本发明属于分子育种，具体涉及一种用于构建茄子品系分群的snp分子标记组合及其应用。
背景技术：
1、茄子原产亚洲热带，在全世界都有分布，以亚洲栽培最多，占世界总产量74％左右；欧洲次之，占14％左右。各地均有栽培，为夏季主要蔬菜之一。
2、茄子常规群体划分主要以形态学鉴定为主，然而该方式准确性低、鉴定时间长、易受环境影响等因素制约，而且随着茄子品系数量不断增多，品系间表型差异越来越小，更加剧了品系区分的难度。
3、随着生物测序技术的快速发展，rflp、aflp、ssr等多种分子标记已经被用于种质资源筛选、品种鉴定和品种保护。但上述分子标记存在以下问题：1、现行标准，使用到的上述标记数量较少，分群结果存在一定错误；2、短时间内无法检测大量样本，检测通量低；3、上述标记使用数量越多，检测成本越高。
技术实现思路
1、鉴于此，本发明提供一种用于构建茄子品系分群的snp分子标记组合及其应用，该标记组合在茄子12条染色体上均匀分布，多态性较高，基于该snp标记的液相探针芯片标记密度高、自动化强、检测通量高等特征，更有利于建立茄子群体分群体系。
2、为达到上述目的，本发明采用以下技术方案：
3、本发明目的之一是提供一种用于构建茄子品系分群的snp分子标记组合，所述snp分子标记组合包含有1009个snp分子标记，所述1009个snp位点的物理位置是基于茄子guiqie-1(s.melongena)基因组序列对比确定的，具体snp分子标记情况详见实施例1中表1。
4、本发明目的之二是提供一种鉴定权利要求1所述snp分子标记组合的探针，所述探针具体详见实施例1中表1。
5、本发明目的之三是提供一种确定茄子品种群体的方法，其特征在于，包括以下步骤：确定待测茄子样品基因组dna的1009个snp位点基因型，并构建pca散点图，根据散点图确定待测茄子样品群体；
6、其中，所述1009个snp位点基因型为权利要求1所述的snp分子标记组合；
7、所述散点图中每一个位点代表一个样本，图中两个样本距离越远，则说明两个样本遗传背景差异越大，遗传背景相似的个体则会在图中聚为一类。
8、进一步地，所述待测茄子样品基因组dna的1009个snp位点基因型具体检测如下：提取待测茄子样品dna，利用权利要求2所述探针对待测茄子样品基因组dna进行pcr扩增，得到pcr产物，检测所述pcr产物，确定所述待测茄子样品基因组dna的1009个snp位点基因型。
9、本发明目的之四是利用上述的snp分子标记组合，和/或上述的探针在构建茄子品系分群中的应用。
10、本发明目的之五是利用上述的snp分子标记组合，和/或上述的探针在茄子新品系鉴定、茄子育种、茄子群体遗传多样性分析任一项中的应用。
11、本发明目的之六是提供一种划分茄子品系群体的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包含上述的探针。
12、本发明目的之七是提供一种茄子全基因组基因芯片，其特征在于，所述基因芯片含有上述探针。
13、与现有技术相比，本发明的有益效果为：
14、本发明提供一组可准确区分茄子品系的snp标记组合。基于收集的577份茄子品系全基因组重测序数据，从数百万个snp中筛选出1009个多态性snp标记组合，成功构建了茄子品系分群的snp标记组合。该标记组合在茄子12条染色体上均匀分布，多态性较高。基于该snp标记的液相探针芯片标记密度高、自动化强、检测通量高等特征，更有利于建立茄子群体分群体系。该标记组合可以为茄子新品系鉴定、分子标记辅助选择育种、全基因组选择、群体遗传多样性分析等工作提供理论和数据支撑，具有较为重要的理论价值和应用意义。
1.一种用于构建茄子品系分群的snp分子标记组合，其特征在于，所述snp分子标记组合包含有1009个snp分子标记，所述1009个snp位点的物理位置是基于茄子guiqie-1(s.melongena)基因组序列对比确定的，具体snp分子标记情况如说明书表1所示。
2.鉴定权利要求1所述snp分子标记组合的探针，其特征在于，所述探针具体如说明书表1所示。
3.一种确定茄子品系群体划分的方法，其特征在于，包括以下步骤：确定待测茄子样品基因组dna的1009个snp位点基因型，并构建pca散点图，根据散点图确定待测茄子样品群体；
4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，所述待测茄子样品基因组dna的1009个snp位点基因型具体检测如下：提取待测茄子样品dna，利用权利要求2所述探针对待测茄子样品基因组dna进行pcr扩增，得到pcr产物，检测所述pcr产物，确定所述待测茄子样品基因组dna的1009个snp位点基因型。
5.权利要求1所述的snp分子标记组合，和/或权利要求2所述的探针在构建茄子品系分群中的应用。
6.权利要求1所述的snp分子标记组合，和/或权利要求2所述的探针在茄子新品系鉴定、茄子育种、茄子群体遗传多样性分析任一项中的应用。
7.一种划分茄子品系群体的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包含权利要求2所述的探针。
8.一种茄子全基因组基因芯片，其特征在于，所述基因芯片含有如权利要求2所述探针。
