疽梭杆菌(种)、草螺菌属(属)、织片草螺菌(种)、片球菌属(属)、大芬戈尔德菌(种)、blautiahansenii(种)、粪肠球菌(种)、乳酸乳球菌(种)、芽孢杆菌属(属)、艰难梭菌(种)、blautiacoccoides(种)、多枝梭菌(种)、融合魏斯氏菌(种)、植物乳杆菌(种)、副干酪乳杆菌(种)、青春双歧杆菌(种)、短双歧杆菌(种)、齿双歧杆菌(种)、动物双歧杆菌(种)、假小链双歧杆菌(种)、卵形拟杆菌(种)、泪腺嗜胨菌(种)、阴道厌氧球菌(种)、拉恩氏菌属(属)、沃氏嗜胆菌(种)、sneathiasanguinegens(种)、解琥珀酸菌属(属)、孢杆菌属(属)、瘤胃假丁酸弧菌(种)、魏斯氏菌属(属)、粪便拟杆菌(种)、鼠李糖乳杆菌(种)、泛菌属(属)、霍尔德曼氏菌属(属)、丝状霍尔德曼氏菌(种)、嗜热厌氧菌目(目)、没食子双歧杆菌(种)、白痢双歧杆菌(种)、明串珠菌科(科)、迟缓埃格特菌(种)、乳头状杆菌(属)、粪厌氧棒杆菌(种)、pseudoflavonifractorcapillosus(种)、厌氧杆菌属(属)、八迭球菌属(属)、少食八迭球菌(种)、颤螺菌属(属)、吉氏颤螺菌(种)、放线菌图列茨亚种(种)、anaerosinus(属)、纤毛菌属(属)、少食短杆菌(种)、乳杆菌属cr-609s(种)、嗜热厌氧杆菌科(科)、芽孢杆菌科(科)、gelria(属)、酸杆菌目(目)、马赛拟杆菌(种)、红环菌目(目)、人粪便厌氧菌(种)、alistipesfinegoldii(种)、颤螺菌科(科)、嗜胨菌属2002-38328(种)、hespellia(属)、拟杆菌属35ae37(种)、marvinbryantia(属)、运动厌氧芽孢杆菌(种)、厌氧菌(属)、卡他菌(属)、普氏黄曲霉(种)、嗜蛋白菌属(属)、粪罗斯拜瑞氏菌(种)、链球菌属s16-11(种)、拟杆菌属4072(种)、沙氏另支菌(种)、肠道拟杆菌(种)、长形乳杆菌(种)、鹤见双歧杆菌(种)、多雷类杆菌(种)、木糖降解拟杆菌(种)、克罗诺杆菌属(属)、异斯卡多维亚菌属(属)、异斯卡多维亚菌(种)、lactonifactor(属)、卡他杆菌科(科)、产液阿德勒克罗伊茨菌(种)、阿德勒克罗伊茨菌属(属)、另支菌属eba6-25cl2(种)、拟杆菌属eba5-17(种)、颤杆菌属(属)、帕梅莱氏戈尔戈登氏杆菌(种)、另支菌属nml05a004(种)、人类排泄性副沙门氏菌(种)、光冈菌属djf_rr21(种)、丁酸弧菌属(属)、粪双歧杆菌(种)、alistipesindistinctus(种)、戈登氏杆菌属(属)、阿氏厌氧菌(种)、克雷伯氏菌属b12(种)、另支菌属rma9912(种)、厌氧孢杆菌属(属)、粪拟杆菌(种)、布劳特氏菌属ser5(种)、中华拟杆菌(种)、嗜胆菌属4_1_30(种)、钙镁杆菌科(科)、肠杆菌属udc345(种)、双乳双歧杆菌(种)、嗜胨菌属1-14(种)、另支菌属hgb5(种)、拟杆菌属slc1-38(种)、乳杆菌属akhmro1(种)、克雷伯氏菌属sor89(种)、肠球菌属c6i11(种)、pseudoflavonifractor(属)、拟杆菌属dnlkv9(种)、巨球型菌属bv3c16-1(种)、粪杆菌属犬口分类群147(种)、弯曲短杆菌属ccug45114(种)、丁酸弧菌属214-4(种)、鼠李氏厌氧菌(种)、阴性球菌属s5-a15(种)、[collinsella]massiliensis[柯林斯氏菌]马赛种(种)、棒状杆菌属jw37(种)、罗斯拜瑞氏菌属499(种)、小杆菌属s7msr5(种)、厌氧球菌属s887-3(种)、大芬戈尔德菌属s8f7(种)、墨氏杆菌属s9pr-10(种)、嗜胨菌属s9pr-13(种)、拟杆菌属j1511(种)、棒状杆菌属713182/2012(种)、拉恩氏菌属bsp18(种)、肠单胞球菌属(属)、罗宾逊菌属knhs210(种)、立方假丝酵母(属)、粪性丁酸单胞菌(种)、senegalimassilia(属)、嗜胨菌属dnf00840(种)、romboutsia(属)和塞孔杜斯协概率菌(种)中的至少一个相关联的第一部位特定组成特征；其中，基于所述补充数据和所述第一部位特定组成特征，生成所述阑尾相关表征模型，包括生成第一部位特定阑尾相关表征模型；其中，基于第一个部位特定阑尾相关表征模型，确定所述阑尾相关表征，包括为使用者确定阑尾相关病症的相关表征。
3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，确定所述该组微生物特征包括：基于所述微生物序列数据集，确定该组微生物组特征；其中，该组微生物组功能特征包括肠道部位和神经退行性疾病、信号分子和相互作用、外源物质的生物降解和代谢、抗坏血酸和醛酸代谢、亨廷顿舞蹈病、磷酸肌醇代谢、丙酸盐代谢、淀粉和蔗糖代谢、己内酰胺降解、细胞运动和分泌、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸降解、色氨酸代谢、i型糖尿病、苯丙氨酸代谢、硒化合物代谢、赖氨酸降解、多环芳烃降解、多糖的生物合成和代谢、肾细胞癌、丁酸酯代谢、原核生物中的碳固定途径、柠檬酸循环(tca循环)、脂多糖的生物合成、rna转运、硫胺素代谢、1,1,1-三氯-2,2-双(4-氯苯基)乙烷(ddt)降解、电子转移载体、肌萎缩性侧索硬化症(als)、朊病毒病、甲苯降解和α-亚麻酸代谢中的至少一个相关联的部位特定功能特征；其中，基于所述补充数据、第一部位特定组成特征和部位特定功能特征，生成第一部位特定阑尾相关表征模型。
4.根据权利要求2所述的方法，还包括：
采集与皮肤部位、生殖器部位、口腔部位和鼻部位中的至少一个相关联的第二部位特定样本；
确定与皮肤部位、生殖器部位、口腔部位和鼻部位中的至少一个相关联的第二部位特定组成特征，其中所述第二部位特定组成特征与孪生球菌属(属)、非典型性韦荣氏菌(种)、害肺小杆菌(种)、弯曲乳杆菌(种)、叶杆菌科(科)、水小杆菌属(属)、厌氧菌(属)、双生厌氧菌(种)、苍白杆菌属(属)、克氏动弯杆菌(种)、纽氏放线菌(种)、解乳厌氧球菌(种)、约氏乳杆菌(种)、疣微菌目(目)、疣微菌门(门)、疣微菌纲(纲)、疣微菌科(科)、解琥珀酸菌(种)、奇异菌属f0209(种)、费氏棒状杆菌(种)、乳杆菌属akhmro1(种)、厌氧球菌9401487(种)、中生根瘤菌属(属)、罗伊氏乳杆菌(种)、巨球型菌属upii199-6(种)、乳杆菌属c30an8(种)、消化球菌属s9pr-12(种)、海链球菌(种)、莫拉氏菌科(科)、莫拉氏菌属(属)、艾肯菌属(属)、侵蚀艾肯菌(种)、漫游球菌属(属)、叶杆菌属(属)、殊异韦荣氏菌(种)、华德萨特菌(种)、懒惰约翰森菌(种)、产酸拟杆菌(种)、赫氏纤毛菌(种)、沙氏纤毛菌(种)、噬二氧化碳细胞菌属ahn9756(种)、伯杰菌属af14(种)、欧尔森氏菌属f0004(种)、拟杆菌属d22(种)、叶杆菌属t50(种)、放线菌属icm47(种)、梭杆菌属as2(种)、纤毛菌科(科)、丛毛单胞菌属(属)、消化链球菌属(属)、粘液放线菌(种)、龋齿放线菌(种)、双歧杆菌属(属)、双歧杆菌科(科)、红螺菌科(科)、双歧杆菌目(目)、肠道罗斯拜瑞氏菌(种)、海旋菌属(属)、长双歧杆菌(种)、杆菌属(属)、链球菌属11atha1(种)、萨特菌科(科)、黄杆菌属(属)、阪崎肠杆菌(种)、阴道厌氧球菌(种)、鞘脂杆菌纲(纲)、布鲁氏菌科(科)、鞘脂杆菌目(目)、艾克曼菌属(属)、嗜胨菌属gpaco18a(种)、柠檬酸杆菌属bw4(种)、克罗诺杆菌属(属)、棒状杆菌属jw37(种)、金黄色葡萄球菌(种)、短波单胞菌属(属)、柄杆菌科(科)、柄杆菌目(目)、嗜碱重氮营养厌氧杆菌(种)、厌氧芽胞杆菌属(属)、不动杆菌属wb22-23(种)、假单胞菌属(属)、奈瑟球菌科(科)、狄氏副拟杆菌(种)、普雷沃氏菌属(属)、普拉梭菌(种)、副血链球菌(种)、痤疮皮肤杆菌(种)、韦荣氏菌科(科)、纤毛菌属(属)、考拉杆菌属(属)、黄杆菌科(科)、代尔夫特菌属(属)、黄杆菌纲(纲)、普雷沃氏菌科(科)、毛螺菌科(科)、消化链球菌科(科)、杜尔氏菌属(属)、黄杆菌目(目)、奈瑟球菌目(目)、副拟杆菌属(属)、链球菌属口腔分类群g63(种)、氨基酸球菌科(科)、韦荣氏菌属cm60(种)、葡萄球菌属c9i2(种)、嗜糖嗜糖杆菌(种)、fusicatenibacter(属)、葡萄球菌3348o2(属)、粪副拟杆菌(属)、产气柯林斯菌(属)、嗜胨菌属1-14(属)、丙酸杆菌属kpl1844(属)、长亚甲基杆菌(属)和葡萄球菌属c5i16(属)中的至少一个相关联；
基于所述第二部位特定组成特征，生成第二部位特定阑尾相关表征模型；
从其他使用者采集使用者样本，所述使用者样本与皮肤部位、生殖器部位、口腔部位和鼻部位中的至少一处相关联；和
基于所述第二部位特定阑尾相关表征模型，为其他的使用者确定阑尾相关病症的相关表征。
5.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述样本包括与皮肤部位相关联的部位特定样本；其中，确定该组微生物组特征包括确定该组微生物组组成特征，该组微生物组组成特征包括与所述皮肤部位与假单胞菌属(属)、奈瑟球菌科(科)、狄氏副拟杆菌(种)、普雷沃氏菌属(属)、普拉梭菌(种)、副血链球菌(种)、痤疮皮肤杆菌(种)、韦荣氏菌科(科)、纤毛菌属(属)、考拉杆菌属(属)、黄杆菌科(科)、代尔夫特菌属(属)、黄杆菌纲(纲)、普雷沃氏菌科(科)、毛螺菌科(科)、消化链球菌科(科)、杜尔氏菌属(属)、黄杆菌目(目)、奈瑟球菌目(目)、副拟杆菌属(属)、链球菌属口腔分类群g63(种)、氨基酸球菌科(科)、韦荣氏菌属cm60(种)、葡萄球菌属c9i2(种)、纤毛菌科(科)、嗜糖嗜糖杆菌(种)、fusicatenibacter(属)、葡萄球菌3348o2(种)、粪副拟杆菌(种)、产气柯林斯菌(种)、鞘脂杆菌纲(纲)、鞘脂杆菌目(目)、嗜胨菌属1-14(种)、厌氧芽胞杆菌属(属)、丙酸杆菌属kpl1844(种)、长亚甲基杆菌(种)、葡萄球菌属c5i16(种)中的至少一个相关联的部位特定组成特征；其中，基于所述补充数据和所述部位特定组成特征，生成所述阑尾相关表征模型，包括生成所述部位特定阑尾相关表征模型；其中，所述确定阑尾相关表征包括：基于所述特定部位的阑尾相关表征模型，为使用者确定阑尾相关病症的相关表征。
6.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述样本包括与生殖器部位相关联的部位特定样本；其中，确定该组微生物组特征包括确定该组微生物组组成特征，该组微生物组组成特征包括与所述生殖器部位和孪生球菌属(属)、非典型性韦荣氏菌(种)、害肺小杆菌(种)、弯曲乳杆菌(种)、叶杆菌科(科)、水小杆菌属(属)、厌氧菌(属)、双生厌氧菌(种)、苍白杆菌属(属)、克氏动弯杆菌(种)、纽氏放线菌(种)、解乳厌氧球菌(种)、约氏乳杆菌(种)、疣微菌目(目)、疣微菌门(门)、疣微菌纲(纲)、疣微菌科(科)、解琥珀酸菌(种)、奇异菌属f0209(种)、费氏棒状杆菌(种)、乳杆菌属akhmro1(种)、厌氧球菌9401487(种)、中生根瘤菌属(属)、罗伊氏乳杆菌(种)、巨球型菌属upii199-6(种)、乳杆菌属c30an8(种)、消化球菌属s9pr-12(种)、海链球菌(种)中的至少一个相关联的部位特定组成特征；其中，生成所述阑尾相关表征模型包括：基于所述补充数据和特定部位的组分特征，生成部位特定阑尾相关表征模型；其中，确定阑尾相关表征包括：基于所述特定部位的阑尾相关表征模型，为使用者确定阑尾相关病症的相关表征。
7.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述样本包括与口腔部位相关联的部位特定样本；其中，确定该组微生物组特征包括确定该组微生物组组成特征，该组微生物组组成特征包括与所述口腔部位和莫拉氏菌科(科)、莫拉氏菌属(属)、艾肯菌属(属)、侵蚀艾肯菌(种)、漫游球菌属(属)、叶杆菌属(属)、殊异韦荣氏菌(种)、华德萨特菌(种)、懒惰约翰森菌(种)、产酸拟杆菌(种)、赫氏纤毛菌(种)、沙氏纤毛菌(种)、噬二氧化碳细胞菌属ahn9756(种)、伯杰菌属af14(种)、欧尔森氏菌属f0004(种)、拟杆菌属d22(种)、叶杆菌属t50(种)、放线菌属icm47(种)、梭杆菌属as2(种)和纤毛菌科(科)中的至少一个相关联的部位特定组成特征；其中，所述生成阑尾相关表征模型包括：基于所述补充数据和所述特定部位的组成特征，生成部位特定阑尾相关表征模型；其中，确定所述阑尾相关表征包括：基于部位特定的阑尾相关表征模型，为使用者确定阑尾相关病症的相关表征。
8.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述样本包括与鼻部位相关联的部位特定样本；其中，确定该组微生物组特征包括确定该组微生物组组成特征，该组微生物组组成特征包括与所述鼻部位和丛毛单胞菌属(属)、消化链球菌属(属)、粘液放线菌(种)、龋齿放线菌(种)、双歧杆菌属(属)、双歧杆菌科(科)、红螺菌科(科)、双歧杆菌目(目)、肠道罗斯拜瑞氏菌(种)、海旋菌属(属)、长双歧杆菌(种)、聚集杆菌属(属)、链球菌属11atha1(种)、萨特菌科(科)、黄杆菌属(属)、苍白杆菌属(属)、阪崎肠杆菌(种)、阴道厌氧球菌(种)、鞘脂杆菌纲(纲)、布鲁氏菌科(科)、鞘脂杆菌目(目)、艾克曼菌属(属)、嗜胨菌属gpaco18a(种)、柠檬酸杆菌属bw4(种)、克罗诺杆菌属(属)、棒状杆菌属jw37(种)、金黄色葡萄球菌(种)、短波单胞菌属(属)、柄杆菌科(科)、柄杆菌目(目)、嗜碱重氮营养厌氧杆菌(种)、厌氧芽胞杆菌属(属)和不动杆菌属wb22-23(种)中的至少一个相关联的部位特定组成特征；其中，生成所述阑尾相关表征模型包括：基于所述补充数据和所述特定部位的组成特征，生成部位特定阑尾相关表征模型；其中，确定所述阑尾相关表征包括：基于所述部位特定的阑尾相关表征模型，为使用者确定阑尾相关病症的相关表征。
9.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，确定该组微生物组特征包括确定与棉子糖肠球菌(种)、葡萄球菌属c9i2(种)、孪生球菌属933-88(种)、韦荣氏菌属(属)、γ-变形菌纲(纲)、肠球菌属si-4(种)、肠杆菌目(目)、肠杆菌科(科)、考拉杆菌属(属)、嗜臭菌(属)、瘤胃菌科(科)、氨基酸球菌科(科)、嗜胆菌属4_1_30(种)、厌氧棒状菌属5_1_63faa(种)、脱硫弧菌科(科)、粪考拉杆菌(种)、脱硫弧菌纲(纲)、粪杆菌属(属)、δ-变形菌纲(纲)、伯克霍尔德氏菌科(科)、另支菌属rma9912(种)、甲烷短杆菌属(属)、内脏臭杆菌(种)、另支菌属hgb5(种)、孪生球菌属(属)、subdoligranulumvariabile(种)、史氏甲烷短杆菌(种)、intestinimonas(属)、乳杆菌属7_1_47faa(种)、甲烷杆菌科(科)、嗜胆菌属(属)、甲烷杆菌目(目)、梭菌科(科)、广古菌门(门)、甲烷杆菌纲(纲)、普氏黄曲霉(种)、肉杆菌科(科)、克吕沃尔氏菌属(属)、佐治亚克吕沃尔氏菌(种)、粪布劳特氏菌(种)、普氏粪杆菌(种)、长形乳杆菌(种)、罗斯拜瑞氏菌属11se39(种)、拟杆菌属ar29(种)、柯林斯氏菌属(属)、另支菌nml05a004(种)、提蒙类普雷沃菌(种)、厌氧棒状菌属(属)、lactonifactor(属)、厌氧棒状菌属3_2_56faa(种)、红蝽杆菌科(科)、克雷伯氏菌属sor89(种)、巨球型菌属dnf00912(种)、殊异韦荣氏菌(种)、粘膜乳杆菌(种)、脆弱拟杆菌(种)、马肠链球菌(种)、普通拟杆菌(种)、丙酸杆菌属msp09a(种)、巴氏链球菌(种)、厌氧弧菌属765(种)、嗜粘蛋白-艾克曼菌(种)、放线菌图列茨亚种(种)、阪崎肠杆菌(种)、黄绿脓杆菌(种)、葡萄球菌(种)、氨基酸球肠菌(种)、颗粒丙酸杆菌(种)、多形拟杆菌(种)、梭菌属cm21(种)、片球菌属mfc1(种)、血绿脓杆菌(种)、胃八叠球菌(种)、巨球型菌属c1(种)、链球菌属bs35a(种)、嗜热链球菌(种)、溃疡梭菌(种)、摩氏摩根氏菌(种)、拟杆菌属slc1-38(种)、埃氏拟杆菌(种)、鸡粪类杆菌(种)、拟杆菌属cb57(种)、粪双歧杆菌(种)、非典型韦荣氏菌(种)、坏疽梭杆菌(种)、弯曲乳杆菌(种)、韦荣氏菌属msa12(种)、asaccharosporairregularis(种)、多枝梭菌(种)、乳杆菌属tab-22(种)、人类排泄性副沙门氏菌(种)、乳杆菌属c4i2(种)、拟杆菌属157(种)、克雷伯氏菌属(属)、刺骨鱼菌属(属)、链球菌属(属)、丙酸杆菌属(属)、克罗诺杆菌属(属)、厌氧弧菌属(属)、肠杆菌(属)、葡萄球菌属(属)、苏黎世杆菌属(属)、拟普雷沃氏菌属(属)、片球菌属(属)、摩根氏菌属(属)、氨基酸球菌属(属)、琥珀酸弧菌属(属)、细杆菌属(属)、巨球型菌属(属)、asaccharospora(属)、丁酸弧菌属(属)、大芬戈尔德菌属(属)、厌氧球菌属(属)、链球菌科(科)、丙酸杆菌科(科)、韦荣氏菌科(科)、葡萄球菌科(科)、鞘脂杆菌科(科)、梭菌目科xi.未知种(科)、消化链球菌科(科)、琥珀酸弧菌科(科)、皮杆菌科(科)、棒状杆菌科(科)、红螺菌科(科)、硒单胞菌(目)、乳杆菌目(目)、梭菌目(目)、黄色单胞菌目(目)、芽孢杆菌目(目)、宽球藻目(目)、气单胞菌目(目)、假单胞菌目(目)、芽孢杆菌纲(纲)、negativicutes(纲)、梭菌纲(纲)、变形菌门(门)、蓝细菌(门)、细金拟杆菌(种)、alistipesputredinis(种)、放线菌纲(纲)、乳杆菌科(科)、双歧杆菌科(科)、双歧杆菌属(属)、双歧杆菌目(目)和颤螺菌科(科)中的至少一个相关联的该组微生物组组成特征；其中，生成所述阑尾相关表征模型包括：基于所述补充数据和该组微生物组组成特征，生成所述阑尾相关表征模型。
10.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，确定所述微生物序列数据集包括：基于微生物核酸的至少一个子集，确定宏基因组文库和宏转录组文库中的至少一个；其中，确定该组微生物组特征包括：基于宏基因组文库和宏转录组文库中的至少一个，确定该组微生物组特征。
11.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，基于微生物序列数据集，确定所述一组微生物组特征包括使用一套分析技术来确定其存在的微生物组组成多样性特征和微生物组功能多样性特征中的至少一个、其不存在的微生物组组成多样性特征和微生物组功能多样性特征中的至少一个、描述与阑尾相关病症相关联的不同分类组的相对丰度的相对丰度特征、描述与不同分类组相关联的至少两个微生物组特征之间比例的比例特征、描述不同分类组之间相互作用的相互作用特征、和描述不同分类组之间系统发育距离的系统发育距离特征；其中，该组分析技术包括单变量统计测试、多变量统计测试、降维技术和人工智能方法中的至少一项。
12.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述治疗包括消耗品、设备相关的治疗、外科手术、心理相关联的治疗和行为矫正治疗中的至少一种；其中，提供所述治疗包括在与使用者相关联的计算设备上，给使用者提供治疗的推荐。
13.一种用于表征与微生物相关联的阑尾相关病症的方法，所述方法包括：
从使用者采集样本，其中所述样本包括微生物核酸，所述微生物核酸对应于与阑尾相关病症相关联的微生物；
基于所述样本的微生物核酸，确定与使用者相关联的微生物数据集；
基于所述微生物数据集，确定使用者微生物组特征，所述使用者微生物组特征包括使用者微生物组组成特征和使用者微生物组功能特征中的至少一项；其中，所述使用者微生物组特征与阑尾相关病症相关联；
基于所述使用者微生物组特征，为使用者确定阑尾相关病症的相关表征；和
基于所述阑尾相关表征，促进与使用者的治疗相关的治疗干预，以促进阑尾相关病症的改善。
14.根据权利要求13所述的方法，其特征在于，确定所述使用者微生物组特征包括：基于所述微生物数据集，确定所述使用者微生物组组成特征，所述使用者微生物组组成特征包括肠道部位与：奈瑟球菌科(科)、粘液奈瑟球菌(种)、嗜性聚集杆菌(种)、单形拟杆菌(种)、普通拟杆菌(种)、狄氏副拟杆菌(种)、巨球型菌属(属)、变形杆菌门(门)、微球菌科(科)、嗜热链球菌(种)、副血链球菌(种)、孪生球菌属(属)、梭菌属(属)、龋齿放线菌(种)、放线菌目(目)、放线菌科(科)、β-变形杆菌纲(纲)、麻疹孪生球菌(种)、罗氏菌属(属)、弯曲乳杆菌(种)、假单胞菌目(目)、草酸杆菌科(科)、伯克霍尔德氏菌目(目)、孪生球菌属933-88(种)、微球菌目(目)、产酸拟杆菌(种)、艰难杆菌属(属)、拟杆菌属ar20、拟杆菌属ar29(种)、伯克霍尔德氏菌科(科)、丹毒丝菌科(科)、黄色单胞菌目(目)、假单胞菌科(科)、放线菌属口腔株hal-1065(种)、肠道罗斯拜瑞氏菌(种)、紫单胞菌科(科)、沙特尔沃思菌属(属)、梭菌纲(纲)、梭菌目(目)、消化链球菌科(科)、消化球菌科(科)、肉杆菌科(科)、小杆菌属e2_20(种)、奈瑟球菌目(目)、巨球型菌属c1(种)、moryella(属)、互养菌门(门)、丹毒丝菌纲(纲)、丹毒丝菌目(目)、梭菌目科xiii.未知种(科)、罗斯拜瑞氏菌属11se39(种)、拟杆菌属d22(种)、互养菌纲(纲)、互养菌目(目)、互养菌科(科)、乳杆菌属tab-22(种)、黄杆菌属(属)、萨特菌科(科)、厌氧棒状菌属5_1_63faa(种)、链球菌属2011_oral_ms_a3(种)、韦荣氏菌属2011_oral_vsa_d3(种)、大芬戈尔德菌属s9aa1-5(种)、弗氏杆菌属(属)、葡萄球菌属3348o2(种)、消化梭菌(属)、肠杆菌属(属)、不动杆菌属(属)、克雷伯氏菌属(属)、多形拟杆菌(种)、丁酸弧菌属(属)、坏疽梭杆菌(种)、草螺菌属(属)、织片草螺菌(种)、片球菌属(属)、大芬戈尔德菌(种)、blautiahansenii(种)、粪肠球菌(种)、乳酸乳球菌(种)、芽孢杆菌属(属)、艰难梭菌(种)、blautiacoccoides(种)、多枝梭菌(种)、融合魏斯氏菌(种)、植物乳杆菌(种)、副干酪乳杆菌(种)、青春双歧杆菌(种)、短双歧杆菌(种)、齿双歧杆菌(种)、动物双歧杆菌(种)、假小链双歧杆菌(种)、卵形拟杆菌(种)、蛋白胨泪菌(种)、阴道厌氧球菌(种)、拉恩氏菌属(属)、沃氏嗜胆菌(种)、sneathiasanguinegens(种)、解琥珀酸菌属(属)、孢菌属(属)、瘤胃假丁酸弧菌(种)、魏斯氏菌属(属)、粪便拟杆菌(种)、鼠李糖乳杆菌(种)、泛菌属(属)、霍尔德曼氏菌属(属)、丝状霍尔德曼氏菌(种)、耐热厌氧细菌目(目)、没食子双歧杆菌(种)、白痢双歧杆菌(种)、明串珠菌科(科)、迟缓埃格特菌(种)、乳头状杆菌(属)、粪厌氧棒杆菌(种)、pseudoflavonifractorcapillosus(种)、厌氧杆菌属(属)、八迭球菌属(属)、少食八迭球菌(种)、颤螺菌属(属)、吉氏颤螺菌(种)、放线菌图列茨亚种(种)、anaerosinus(属)、纤毛菌属(属)、少食短杆菌(种)、乳杆菌属cr-609s(种)、耐热厌氧细菌科(科)、芽孢杆菌科(科)、gelria(属)、酸杆菌目(目)、马赛拟杆菌(种)、红环菌目(目)、人粪便厌氧菌(种)、alistipesfinegoldii(种)、颤螺菌科(科)、嗜胨菌属2002-38328(种)、hespellia(属)、拟杆菌属35ae37(种)、marvinbryantia(属)、运动厌氧芽孢杆菌(种)、厌氧菌(属)、卡他菌(属)、普氏黄曲霉(种)、嗜蛋白菌属(属)、粪罗斯拜瑞氏菌(种)、链球菌属s16-11(种)、拟杆菌属4072(种)、沙氏另支菌(种)、肠杆菌(种)、长形乳杆菌(种)、鹤见双歧杆菌(种)、多雷类杆菌(种)、木糖降解拟杆菌(种)、克罗诺杆菌属(属)、异斯卡多维亚菌属(属)、异斯卡多维亚菌(种)、lactonifactor(属)、卡他杆菌科(科)、产液阿德勒克罗伊茨菌(种)、阿德勒克罗伊茨菌属(属)、另支菌属eba6-25cl2(种)、拟杆菌属eba5-17(种)、颤杆菌属(属)、帕梅莱氏戈尔戈登氏杆菌(种)、另支菌属nml05a004(种)、人类排泄性副沙门氏菌(种)、光冈菌属djf_rr21(种)、丁酸弧菌属(属)、粪双歧杆菌(种)、alistipesindistinctus(种)、戈登氏杆菌属(属)、阿氏厌氧菌(种)、克雷伯氏菌属b12(种)、另支菌属rma9912(种)、厌氧孢杆菌属(属)、粪拟杆菌(种)、布劳特氏菌属ser5(种)、中华拟杆菌(种)、嗜胆菌属4_1_30(种)、钙镁杆菌科(科)、肠杆菌属udc345(种)、双乳双歧杆菌(种)、嗜胨菌属1-14(种)、另支菌属hgb5(种)、拟杆菌属slc1-38(种)、乳杆菌属akhmro1(种)、克雷伯氏菌属sor89(种)、肠球菌属c6i11(种)、pseudoflavonifractor(属)、拟杆菌属dnlkv9(种)、巨球型菌属bv3c16-1(种)、粪杆菌属犬口分类群147(种)、弯曲短杆菌属ccug45114(种)、丁酸弧菌属214-4(种)、鼠李氏厌氧菌(种)、阴性球菌属s5-a15(种)、[collinsella]massiliensis[柯林斯氏菌]马赛种(种)、棒状杆菌属jw37(种)、罗斯拜瑞氏菌属499(种)、小杆菌属s7msr5(种)、厌氧球菌属s887-3(种)、大芬戈尔德菌属s8f7(种)、墨氏杆菌属s9pr-10(种)、嗜胨菌属s9pr-13(种)、拟杆菌属j1511(种)、棒状杆菌属713182/2012(种)、拉恩氏菌属bsp18(种)、肠单胞球菌属(属)、罗宾逊菌属knhs210(种)、立方假丝酵母(属)、粪性丁酸单胞菌(种)、senegalimassilia(属)、嗜胨菌属dnf00840(种)、romboutsia(属)和塞孔杜斯协概率菌(种)中的至少一个相关联的部位特定组成特征；其中，，确定所述阑尾相关表征包括：基于所述部位特定组成特征，为使用者确定阑尾相关病症的相关表征。
15.根据权利要求13所述的方法，其特征在于，确定所述使用者微生物组特征包括：基于所述微生物数据集，确定所述使用者微生物组组成特征，所述使用者微生物组成特征包括皮肤部位与假单胞菌属(属)、奈瑟球菌科(科)、狄氏副拟杆菌(种)、普雷沃氏菌属(属)、普拉梭菌(种)、副血链球菌(种)、痤疮皮肤杆菌(种)、韦荣氏菌科(科)、纤毛菌属(属)、考拉杆菌属(属)、黄杆菌科(科)、代尔夫特菌属(属)、黄杆菌纲(纲)、普雷沃氏菌科(科)、毛螺菌科(科)、消化链球菌科(科)、杜尔氏菌属(属)、黄杆菌目(目)、奈瑟球菌目(目)、副拟杆菌属(属)、链球菌属口腔分类群g63(种)、氨基酸球菌科(科)、韦荣氏菌属cm60(种)、葡萄球菌属c9i2(种)、纤毛菌科(科)、嗜糖嗜糖杆菌(种)、fusicatenibacter(属)、葡萄球菌3348o2(种)、粪副拟杆菌(种)、产气柯林斯菌(种)、鞘脂杆菌纲(纲)、鞘脂杆菌目(目)、嗜胨菌属1-14(种)、厌氧芽胞杆菌属(属)、丙酸杆菌属kpl1844(种)、长亚甲基杆菌(种)、葡萄球菌属c5i16(种)中至少一个相关联部位特定的组成特征；其中，，确定所述阑尾相关表征包括：基于部位特定组成特征，为使用者确定阑尾相关病症的相关表征。
16.根据权利要求13所述的方法，其特征在于，确定所述使用者微生物组特征包括：基于所述微生物数据集，确定所述使用者微生物组组成特征，所述使用者微生物组成特征包括生殖器部位与孪生球菌属(属)、非典型性韦荣氏菌(种)、害肺小杆菌(种)、弯曲乳杆菌(种)、叶杆菌科(科)、水杆菌属(属)、厌氧菌(属)、双生厌氧菌(种)、苍白杆菌属(属)、克氏动弯杆菌(种)、纽氏放线菌(种)、解乳厌氧球菌(种)、约氏乳杆菌(种)、疣微菌目(目)、疣微菌门(门)、疣微菌纲(纲)、疣微菌科(科)、解琥珀酸菌(种)、奇异菌属f0209(种)、费氏棒状杆菌(种)、乳杆菌属akhmro1(种)、厌氧球菌9401487(种)、中生根瘤菌属(属)、罗伊氏乳杆菌(种)、巨球型菌属upii199-6(种)、乳杆菌属c30an8(种)、消化球菌属s9pr-12(种)、海链球菌(种)中至少一个相关联的部位特定组成特征；其中，确定所述阑尾相关表征包括：基于所述部位特定组成特征，为使用者确定阑尾相关病症的相关表征。
17.根据权利要求13所述的方法，其特征在于，确定所述使用者微生物组特征包括：基于所述微生物数据集，确定所述使用者微生物组组成特征，所述使用者微生物组成特征包括口腔部位与莫拉氏菌科(科)、莫拉氏菌属(属)、艾肯菌属(属)、侵蚀艾肯菌(种)、漫游球菌属(属)、叶杆菌属(属)、殊异韦荣氏菌(种)、华德萨特菌(种)、懒惰约翰森菌(种)、酸性拟杆菌(种)、赫氏纤毛菌(种)、沙氏纤毛菌(种)、噬二氧化碳细胞菌属ahn9756(种)、伯杰菌属af14(种)、欧尔森氏菌属f0004(种)、拟杆菌属d22(种)、叶杆菌属t50(种)、放线菌属icm47(种)、梭杆菌属as2(种)和纤毛菌科(科)中的至少一个相关联的部位特定组成特征；其中，确定所述阑尾相关表征包括：基于所述部位特定组成特征，为使用者确定阑尾相关病症的相关表征。
18.根据权利要求13所述的方法，其特征在于，确定所述使用者微生物组特征包括：基于所述微生物数据集，确定所述使用者微生物组组成特征，所述使用者微生物组成特征包括鼻部位与丛毛单胞菌属(属)、消化链球菌属(属)、粘性放线菌(种)、龋齿放线菌(种)、双歧杆菌属(属)、双歧杆菌科(科)、红螺菌科(科)、双歧杆菌目(目)、肠道罗斯拜瑞氏菌(种)、海旋菌属(属)、长双歧杆菌(种)、聚集杆菌属(属)、链球菌属11atha1(种)、萨特菌科(科)、黄杆菌属(属)、苍白杆菌属(属)、阪崎肠杆菌(种)、阴道厌氧球菌(种)、鞘脂杆菌纲(纲)、布鲁氏菌科(科)、鞘脂杆菌目(目)、艾克曼菌属(属)、嗜胨菌属gpaco18a(种)、柠檬酸杆菌属bw4(种)、克罗诺杆菌属(属)、棒状杆菌属jw37(种)、金黄色葡萄球菌(种)、短波单胞菌属(属)、柄杆菌科(科)、柄杆菌目(目)、嗜碱重氮营养厌氧杆菌(种)、厌氧芽胞杆菌属(属)和不动杆菌属wb22-23(种)中的至少一个相关联的部位特定组成特征；其中，确定所述阑尾相关表征包括：基于部位特定组成特征，为使用者确定阑尾相关病症的相关表征。
19.根据权利要求13所述的方法，其特征在于，确定所述使用者微生物组特征包括：基于所述微生物数据集，确定与神经退行性疾病、信号分子和相互作用、外源物质的生物降解和代谢、抗坏血酸和醛酸代谢、亨廷顿舞蹈病、磷酸肌醇代谢、丙酸盐代谢、淀粉和蔗糖代谢、己内酰胺降解、细胞运动和分泌、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸降解、色氨酸代谢、i型糖尿病、苯丙氨酸代谢、硒化合物代谢、赖氨酸降解、多环芳烃降解、多糖的生物合成和代谢、肾细胞癌、丁酸酯代谢、原核生物中的碳固定途径、柠檬酸循环(tca循环)、脂多糖的生物合成、rna转运、硫胺素代谢、1,1,1-三氯-2,2-双(4-氯苯基)乙烷(ddt)降解、电子转移载体、肌萎缩性侧索硬化症(als)、朊病毒病、甲苯降解、α-亚麻酸代谢、[v]防御机制、[o]翻译后修饰、蛋白质转换和伴侣、[r]仅一般功能预测、[i]脂质转运和代谢、[h]辅酶转运和代谢、能量代谢、神经系统、信号转导、细胞过程和信号转导、翻译、代谢、细胞生长和死亡、内分泌系统、氨基酸代谢、辅因子和维生素的代谢、复制和修复、萜类化合物和聚酮化合物的代谢、传染病、氨基酸相关的酶、光合作用、泛酸和coa生物合成、光合作用蛋白、谷氨酸能突触、结核病、两组分系统、氨基酰基-trna生物合成、核糖体、其它离子偶联转运体、萜类骨架生物合成、细胞周期-柄杆菌属、其它转运体、碱基切除修复、肽聚糖生物合成、霍乱弧菌致病周期、柠檬烯和蒎烯降解、分泌系统、核苷酸切除修复、翻译因子、丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢、核糖体生物发生、其它(kegg3)、真核生物中的核糖体生物发生、聚酮糖单元生物合成、链霉素生物合成、同源重组、氧化磷酸化、未知功能、光合生物的固碳作用、细胞骨架蛋白、dna修复和重组蛋白、无机离子转运和代谢、氨基酸代谢、香叶醇降解、蛋白质输出、苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸生物合成、赖氨酸生物合成、乙苯降解、转录机制、rna聚合酶、万古霉素类抗生素生物合成、错配修复、萘降解、嘧啶代谢、d-谷氨酰胺和d-谷氨酸代谢、玉米素生物合成、k02004(kegg4)和k03100(kegg4)中至少一项相关联的所述使用者微生物组功能特征；其中，确定所述阑尾相关表征包括：基于所述使用者微生物组功能特征，为使用者确定阑尾相关病症的相关表征。
20.根据权利要求13所述的方法，其特征在于，所述治疗包括益生菌治疗和益生元治疗中的至少一种；其中，促进治疗干预包括向使用者推广所述益生菌治疗和益生元治疗中的至少一种，以促进阑尾相关病症的改善；其中，益生菌治疗和益生元治疗中的至少一种与棉子糖肠球菌(种)、葡萄球菌属c9i2(种)、孪生球菌属933-88(种)、肠球菌属si-4、嗜胆菌属4_1_30、厌氧棒状菌属5_1_63faa、粪考拉杆菌、另支菌属rma9912、内脏臭杆菌、另支菌属hgb5、subdoligranulumvariabile、史氏甲烷杆菌、乳杆菌属7_1_47faa、普氏黄曲霉、佐治亚克吕沃尔菌、粪布劳特氏菌、普拉梭菌、长形乳杆菌、罗斯拜瑞氏菌属11se39、拟杆菌属ar29、另支菌属nml05a004、提摩宁普雷沃菌、厌氧棒状菌属3_2_56faa、克雷伯氏菌属sor89、巨球型菌属dnf00912、殊异韦荣氏菌、粘膜乳杆菌、脆弱拟杆菌、马肠链球菌、普通拟杆菌、丙酸杆菌属msp09a、巴氏链球菌、厌氧弧菌属765、嗜粘蛋白-艾克曼菌、放线菌图列茨亚种、阪崎肠杆菌、黄绿脓杆菌、葡萄球菌、氨基酸球肠菌、颗粒丙酸杆菌、多形拟杆菌、梭杆菌属cm21、片球菌属mfc1、血绿脓杆菌、胃八叠球菌、megasphaeragenomo属cl、链球菌属bs35a、嗜热链球菌、溃疡梭杆菌、摩氏摩根菌、拟杆菌属slc1-38、埃氏拟杆菌、鸡粪类杆菌、拟杆菌属cb57、粪双歧杆菌、非典型韦荣氏菌、坏疽梭杆菌、弯曲乳杆菌、韦荣氏菌属msa12、asaccharosporairregularis、多枝梭菌、乳杆菌属tab-22、人类排泄性副沙门氏菌、乳杆菌属c4i2、拟杆菌属157、细金拟杆菌、和alistipesputredinis中的至少一个相关联。
21.一种用于表征与微生物相关联的阑尾相关病症的方法，所述方法包括：
从使用者采集样本，其中所述样本包括微生物核酸，所述微生物核酸对应于与阑尾相关病症相关联的微生物；
基于所述样本的微生物核酸，确定与使用者相关联的微生物数据集；
基于所述微生物数据集，确定使用者微生物组特征，其中所述使用者微生物组特征与阑尾相关病症相关联；和
基于所述使用者微生物组特征，为使用者确定阑尾相关病症的相关表征。
22.根据权利要求21所述的方法，其特征在于，所述使用者微生物组特征包括与孪生球菌属(属)、非典型性韦荣氏菌(种)、害肺小杆菌(种)、弯曲乳杆菌(种)、叶杆菌科(科)、水小杆菌属(属)、厌氧菌(属)、双生厌氧菌(种)、苍白杆菌属(属)、克氏动弯杆菌(种)、纽氏放线菌(种)、解乳厌氧球菌(种)、约氏乳杆菌(种)、疣微菌目(目)、疣微菌门(门)、疣微菌纲(纲)、疣微菌科(科)、解琥珀酸菌(种)、奇异菌属f0209(种)、费氏棒状杆菌(种)、乳杆菌属akhmro1(种)、厌氧球菌9401487(种)、中生根瘤菌属(属)、罗伊氏乳杆菌(种)、巨球型菌属upii199-6(种)、乳杆菌属c30an8(种)、消化球菌属s9pr-12(种)、海链球菌(种)、奈瑟球菌科(科)、粘液奈瑟球菌(种)、嗜性聚集杆菌(种)、单形拟杆菌(种)、普通拟杆菌(种)、狄氏副拟杆菌(种)、巨球型菌属(属)、变形杆菌门(门)、微球菌科(科)、嗜热链球菌(种)、副血链球菌(种)、梭菌属(属)、龋齿放线菌(种)、放线菌目(目)、放线菌科(科)、β-变形杆菌纲(纲)、麻疹孪生球菌(种)、罗氏菌属(属)、假单胞菌目(目)、草酸杆菌科(科)、伯克霍尔德氏菌目(目)、孪生球菌属933-88(种)、微球菌目(目)、产酸拟杆菌(种)、艰难杆菌属(属)、拟杆菌属ar20(种)、拟杆菌属ar29(种)、伯克霍尔德氏菌科(科)、丹毒丝菌科(科)、黄色单胞菌目(目)、假单胞菌科(科)、放线菌属口腔株hal-1065(种)、肠道罗斯拜瑞氏菌(种)、紫单胞菌科(科)、沙特尔沃思菌属(属)、梭菌纲(纲)、梭菌目(目)、消化链球菌科(科)、消化球菌科(科)、肉杆菌科(科)、小杆菌属e2_20(种)、奈瑟球菌目(目)、巨球型菌属c1(种)、moryella(属)、互养菌门(门)、丹毒丝菌纲(纲)、丹毒丝菌目(目)、梭菌目科xiii.未知种(科)、罗斯拜瑞氏菌属11se39(种)、拟杆菌属d22(种)、互养菌纲(纲)、互养菌目(目)、互养菌科(科)、乳杆菌属tab-22(种)、黄杆菌属(属)、萨特菌科(科)、厌氧棒状菌属5_1_63faa(种)、链球菌属2011_oral_ms_a3(种)、韦荣氏菌属2011_oral_vsa_d3(种)、大芬戈尔德菌属s9aa1-5(种)、弗氏杆菌属(属)、葡萄球菌属3348o2(种)、消化梭菌(属)、肠杆菌属(属)、不动杆菌属(属)、克雷伯氏菌属(属)、多形拟杆菌(种)、丁酸弧菌属(属)、坏疽梭杆菌(种)、草螺菌属(属)、织片草螺菌(种)、片球菌属(属)、大芬戈尔德菌(种)、blautiahansenii(种)、粪肠球菌(种)、乳酸乳球菌(种)、芽孢杆菌属(属)、艰难梭菌(种)、blautiacoccoides(种)、多枝梭菌(种)、融合魏斯氏菌(种)、植物乳杆菌(种)、副干酪乳杆菌(种)、青春双歧杆菌(种)、短双歧杆菌(种)、齿双歧杆菌(种)、动物双歧杆菌(种)、假小链双歧杆菌(种)、卵形拟杆菌(种)、蛋白胨泪菌(种)、阴道厌氧球菌(种)、拉恩氏菌属(属)、沃氏嗜胆菌(种)、sneathiasanguinegens(种)、解琥珀酸菌属(属)、孢菌属(属)、瘤胃假丁酸弧菌(种)、魏斯氏菌属(属)、粪便拟杆菌(种)、鼠李糖乳杆菌(种)、泛菌属(属)、霍尔德曼氏菌属(属)、丝状霍尔德曼氏菌(种)、耐热厌氧细菌目(目)、没食子双歧杆菌(种)、白痢双歧杆菌(种)、明串珠菌科(科)、迟缓埃格特菌(种)、乳头状杆菌(属)、粪厌氧棒杆菌(种)、pseudoflavonifractorcapillosus(种)、厌氧杆菌属(属)、八迭球菌属(属)、少食八迭球菌(种)、颤螺菌属(属)、吉氏颤螺菌(种)、放线菌图列茨亚种(种)、anaerosinus(属)、纤毛菌属(属)、少食短杆菌(种)、乳杆菌属cr-609s(种)、耐热厌氧细菌科(科)、芽孢杆菌科(科)、gelria(属)、酸杆菌目(目)、马赛拟杆菌(种)、红环菌目(目)、人粪便厌氧菌(种)、alistipesfinegoldii(种)、颤螺菌科(科)、嗜胨菌属2002-38328(种)、hespellia(属)、拟杆菌属35ae37(种)、marvinbryantia(属)、运动厌氧芽孢杆菌(种)、厌氧菌(属)、卡他菌(属)、普氏黄曲霉(种)、嗜蛋白菌属(属)、粪罗斯拜瑞氏菌(种)、链球菌属s16-11(种)、拟杆菌属4072(种)、沙氏另支菌(种)、肠杆菌(种)、长形乳杆菌(种)、鹤见双歧杆菌(种)、多雷类杆菌(种)、木糖降解拟杆菌(种)、克罗诺杆菌属(属)、异斯卡多维亚菌属(属)、异斯卡多维亚菌(种)、lactonifactor(属)、卡他杆菌科(科)、产液阿德勒克罗伊茨菌(种)、阿德勒克罗伊茨菌属(属)、另支菌属eba6-25cl2(种)、拟杆菌属eba5-17(种)、颤杆菌属(属)、帕梅莱氏戈尔戈登氏杆菌(种)、另支菌属nml05a004(种)、人类排泄性副沙门氏菌(种)、光冈菌属djf_rr21(种)、丁酸弧菌属(属)、粪双歧杆菌(种)、alistipesindistinctus(种)、戈登氏杆菌属(属)、阿氏厌氧菌(种)、克雷伯氏菌属b12(种)、另支菌属rma9912(种)、厌氧孢杆菌属(属)、粪拟杆菌(种)、布劳特氏菌属ser5(种)、中华拟杆菌(种)、嗜胆菌属4_1_30(种)、钙镁杆菌科(科)、肠杆菌属udc345(种)、双乳双歧杆菌(种)、嗜胨菌属1-14(种)、另支菌属hgb5(种)、拟杆菌属slc1-38(种)、克雷伯氏菌属sor89(种)、肠球菌属c6i11(种)、pseudoflavonifractor(属)、拟杆菌属dnlkv9(种)、巨球型菌属bv3c16-1(种)、粪杆菌属犬口分类群147(种)、弯曲短杆菌属ccug45114(种)、丁酸弧菌属214-4(种)、鼠李氏厌氧菌(种)、阴性球菌属s5-a15(种)、[collinsella]massiliensis[柯林斯氏菌]马赛种(种)、棒状杆菌属jw37(种)、罗斯拜瑞氏菌属499(种)、小杆菌属s7msr5(种)、厌氧球菌属s887-3(种)、大芬戈尔德菌属s8f7(种)、墨氏杆菌属s9pr-10(种)、嗜胨菌属s9pr-13(种)、拟杆菌属j1511(种)、棒状杆菌属713182/2012(种)、拉恩氏菌属bsp18(种)、肠单胞球菌属(属)、罗宾逊菌属knhs210(种)、立方假丝酵母(属)、粪性丁酸单胞菌(种)、senegalimassilia(属)、嗜胨菌属dnf00840(种)、romboutsia(属)、塞孔杜斯协概率菌(种)、莫拉氏菌科(科)、莫拉氏菌属(属)、艾肯菌属(属)、侵蚀艾肯菌(种)、漫游球菌属(属)、叶杆菌属(属)、殊异韦荣氏菌(种)、华德萨特菌(种)、懒惰约翰森菌(种)、赫氏纤毛菌(种)、沙氏纤毛菌(种)、噬二氧化碳细胞菌属ahn9756(种)、伯杰菌属af14(种)、欧陆森氏菌属f0004(种)、叶杆菌属t50(种)、放线菌属icm47(种)、梭杆菌属as2(种)、纤毛菌科(科)、丛毛单胞菌属(属)、消化链球菌属(属)、粘性放线菌(种)、双歧杆菌属(属)、双歧杆菌科(科)、红螺菌科(科)、双歧杆菌目(目)、海旋菌属(属)、长双歧杆菌(种)、聚集杆菌属(属)、链球菌属11atha1(种)、黄杆菌属(属)、苍白杆菌属(属)、阪崎肠杆菌(种)、鞘脂杆菌纲(纲)、布鲁氏菌科(科)、鞘脂杆菌目(目)、艾克曼菌属(属)、嗜胨菌属gpaco18a(种)、柠檬酸杆菌属bw4(种)、金黄色葡萄球菌(种)、短波单胞菌属(属)、柄杆菌科(科)、柄杆菌目(目)、嗜碱重氮营养厌氧杆菌(种)、厌氧芽胞杆菌属(属)、不动杆菌属wb22-23(种)、假单胞菌属(属)、普雷沃氏菌属(属)、普拉梭菌(种)、痤疮皮肤杆菌(种)、韦荣氏菌科(科)、纤毛菌属(属)、考拉杆菌属(属)、黄杆菌科(科)、代尔夫特菌属(属)、黄杆菌纲(纲)、普雷沃氏菌科(科)、毛螺菌科(科)、杜尔氏菌属(属)、黄杆菌目(目)、副拟杆菌属(属)、链球菌属口腔分类群g63(种)、氨基酸球菌科(科)、韦荣氏菌属cm60(种)、葡萄球菌属c9i2(种)、嗜糖嗜糖杆菌(种)、fusicatenibacter(属)、粪副拟杆菌(种)、产气柯林斯菌(种)、丙酸杆菌属kpl1844(种)、长亚甲基杆菌(种)、葡萄球菌属c5i16(种)、棉子糖肠球菌(种)、韦荣氏菌属(属)、γ-变形菌纲(纲)、肠球菌属si-4(种)、肠杆菌目(目)、肠杆菌科(科)、嗜臭菌(属)、瘤胃菌科(科)、脱硫弧菌科(科)、粪考拉杆菌(种)、脱硫弧菌纲(纲)、粪杆菌属(属)、δ-变形菌纲(纲)、甲烷短杆菌属(属)、内脏臭杆菌(种)、subdoligranulumvariabile(种)、史氏甲烷短杆菌(种)、乳杆菌属7_1_47faa(种)、甲烷杆菌科(科)、嗜胆菌属(属)、甲烷杆菌目(目)、梭菌科(科)、广古菌门(门)、甲烷杆菌纲(纲)、克吕沃尔氏菌属(属)、佐治亚克吕沃尔氏菌(种)、粪布劳特氏菌(种)、柯林斯氏菌属(属)、提蒙类普雷沃菌(种)、厌氧棒状菌属(属)、厌氧棒状菌属3_2_56faa(种)、红蝽杆菌科(科)、巨球型菌属dnf00912(种)、粘膜乳杆菌(种)、脆弱拟杆菌(种)、马肠链球菌(种)、普通拟杆菌(种)、丙酸杆菌属msp09a(种)、巴氏链球菌(种)、厌氧弧菌属765(种)、嗜粘蛋白-艾克曼菌(种)、黄绿脓杆菌(种)、葡萄球菌(种)、氨基酸球肠菌(种)、颗粒丙酸杆菌(种)、梭杆菌属cm21(种)、片球菌属mfc1(种)、血绿脓杆菌(种)、胃八迭球菌(种)、链球菌属bs35a(种)、溃疡梭杆菌(种)、摩氏摩根氏菌(种)、埃氏拟杆菌(种)、鸡粪类杆菌(种)、拟杆菌属cb57(种)、韦荣氏菌属msa12(种)、asaccharosporairregularis(种)、乳杆菌属c4i2(种)、拟杆菌属157(种)、刺骨鱼菌属(属)、链球菌属(属)、丙酸杆菌属(属)、厌氧弧菌属(属)、葡萄球菌属(属)、苏黎世杆菌属(属)、拟普雷沃氏菌属(属)、摩根氏菌属(属)、氨基酸球菌属(属)、琥珀酸弧菌属(属)、细杆菌属(属)、asaccharospora(属)、大芬戈尔德菌属(属)、厌氧球菌属(属)、链球菌科(科)、丙酸杆菌科(科)、葡萄球菌科(科)、鞘脂杆菌科(科)、琥珀酸弧菌科(科)、皮杆菌科(科)、棒状杆菌科(科)、硒单胞菌(目)、乳杆菌目(目)、芽孢杆菌目(目)、宽球藻目(目)、气单胞菌目(目)、芽孢杆菌纲(纲)、negativicutes(纲)、蓝细菌(门)、细金拟杆菌(种)、alistipesputredinis(种)、放线菌纲(纲)和乳杆菌科(科)中至少一项相关联的使用者微生物组组成特征；其中，确定所述阑尾相关特征包括：基于所述使用者微生物组组成特征，为使用者确定阑尾相关病症的相关病症。
23.根据权利要求22所述的方法，
其中所述样本与第一身体部位相关联，所述第一身体部位包括肠道部位、皮肤部位、生殖器部位、口腔部位和鼻部位中的至少一处，
其中所述使用者微生物组组成特征包括部位特定的组成特征，每个部位特定的组成特征与第一身体部位相关联，
其中确定所述阑尾相关表征包括基于部位特定的组成特征，为使用者确定阑尾相关病症的相关表征，和
其中所述方法进一步包括基于阑尾相关表征，向使用者提供第一部位特定的治疗，以促进阑尾相关病症的改善，其中所述第一部位特定的治疗与所述第一身体部位相关联。
24.根据权利要求23所述的方法，还包括：
在提供所述第一部位特定的治疗后，从使用者采集治疗后的样本，其中所述治疗后的样本与第二身体部位相关联，所述第二身体部位包括肠道部位、皮肤部位、生殖器部位、口腔部位和鼻部位中的至少一处；
基于与第二身体部位相关联的部位特定特征，针对治疗后的阑尾相关表征为使用者确定阑尾相关病症；和
基于所述治疗后的阑尾相关表征，向使用者提供第二部位特定的治疗，以促进阑尾相关病症的改善，其中第二部位特定的治疗与第二身体部位相关联。
25.根据权利要求21所述的方法，其特征在于，确定所述使用者微生物组特征包括：基于所述微生物数据集，确定肠道部位与奈瑟球菌科(科)、粘液奈瑟球菌(种)、嗜性聚集杆菌(种)、单形拟杆菌(种)、普通拟杆菌(种)、狄氏副拟杆菌(种)、巨球型菌属(属)、变形杆菌门(门)、微球菌科(科)、嗜热链球菌(种)、副血链球菌(种)、孪生球菌属(属)、梭菌属(属)、龋齿放线菌(种)、放线菌目(目)、放线菌科(科)、β-变形杆菌纲(纲)、麻疹孪生球菌(种)、罗氏菌属(属)、弯曲乳杆菌(种)、假单胞菌目(目)、草酸杆菌科(科)、伯克霍尔德氏菌目(目)、孪生球菌属933-88(种)、微球菌目(目)、产酸拟杆菌(种)、艰难杆菌属(属)、拟杆菌属ar20(种)、拟杆菌属ar29(种)、伯克霍尔德氏菌科(科)、丹毒丝菌科(科)、黄色单胞菌目(目)、假单胞菌科(科)、放线菌属口腔株hal-1065(种)、肠道罗斯拜瑞氏菌(种)、紫单胞菌科(科)、沙特尔沃思菌属(属)、梭菌纲(纲)、梭菌目(目)、消化链球菌科(科)、消化球菌科(科)、肉杆菌科(科)、小杆菌属e2_20(种)、奈瑟球菌目(目)、巨球型菌属c1(种)、moryella(属)、互养菌门(门)、丹毒丝菌纲(纲)、丹毒丝菌目(目)、梭菌目科xiii.未知种(科)、罗斯拜瑞氏菌属11se39(种)、拟杆菌属d22(种)、互养菌纲(纲)、互养菌目(目)、互养菌科(科)、乳杆菌属tab-22(种)、黄杆菌属(属)、萨特菌科(科)、厌氧棒状菌属5_1_63faa(种)、链球菌属2011_oral_ms_a3(种)、韦荣氏菌属2011_oral_vsa_d3(种)、大芬戈尔德菌属s9aa1-5(种)、弗氏杆菌属(属)、葡萄球菌属3348o2(种)、消化梭菌(属)、肠杆菌属(属)、不动杆菌属(属)、克雷伯氏菌属(属)、多形拟杆菌(种)、丁酸弧菌属(属)、坏疽梭杆菌(种)、草螺菌属(属)、织片草螺菌(种)、片球菌属(属)、大芬戈尔德菌(种)、blautiahansenii(种)、粪肠球菌(种)、乳酸乳球菌(种)、芽孢杆菌属(属)、艰难梭菌(种)、blautiacoccoides(种)、多枝梭菌(种)、融合魏斯氏菌(种)、植物乳杆菌(种)、副干酪乳杆菌(种)、青春双歧杆菌(种)、短双歧杆菌(种)、齿双歧杆菌(种)、动物双歧杆菌(种)、假小链双歧杆菌(种)、卵形拟杆菌(种)、蛋白胨泪菌(种)、阴道厌氧球菌(种)、拉恩氏菌属(属)、沃氏嗜胆菌(种)、sneathiasanguinegens(种)、解琥珀酸菌属(属)、孢菌属(属)、瘤胃假丁酸弧菌(种)、魏斯氏菌属(属)、粪便拟杆菌(种)、鼠李糖乳杆菌(种)、泛菌属(属)、霍尔德曼氏菌属(属)、丝状霍尔德曼氏菌(种)、耐热厌氧细菌目(目)、没食子双歧杆菌(种)、白痢双歧杆菌(种)、明串珠菌科(科)、迟缓埃格特菌(种)、乳头状杆菌(属)、粪厌氧棒杆菌(种)、pseudoflavonifractorcapillosus(种)、厌氧杆菌属(属)、八迭球菌属(属)、少食八迭球菌(种)、颤螺菌属(属)、吉氏颤螺菌(种)、放线菌图列茨亚种(种)、anaerosinus(属)、纤毛菌属(属)、少食短杆菌(种)、乳杆菌属cr-609s(种)、耐热厌氧细菌科(科)、芽孢杆菌科(科)、gelria(属)、酸杆菌目(目)、马赛拟杆菌(种)、红环菌目(目)、人粪便厌氧菌(种)、alistipesfinegoldii(种)、颤螺菌科(科)、嗜胨菌属2002-38328(种)、hespellia(属)、拟杆菌属35ae37(种)、marvinbryantia(属)、运动厌氧芽孢杆菌(种)、厌氧菌(属)、卡他菌(属)、普氏黄曲霉(种)、嗜蛋白菌属(属)、粪罗斯拜瑞氏菌(种)、链球菌属s16-11(种)、拟杆菌属4072(种)、沙氏另支菌(种)、肠杆菌(种)、长形乳杆菌(种)、鹤见双歧杆菌(种)、多雷类杆菌(种)、木糖降解拟杆菌(种)、克罗诺杆菌属(属)、异斯卡多维亚菌属(属)、异斯卡多维亚菌(种)、lactonifactor(属)、卡他杆菌科(科)、产液阿德勒克罗伊茨菌(种)、阿德勒克罗伊茨菌属(属)、另支菌属eba6-25cl2(种)、拟杆菌属eba5-17(种)、颤杆菌属(属)、帕梅莱氏戈尔戈登氏杆菌(种)、另支菌属nml05a004(种)、人类排泄性副沙门氏菌(种)、光冈菌属djf_rr21(种)、丁酸弧菌属(属)、粪双歧杆菌(种)、alistipesindistinctus(种)、戈登氏杆菌属(属)、阿氏厌氧菌(种)、克雷伯氏菌属b12(种)、另支菌属rma9912(种)、厌氧孢杆菌属(属)、粪拟杆菌(种)、布劳特氏菌属ser5(种)、中华拟杆菌(种)、嗜胆菌属4_1_30(种)、钙镁杆菌科(科)、肠杆菌属udc345(种)、双乳双歧杆菌(种)、嗜胨菌属1-14(种)、另支菌属hgb5(种)、拟杆菌属slc1-38(种)、乳杆菌属akhmro1(种)、克雷伯氏菌属sor89(种)、肠球菌属c6i11(种)、pseudoflavonifractor(属)、拟杆菌属dnlkv9(种)、巨球型菌属bv3c16-1(种)、粪杆菌属犬口分类群147(种)、弯曲短杆菌属ccug45114(种)、丁酸弧菌属214-4(种)、鼠李氏厌氧菌(种)、阴性球菌属s5-a15(种)、[collinsella]massiliensis[柯林斯氏菌]马赛种(种)、棒状杆菌属jw37(种)、罗斯拜瑞氏菌属499(种)、小杆菌属s7msr5(种)、厌氧球菌属s887-3(种)、大芬戈尔德菌属s8f7(种)、墨氏杆菌属s9pr-10(种)、嗜胨菌属s9pr-13(种)、拟杆菌属j1511(种)、棒状杆菌属713182/2012(种)、拉恩氏菌属bsp18(种)、肠单胞球菌属(属)、罗宾逊菌属knhs210(种)、立方假丝酵母(属)、粪性丁酸单胞菌(种)、senegalimassilia(属)、嗜胨菌属dnf00840(种)、romboutsia(属)、和塞孔杜斯协概率菌(种)中的至少一个相关联的部位特定的组成特征；其中，确定所述阑尾相关表征包括：基于所述部位特定组成特征，为使用者确定阑尾相关病症的相关表征。
26.根据权利要求25所述的方法，其特征在于，确定所述使用者微生物组特征包括：基于所述微生物数据集，确定其与神经退行性疾病、信号分子和相互作用、外源物质的生物降解和代谢、抗坏血酸和醛酸代谢、亨廷顿舞蹈病、磷酸肌醇代谢、丙酸盐代谢、淀粉和蔗糖代谢、己内酰胺降解、细胞运动和分泌、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸降解、色氨酸代谢、i型糖尿病、苯丙氨酸代谢、硒化合物代谢、赖氨酸降解、多环芳烃降解、多糖的生物合成和代谢、肾细胞癌、丁酸酯代谢、原核生物中的碳固定途径、柠檬酸循环(tca循环)、脂多糖的生物合成、rna转运、硫胺素代谢、1,1,1-三氯-2,2-双(4-氯苯基)乙烷(ddt)降解、电子转移载体、肌萎缩性侧索硬化症(als)、朊病毒病、甲苯降解、α-亚麻酸代谢、[v]防御机制、[o]翻译后修饰、蛋白质转换和伴侣、[r]仅一般功能预测、[i]脂质转运和代谢、[h]辅酶转运和代谢、能量代谢、神经系统、信号转导、细胞过程和信号转导、翻译、代谢、细胞生长和死亡、内分泌系统、氨基酸代谢、辅因子和维生素的代谢、复制和修复、萜类化合物和聚酮化合物的代谢、传染病、氨基酸相关的酶、光合作用、泛酸和coa生物合成、光合作用蛋白、谷氨酸能突触、结核病、两组分系统、氨基酰基-trna生物合成、核糖体、其它离子偶联转运体、萜类骨架生物合成、细胞周期-柄杆菌属、其它转运体、碱基切除修复、肽聚糖生物合成、霍乱弧菌致病周期、柠檬烯和蒎烯降解、分泌系统、核苷酸切除修复、翻译因子、丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢、核糖体生物发生、其它(kegg3)、真核生物中的核糖体生物发生、聚酮糖单元生物合成、链霉素生物合成、同源重组、氧化磷酸化、未知功能、光合生物的固碳作用、细胞骨架蛋白、dna修复和重组蛋白、无机离子转运和代谢、氨基酸代谢、香叶醇降解、蛋白质输出、苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸生物合成、赖氨酸生物合成、乙苯降解、转录机制、rna聚合酶、万古霉素类抗生素生物合成、错配修复、萘降解、嘧啶代谢、d-谷氨酰胺和d-谷氨酸代谢、玉米素生物合成、k02004(kegg4)、k03100(kegg4)中至少一个相关联的使用者微生物组功能特征；其中，确定所述阑尾相关表征包括：基于所述使用者微生物组功能特征和部位特定组成特征，为使用者确定阑尾相关病症的相关表征。
27.根据权利要求21所述的方法，其特征在于，确定所述使用者微生物组特征包括：基于所述微生物数据集，确定皮肤部位与假单胞菌属(属)、奈瑟球菌科(科)、狄氏副拟杆菌(种)、普雷沃氏菌属(属)、普拉梭菌(种)、副血链球菌(种)、痤疮皮肤杆菌(种)、韦荣氏菌科(科)、纤毛菌属(属)、考拉杆菌属(属)、黄杆菌科(科)、代尔夫特菌属(属)、黄杆菌纲(纲)、普雷沃氏菌科(科)、毛螺菌科(科)、消化链球菌科(科)、杜尔氏菌属(属)、黄杆菌目(目)、奈瑟球菌目(目)、副拟杆菌属(属)、链球菌属口腔分类群g63(种)、氨基酸球菌科(科)、韦荣氏菌属cm60(种)、葡萄球菌属c9i2(种)、纤毛菌科(科)、嗜糖嗜糖杆菌(种)、fusicatenibacter(属)、葡萄球菌3348o2(种)、粪副拟杆菌(种)、产气柯林斯菌(种)、鞘脂杆菌纲(纲)、鞘脂杆菌目(目)、嗜胨菌属1-14(种)、厌氧芽胞杆菌属(属)、丙酸杆菌属kpl1844(种)、长亚甲基杆菌(种)、和葡萄球菌属c5i16(种)中至少一个相关联的部位特定组成特征；其中，确定所述阑尾相关表征包括：基于所述部位特定组成特征，为使用者确定阑尾相关病症的相关表征。
28.根据权利要求21所述的方法，其特征在于，确定所述使用者微生物组特征包括：基于所述微生物数据集，确定生殖部位与孪生球菌属(属)、非典型性韦荣氏菌(种)、害肺小杆菌(种)、弯曲乳杆菌(种)、叶杆菌科(科)、水杆菌属(属)、厌氧菌(属)、双生厌氧菌(种)、苍白杆菌属(属)、克氏动弯杆菌(种)、纽氏放线菌(种)、解乳厌氧球菌(种)、约氏乳杆菌(种)、疣微菌目(目)、疣微菌门(门)、疣微菌纲(纲)、疣微菌科(科)、解琥珀酸菌(种)、奇异菌属f0209(种)、费氏棒状杆菌(种)、乳杆菌属akhmro1(种)、厌氧球菌9401487(种)、中生根瘤菌属(属)、罗伊氏乳杆菌(种)、巨球型菌属upii199-6(种)、乳杆菌属c30an8(种)、消化球菌属s9pr-12(种)、和海链球菌(种)中至少一个相关联的部位特定组成特征；其中，确定所述阑尾相关表征包括：基于所述部位特定组成特征，为使用者确定阑尾相关病症的相关表征。
29.根据权利要求21所述的方法，其特征在于，确定所述使用者微生物组特征包括：基于所述微生物数据集，确定口腔部位与莫拉氏菌科(科)、莫拉氏菌属(属)、艾肯菌属(属)、侵蚀艾肯菌(种)、漫游球菌属(属)、叶杆菌属(属)、殊异韦荣氏菌(种)、华德萨特菌(种)、懒惰约翰森菌(种)、酸性拟杆菌(种)、赫氏纤毛菌(种)、沙氏纤毛菌(种)、噬二氧化碳细胞菌属ahn9756(种)、伯杰菌属af14(种)、欧陆森氏菌属f0004(种)、拟杆菌属d22(种)、叶杆菌属t50(种)、放线菌属icm47(种)、梭杆菌属as2(种)和纤毛菌科(科)中至少一个相关联的部位特定组成特征；其中，确定所述阑尾相关表征包括：基于所述部位特定组成特征，为使用者确定阑尾相关病症的相关表征。
30.根据权利要求21所述的方法，其特征在于，确定所述使用者微生物组特征包括：基于所述微生物数据集，确定鼻部位与丛毛单胞菌属(属)、消化链球菌属(属)、粘性放线菌(种)、龋齿放线菌(种)、双歧杆菌属(属)、双歧杆菌科(科)、红螺菌科(科)、双歧杆菌目(目)、肠道罗斯拜瑞氏菌(种)、海旋菌属(属)、长双歧杆菌(种)、聚集杆菌属(属)、链球菌属11atha1(种)、萨特菌科(科)、黄杆菌属(属)、苍白杆菌属(属)、阪崎肠杆菌(种)、阴道厌氧球菌(种)、鞘脂杆菌纲(纲)、布鲁氏菌科(科)、鞘脂杆菌目(目)、艾克曼菌属(属)、嗜胨菌属gpaco18a(种)、柠檬酸杆菌属bw4(种)、克罗诺杆菌属(属)、棒状杆菌属jw37(种)、金黄色葡萄球菌(种)、短波单胞菌属(属)、柄杆菌科(科)、柄杆菌目(目)、嗜碱重氮营养厌氧杆菌(种)、厌氧芽胞杆菌属(属)、和不动杆菌属wb22-23(种)中至少一个相关联的部位特定组成特征；其中，确定所述阑尾相关表征包括：基于所述部位特定组成特征，为使用者确定阑尾相关病症的相关表征。
技术总结