本发明涉及纯化通过固相肽合成(spps)生产的肽或肽核酸的方法以及用于所述纯化的接头分子。
背景技术:
1、固相肽合成是确定的合成肽的方法。标准程序是将第一个n-末端保护的氨基酸偶联至合成树脂,随后重复进行n-末端去保护、偶联下一个n-末端保护的氨基酸的循环,以及将未反应的肽序列封端。最后,将合成的肽从合成树脂上裂解下来并且纯化。
2、广泛使用的纯化肽的方法是制备型高效液相色谱法(hplc)。该方法不利的是关于期望的生产量的可伸缩性差,因此不能用同一个系统生产不同的量。这导致对于相应的复杂装置的获得成本相对较高。另一个缺点是需要相对广泛的知识来正确地分析评估各个级分。另外,hplc纯化包括在操作期间溶剂和偶尔柱材料(固相)的高消耗。
3、因此,更便宜且更不易于出现故障的方法将有利于降低肽生产的成本。
4、替代方法使用接头分子,该接头分子可以附连至肽,并其后偶联至在纯化期间使用的官能化的固相。
5、ep 0 552 368 a1描述了带有可以共价结合至纯化载体上的硫醇的接头分子。然而,该方法不适用于含硫醇的肽,诸如包括氨基酸半胱氨酸或青霉胺的肽。
6、ep 2 501 711 b1提出了类似的方法,其中接头经由叠氮基(-n3)和炔烃之间的1,3-偶极环加成结合至固相,其需要铜的存在。然而,包括甲硫氨酸、半胱氨酸;精氨酸或赖氨酸的肽可络合铜,使去除困难。由于铜的毒性,这样的肽不适于所有应用,诸如药物用途。
7、wo 2017129818(a1)公开了可以偶联至肽的接头分子,该肽在spps之后仍然结合至合成树脂。然后通过应用通常使用的tfa条件将肽从合成上裂解下来。然而,如wo2017129818(a1)中所公开,与肽形成氨基甲酸苄酯的接头分子的缺点是它们对酸处理(tfa>50%,在水存在下,ph<0)的不稳定性。接头分子的过早衰变导致纯化的肽的产率显著降低。
8、由于在用于释放肽的碱性条件(ph>9)下接头的磺基-乙烯基氨基甲酸酯(sulfo-ethyleneyl carbamate)部分(moiety)上的β-羟基或β-硫醇基团的亲核攻击,在肽的n-末端处包含thr、ser或cys的肽也发生不想要的副反应。wo 2017129818(a1)中公开的接头分子的另外副反应是在碱性条件下天冬酰亚胺(aspartimide)形成和在arg-glu序列处精氨酸至瓜氨酸的转化,以及二硫化物形成和通过内部cys残基的亲核副反应。
9、此外,wo 2017129818(a1)中描述的砜接头受到保留在固体载体上并且需要额外的淬灭步骤的反应性乙烯基砜部分的影响。
10、为了克服在碱性条件下的副反应和在酸性条件下接头的过早衰变的缺点,本发明提供了在tfa条件下稳定并且在温和的酸性条件下(特别是在ph≤7下)允许肽释放的接头分子。
技术实现思路
1、根据本发明的第一方面,提供了一种式1:x-tb-va-u-y-z(1)的化合物,其中,
2、-x选自式2、2a、3、3a或4的部分(moiety),特别是式2、2a、3或3a的部分,更特别是式2或2a的部分,
3、
4、其中,
5、-每个r1和r2彼此独立地选自h或b,其中至少r1或r2是b,
6、-r3选自h或b,
7、-r4选自h、c1-c12-烷基或芳基,其中醛或酮基基团可被酸不稳定的保护基团保护,
8、-b是酸不稳定的胺保护基团,
9、-t是直链或支链间隔基,其包括以下部分中的至少一个,特别是1至5个,更特别是1至3个:-c1-12-烷基-、(-c2h4o-)1-12、-c(=o)-、-c(=o)-jr9-、-jr9-c(=o)-、-jr9-、苯基、5元或6元杂芳基,特别是-c1-12-烷基-、(-c2h4o-)1-12、-c(=o)-、-c(=o)-jr9-、-jr9-c(=o)-、-jr9-,其中,
10、j是ch或n,特别是n,
11、特别地t是选自以下的间隔基
12、-c1-c12-烷基-,特别是-c1-6-烷基-、更特别是-c1-3-烷基-,-r5-c(=o)-,-r5-c(=o)-nr9-r6-,-r5-c(=o)-nr9-,-c(=o)-nr9-r6-,-r5-nr9-c(=o)-r6-,-r5-nr9-r5’-nr9’c(=o)-r6-,-r5-c(=o)-nr9-r5’-nr9’-c(=o)-r6-,-r5-nr9-,-r5-nr9-r6-,-r5-nr9-r5’-nr9’-r6-,-r5-c(=o)-nr9-r5’-nr9’-r6-,-r5-c(=o)-o-r6-,-c(=o)-o-r6-,-r5-苯基-r6-,-r5-苯基-,-苯基-r6-,-苯基-,-r5-吡咯基,-r5-吡唑基,-r5-咪唑基,r5-哌嗪基-,-r5-吡啶基,-r5-嘧啶基,-r5-吡嗪基,-r5-哒嗪基,-r5-吡咯基-r6-,-r5-吡唑基-r6-,-r5-咪唑基-r6-,-r5-哌嗪基-r6-,-r5-吡啶基-r6-,-r5-嘧啶基-r6-,-r5-吡嗪基-r6-,-r5-哒嗪基-r6-,吡咯基-r6-,吡唑基-r6-,咪唑基-r6-哌嗪基-r6-,吡啶基-r6-,嘧啶基-r6-,吡嗪基-r6-,哒嗪基-r6-,吡咯基,吡唑基,咪唑基,哌嗪基,吡啶基,嘧啶基,吡嗪基和哒嗪基,其中,
13、r5、r5’和r6彼此独立地选自c1-c12-烷基或(-c2h4o-)1-12,特别是c1-c6烷基,特别是c1-c3烷基,并且其中,
14、r9和r9’彼此独立地选自h、c1-4-烷基、-c1-6-烷基-nh2、-c1-6-烷基-nhb、-c1-6-烷基-nb2、-r15、-c1-6-烷基-r15、-c1-6-烷基-nh-r15,特别地选自h和c1-2-烷基,更特别地r9是h,其中,
15、b是独立选择的酸不稳定的胺保护基团,
16、r15是能与醛部分反应的封闭剂,特别地r15选自半胱氨酰基、苏氨酰基、2-巯基乙醇、半胱胺、乙二硫醇、羟胺、o-甲基羟胺、n-甲基羟胺、二硫苏糖醇、肼,特别是半胱氨酰基和n-甲基羟胺,更特别是半胱氨酰基,其中,
17、所述封闭剂的胺和/或硫醇部分可被独立选择的酸不稳定的胺保护基团b,特别是boc,和/或酸不稳定的硫醇保护基团,特别是三苯甲基保护。
18、-b是0或1,特别是1,
19、-v是吸电子部分,其选自-nr11-c(=o)-、-c(=o)-nr11-、-s(=o)-、-nr12-(ch2)p-、-哌嗪基-(ch2)p-、-吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-c(=o)-、-c(=o)-o-,特别是-nr11-c(=o)-、-c(=o)-nr11-、-s(=o)-、-nr12-(ch2)p-、-哌嗪基-(ch2)p-、-吡啶基-、嘧啶基,更特别地选自-nh-c(=o)-、-c(=o)-nh-、-n-(ch3)-、-哌嗪基-(ch2)p-、-吡啶基-、嘧啶基,其中,
20、r11选自h和c1-4-烷基,特别地选自h和c1-2-烷基,更特别地r11是h,
21、r12选自h和c1-4-烷基,特别地选自h和c1-2-烷基,更特别地r12是甲基,
22、p是0、1或2,特别是0或1,
23、-a是0或1,其中a和b之和是1或2,
24、-u是苯基或五元或六元杂芳基部分,特别是苯基或六元杂芳基部分,更特别是苯基,其结合至部分v、wq和en中的至少一个并且可以任选地被c1-6-烷基,特别是c1-3-烷基取代,其中,
25、v如上所述定义,
26、w选自-n3、-no2、-s(=o)-r8、-s-s-r8、-o-ch2-n3、-o-c(=o)-o-ch2-n3、-n=n-苯基、-n=n-r8、特别是-n3、-n=n-r8、-o-ch2-n3、-s-s-r8,其中,
27、r8是吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-c1-c6-烷基或-(ch2)p-nme2,特别是吡啶基或-c1-c6-烷基,其中p是1、2、3或4,
28、e在酸性条件下是吸电子基团,
29、n是0和4之间的整数,特别是0和2之间的整数,更特别是0或1,并且q是0和4之间的整数,特别是0和2之间的整数,更特别是0和1,其中n和q之和等于或小于4,并且其中,
30、在u是苯基部分且y是-(ch2)m-o-c(=o)-的情况下,在酸性条件下v、w、e的哈米特常数之和大于0.45,并且其中,
31、w相对于y在邻位或对位,
32、-y是-(ch2)m-c(=o)-或-(ch2)m-o-c(=o)-,其中m是1、2或3,特别是1或2,更特别是1,
33、-z是吸电子离去基团。
34、在某些实施方式中,
35、-x选自式2、2a、3、3a或4的部分,特别是式2、2a、3或3a的部分,更特别是式2或2a的部分,
36、
37、其中,
38、-每个r1和r2彼此独立地选自h或b,其中至少r1或r2是b,
39、-r3选自h或b,
40、-r4选自h、c1-c12-烷基或芳基,其中醛或酮基基团可被酸不稳定的保护基团保护,
41、-b是酸不稳定的胺保护基团,
42、-t是直链或支链间隔基,其包括以下部分中的至少一个:-c1-12-烷基-、(-c2h4o-)1-12、-c(=o)-、-c(=o)-jr9-、-jr9-c(=o)-、-jr9-,其中,
43、j是c或n,特别是n,
44、特别地t是选自以下的间隔基
45、-c1-c12-烷基-(特别是c1-6-烷基、更特别是c1-3-烷基)、-r5-c(=o)-、-r5-c(=o)-nr9-r6-、-r5-c(=o)-nr9-、-c(=o)-nr9-r6-、-r5-nr9-c(=o)-r6-、-r5-nr9-r5’-nr9’c(=o)-r6-、-r5-c(=o)-nr9-r5’-nr9’-c(=o)-r6-、-r5-nr9-、-r5-nr9-r6-、-r5-nr9-r5’-nr9’-r6-、-r5-c(=o)-nr9-r5’-nr9’-r6-、-r5-c(=o)-o-r6-、-c(=o)-o-r6-、-r5-苯基-r6-、-r5-苯基-、-苯基-r6-、-苯基-,其中,
46、r5、r5’和r6彼此独立地选自c1-c12-烷基或(-c2h4o-)1-12,特别是c1-c6烷基,特别是c1-c3烷基,并且其中,
47、r9和r9’彼此独立地选自h、c1-4-烷基、-c1-6-烷基-nh2、-c1-6-烷基-nhb、-c1-6-烷基-nb2、-r15、-c1-6-烷基-r15、-c1-6-烷基-nh-r15,特别地选自h和c1-2-烷基,更特别地r9是h,其中,
48、b是独立选择的酸不稳定的胺保护基团,
49、r15是能与醛部分反应的封闭剂,特别地r15选自半胱氨酰基、苏氨酰基、2-巯基乙醇、半胱胺、乙二硫醇、羟胺、o-甲基羟胺、n-甲基羟胺、二硫苏糖醇、肼,特别是半胱氨酰基和n-甲基羟胺,更特别是半胱氨酰基,其中,
50、所述封闭剂的胺和/或硫醇部分可被独立选择的酸不稳定的胺保护基团b,特别是boc,和/或酸不稳定的硫醇保护基团,特别是三苯甲基保护,
51、-b是0或1,特别是1,
52、-v是吸电子部分,其选自-nr11-c(=o)-、-c(=o)-nr11-、-s(=o)-、-nr12-、-哌嗪基-、-吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-c(=o)-、-c(=o)-o-,特别是-nr11-c(=o)-、-c(=o)-nr11-、-s(=o)-、-nr12-、-哌嗪基-、-吡啶基-、嘧啶基,更特别地选自-nh-c(=o)-、-c(=o)-nh-、-n-(ch3)-、-哌嗪基-、-吡啶基-、嘧啶基,其中,
53、r11选自h和c1-4-烷基,特别地选自h和c1-2-烷基,更特别地r11是h,
54、r12选自h和c1-4-烷基,特别地选自h和c1-2-烷基,更特别地r12是甲基,
55、-a是0或1,其中a和b之和是1或2,
56、-u是苯基或五元或六元杂芳基部分,特别是苯基或六元杂芳基部分,更特别是苯基,其结合至部分v、wq和en中的至少一个并且可以任选地被c1-6-烷基,特别是c1-3-烷基取代,其中,
57、v如上所述定义,
58、w选自-n3、-s(=o)-r8、-s-s-r8、-o-ch2-n3、-o-c(=o)-o-ch2-n3、-n=n-
59、苯基、-n=n-r8、特别是-n3、-n=n-r8、-o-ch2-n3、-s-s-r8,其中,
60、r8是吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-c1-c6-烷基或-(ch2)p-nme2,特别是吡啶基或-c1-c6-烷基,其中p是1、2、3或4,
61、e在酸性条件下是吸电子基团,
62、n是0和4之间的整数,特别是0和2之间的整数,更特别是0或1,并且q是0和4之间的整数,特别是0和2之间的整数,更特别是0和1,其中n和q之和等于或小于4,并且其中,
63、在u是苯基部分且y是-(ch2)m-o-c(=o)-的情况下,在酸性条件下v、w、e的哈米特常数之和大于0.45,
64、-y是-(ch2)m-c(=o)-或-(ch2)m-o-c(=o)-,其中m是1、2或3,特别是1或2,更特别是1,
65、z是吸电子离去基团。
66、在某些实施方式中,
67、-x选自式2、2a、3、3a或4的部分,特别是式2、2a、3或3a的部分,更特别是式2或2a的部分,
68、
69、其中,
70、-每个r1和r2彼此独立地选自h或b,其中至少r1或r2是b,
71、-r3选自h或b,
72、-r4选自h、c1-c12-烷基或芳基,其中醛或酮基基团可被酸不稳定的保护基团保护,
73、-b是酸不稳定的胺保护基团,
74、-t是选自以下的间隔基
75、-c1-c12-烷基-(特别是c1-6-烷基、更特别是c1-3-烷基)、-r5-c(=o)-、-r5-c(=o)-nr9-r6-、-r5-c(=o)-nr9-、-c(=o)-nr9-r6-、-r5-nr9-c(=o)-r6-、-r5-nr9-r5’-nr9’c(=o)-r6-、-r5-c(=o)-nr9-r5’-nr9’-c(=o)-r6-、-r5-c(=o)-o-r6-、-c(=o)-o-r6-、-r5-苯基-r6-、-r5-苯基-、-苯基-r6-、-苯基-,其中,
76、r5、r5’和r6彼此独立地选自c1-c12-烷基,特别是c1-c6烷基,特别是c1-c3烷基,并且,其中r9和r9’彼此独立地选自h和c1-4-烷基,特别地选自h和c1-2-烷基,更特别地r9是h,
77、-b是0或1,特别是1,
78、-v是吸电子部分,其选自-nr11-c(=o)-、-c(=o)-nr11-、-s(=o)-、-nr12-、-哌嗪基-、-吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-c(=o)-、-c(=o)-o-,特别是-nr11-c(=o)-、-c(=o)-nr11-、-s(=o)-、-nr12-、-哌嗪基-、-吡啶基-、嘧啶基,更特别地选自-nh-c(=o)-、-c(=o)-nh-、-n-(ch3)-、-哌嗪基-、-吡啶基-、嘧啶基,其中,
79、r11选自h和c1-4-烷基,特别地选自h和c1-2-烷基,更特别地r11是h,
80、r12选自h和c1-4-烷基,特别地选自h和c1-2-烷基,更特别地r12是甲基,
81、-a是0或1,其中a和b之和是1或2,
82、-u是苯基或五元或六元杂芳基部分,特别是苯基或六元杂芳基部分,更特别是苯基,其结合至部分v、wq和en中的至少一个并且可以任选地被c1-6-烷基,特别是c1-3-烷基取代,其中,
83、v如上所述定义,
84、w选自-n3、-s(=o)-r8、-s-s-r8、-o-ch2-n3、-o-c(=o)-o-ch2-n3、-n=n-
85、苯基、-n=n-r8、特别是-n3、-n=n-r8、-o-ch2-n3、-s-s-r8,其中,
86、r8是吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-c1-c6-烷基或-(ch2)p-nme2,特别是吡啶基或-c1-c6-烷基,其中p是1、2、3或4,
87、e在酸性条件下是吸电子基团,
88、n是0和4之间的整数,特别是0和2之间的整数,更特别是0或1,并且q是0和4之间的整数,特别是0和2之间的整数,更特别是0和1,其中n和q之和等于或小于4,并且其中,
89、在u是苯基部分且y是-(ch2)m-o-c(=o)-的情况下,在酸性条件下v、w、e的哈米特常数之和大于0.45,并且其中,
90、特别地w相对于y在邻位或对位,
91、-y是-(ch2)m-c(=o)-或-(ch2)m-o-c(=o)-,其中m是1、2或3,特别是1或2,更特别是1,
92、-z是吸电子离去基团。
93、在某些实施方式中,
94、-x选自式2、2a、3、3a或4的部分,特别是式2、2a、3或3a的部分,更特别是式2或2a的部分,最特别地选自2的部分,
95、
96、其中,
97、-每个r1和r2彼此独立地选自h或b,其中至少r1或r2是b,
98、-r3选自h或b,
99、-r4选自h、c1-c12-烷基或芳基,其中醛或酮基基团可被酸不稳定的保护基团保护,
100、-b是酸不稳定的胺保护基团,
101、-t是选自以下的间隔基
102、-c1-c12-烷基-(特别是c1-6-烷基、更特别是c1-3-烷基)、-r5-c(=o)-nr9-r6-、-c(=o)-nr9-r6-、-r5-nr9-r5-nr9c(=o)-r6-、-r5-nr9-c(=o)-r6-、-r5-c(=o)-o-r6-、-c(=o)-o-r6-、-r5-苯基-r6-、-r5-苯基-、-苯基-r6-、-苯基-,其中,
103、r5和r6彼此独立地选自c1-c12-烷基,特别是c1-c6烷基,特别是c1-c3烷基,并且其中r9选自h和c1-4-烷基,特别地选自h和c1-2-烷基,更特别地r9是h,
104、-b是0或1,特别是1,
105、-v是吸电子部分,其选自-nr11-c(=o)-、-c(=o)-nr11-、-s(=o)-、-nr12-、-吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-c(=o)-、-c(=o)-o-,特别是-nr11-c(=o)-、-s(=o)-、-nr12-、-吡啶基-、嘧啶基,其中,
106、r11选自h和c1-4-烷基,特别地选自h和c1-2-烷基,更特别地r11是h,
107、r12选自h和c1-4-烷基,特别地选自h和c1-2-烷基,更特别地r12是甲基,
108、-a是0或1,其中a和b之和是1或2,
109、-u是苯基或五元或六元杂芳基部分,特别是苯基或六元杂芳基部分,其结合至部分v、w和e中的至少一个,其中,
110、v如上所述定义,
111、w选自-n3、-s(=o)-r8、-ssr8、-och2n3、-oc(=o)och2-n3、
112、-n=n-苯基、-n=n-吡啶、其中,
113、r8是吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-c1-c6-烷基或-(ch2)p-nme2,其中p是1、2、3或4,
114、e选自吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-f、-cl、-br、-i、-cn、-no2、-n3、-cf3、-so3h、-co2h、-c(=o)nh2、-so2me、-some、-so2et、-soet,特别是吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-f、-cl、-br、-i、-cn、-no2、-n3、-cf3、-so3h、-co2h,其中,
115、r13选自-f、-cl、-br、-i、-pf6,并且其中,
116、在u是苯基部分且y是-(ch2)m-o-c(=o)-的情况下,在酸性条件下v、w、e的哈米特常数之和大于0.45,并且其中,
117、特别地w相对于y在邻位或对位,
118、-y是-(ch2)m-c(=o)-或-(ch2)m-o-c(=o)-,其中m是1、2或3,特别是1或2,更特别是1,
119、-z是吸电子离去基团。
120、式1的接头分子适于纯化固相肽合成(spps)后的肽。
121、用于使用接头分子纯化spps后的肽的常用方法是在最后的偶联步骤中将接头分子偶联至肽的n-末端。在该偶联步骤中,肽的n-末端将亲核攻击接头分子以与接头的部分y形成共价的氨基甲酸酯或酰胺键,同时释放吸电子离去基团z。随后,通过添加tfa将肽-接头-构建体从合成树脂上裂解下来。
122、当肽-接头构建体例如通过使用tfa被裂解下来时,根据本发明的接头在酸性条件下是稳定的。
123、接头的部分x可以偶联至在纯化期间使用的官能化的固相,诸如树脂。部分x可以通过与官能化的固相的合适部分(诸如醛、酮、氨基-氧基或肼)反应形成腙键或肟键。
124、部分t表示在通常应用的纯化条件下是非反应性的间隔基。
125、部分t直接或经由部分v结合到部分u。
126、部分u有助于接头分子在酸性条件(特别地tfa>50%,在水存在下,ph<0)下的稳定性。这是通过使用结合至吸电子部分e、w和v中的至少一个的杂环部分或苯基部分来实现的。
127、如果将吸电子部分(e、w、v)附连至苯基部分,则与肽连接的接头分子的苄基位置获得较小的电子密度,并且因此较不容易受到酸催化的降解的影响。为了使本发明的接头分子在酸性条件下具有足够的稳定性,必须满足一定的吸电子阈值。该阈值表示为在酸性条件下v、w、e的哈米特常数(σm和σp)之和大于0.45。哈米特常数根据hansch and taft(1991),chem.rev.91:165-195计算。正的哈米特常数反映了取代基对苯基部分施加吸电子作用的能力,而负值表示取代基施加给电子作用。
128、哈米特常数是苯甲酸衍生物中间位(σm)和对位(σp)的苯基核的取代基导致不同的酸度(pka)的凭经验确定的常数。在本发明的上下文中,相对于结合的部分y确定位置。对于邻位的取代基,对位的哈米特值是良好的近似值,并且因此在本发明的上下文中用于计算取代基v、w和e的哈米特值之和。
129、值得注意的是,在酸性条件下计算取代基v、w和e的哈米特常数。例如,胺部分在中性ph下特征在于哈米特常数σm=-0.16并且σp=-0.66,并且因此为推电子取代基。在酸性条件下,胺部分被质子化。对于质子化的胺,哈米特常数是σm=+0.86并且σp=+0.60,表明质子化的胺是吸电子取代基,这还包括能够通过共轭π系统以其质子化形式从u吸出电子的芳香族胺,无论是直接作为u上的取代基还是在u的π共轭中。
130、哈米特常数之和的阈值大于0.45适用于u是苯基部分且y是-(ch2)m-o-c(=o)-,其中m=1,因为-o-c(=o)-构成苄基位置中的良好的离去基团,有助于酸催化的降解。因此,芳环中的电子密度应足够低,以防止y中的苄基位置的阳离子稳定。
131、表1
132、 取代基 <![cdata[σ<sub>m</sub><sup>[a]</sup>]]> <![cdata[σ<sub>p</sub><sup>[a]</sup>]]> 取代基 <![cdata[σ<sub>m</sub><sup>[a]</sup>]]> <![cdata[σ<sub>p</sub><sup>[a]</sup>]]> -br 0.39 0.23 -cl 0.37 0.23 <![cdata[-n<sub>3</sub>]]> 0.37 0.08 <![cdata[-no<sub>2</sub>]]> 0.71 0.78 -conhme 0.35 0.36 <![cdata[-n=nc<sub>6</sub>h<sub>5</sub>]]> 0.32 0.39 -sh 0.25 0.15 <![cdata[-s<sup>-</sup>]]> -0.36 -1.21 -oh 0.12 -0.35 <![cdata[-o<sup>-</sup>]]> -0.47 (-0.81) <![cdata[-nh<sub>3</sub><sup>+</sup>]]> 0.86 0.60 <![cdata[-nh<sub>2</sub>]]> -0.16 -0.66 <![cdata[-nme<sub>3</sub><sup>+[b]</sup>]]> 0.88 0.82 <![cdata[-nme<sub>2</sub>]]> -0.16 -0.83 <![cdata[-ch<sub>2</sub>nh<sub>3</sub><sup>+</sup>]]> 0.59 0.53 <![cdata[-ch<sub>2</sub>nh<sub>2</sub>]]> -0.03 -0.11 <![cdata[-ch<sub>2</sub>nme<sub>2</sub>h<sup>+</sup>]]> 0.40 0.43 <![cdata[-ch<sub>2</sub>nme<sub>2</sub>]]> 0.00 0.01 -(4-嘧啶基) 0.30 0.63 -(4-吡啶基) 0.27 0.44 -some 0.52 0.49 -sme 0.15 0.00 <![cdata[-so<sub>2</sub>me]]> 0.60 0.72 -ssme 0.22 0.00 <![cdata[-och<sub>2</sub>ch<sub>3</sub>]]> 0.10 -0.24 et -0.07 -0.15
133、[a]σm表示相对于苄基碳的间位取代基的哈米特值和对位取代基的σp值,σp被认为是邻位取代基的σ值的良好的近似值(所有值均根据hansch and taft(1991),chem.rev.91:165-195),[b]-nme3+是-nme2h+的良好近似
134、如果部分y是-(ch2)m-c(=o)-,则该阈值不是必需的,因为-c(=o)-在苄基位置不是良好的离去基团。
135、为了包括杂环部分u的接头分子在酸性条件下的稳定性,选择特定部分v、w和e的这样的额外阈值不是必需的。由于杂环部分本身与苯基部分相比更加缺电子,因此v、w和e的任何组合似乎对于接头分子在酸性条件下的稳定性均足够。尤其是当u是含氮杂环时,在肽的酸性释放期间氮将被质子化,从而使u的芳香族系统的电子密度尤其低。因此,不能稳定苄基阳离子。
136、除了调节接头分子在酸性条件下的稳定性之外,部分v、w和e对于肽的释放机理也是重要的。此外,它们可能在酸性条件下有助于接头分子的溶解性。
137、部分w是可还原的取代基,其触发接头的衰变,并因此触发肽的释放。包括还原的部分w的接头也称为还原的中间体。与稳定的接头分子相反,还原的中间体是不稳定的。还原的中间体的不稳定性是ph依赖性的。如果部分w是可质子化的,例如吡啶基,则它也有助于接头分子在酸性条件下的溶解性。
138、部分e是吸电子取代基,其在酸性条件下显示出吸电子作用。例如,在酸性条件下具有正哈米特常数的部分是吸电子的,特别是在ph 3至6,更特别是在ph 4.5。如果部分e是可质子化的,则它也有助于接头分子在酸性条件下的溶解性。
139、除了部分e之外或替代部分e,部分v在酸性条件下可显示吸电子作用。部分v也可有助于接头在酸性条件下的稳定性和溶解性。
140、根据本发明的接头分子可以经由胺开关机理(参见图5、6和7)或经由氨基甲酸酯开关机理(参见图8)释放肽。
141、部分y是-c(=o)-或-o-c(=o)-部分。在偶联接头分子时,在接头分子与肽的n-末端之间形成酰胺(-c(=o)-nh-)或氨基甲酸酯(-o-c(=o)-nh-)部分。纯化之后,肽通过1.4或1.6消除或亲核攻击在还原性条件下从接头分子中释放,并因此从纯化介质中释放。还原性刺激将w转化为其还原版本,现在起给电子基团和亲核试剂的作用,从而使肽能够释放。
142、在某些实施方式中,x选自式2或3的部分。
143、在某些实施方式中,x选自式2的部分。
144、通过形成腙或肟键而将部分x偶联至官能化的固相所需的反应时间比当使用具有式4的部分的接头时更长并且比当使用具有式2或3的部分的接头时更短。固体载体的醛或酮部分与式3的部分x之间的腙键的形成是可逆的。由于这种可逆性,诸位发明人观察到在纯化期间的每个洗涤步骤之后肽材料的损失最高达约10%。与此相反,当使用具有式2的部分的接头时,几乎没有观察到肽材料的损失。
145、在某些实施方式中,u被c1-6-烷基取代。
146、在某些实施方式中,u被c1-3-烷基取代。
147、在某些实施方式中,u被甲基取代。
148、如果u进一步被一个或多个烷基部分取代,则考虑烷基部分的哈米特值。在u进一步被苯基部分或杂原子取代的情况下,v、w、e和任选的烷基取代基的哈米特值之和大于0.45。在某些实施方式中,e选自哌啶基、哌嗪基、吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-n(c2h4)2nh2、-n(c2h4)2n-b、-n=n-苯基、-n=n-r8、-(ch2)r-nh-c1-6-烷基、-(ch2)r-n(c1-6-烷基)2-、-f、-cl、-br、-i、-cn、-no2、-n3、-cf3、-so3h、-co2h、-c(=o)nh2、-so2me、-some、-so2et、-soet,其中,
149、r8是吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-c1-c6-烷基或-(ch2)p-nme2,特别是吡啶基或-c1-c6-烷基,其中p是1、2、3或4,并且
150、b是如本文定义的酸不稳定的胺保护基团,特别是-c(=o)otbu(boc)或c(=o)cph3,并且
151、r是0、1、2、3或4,特别是0、1或2。在某些实施方式中,e选自哌啶基、哌嗪基、吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-(ch2)r-nh-c1-6-烷基、-(ch2)r-n(c1-6-烷基)2-、-n=n-苯基、-n=n-r8、-f、-cl、-br、-i、-cn、-no2、-n3、-cf3、-so3h、-co2h,其中r是0、1、2、3或4,特别是0、1或2。
152、在某些实施方式中,e选自哌啶基、哌嗪基、吡啶基、嘧啶基、哒嗪基、-nh-c1-6-烷基、-n(c1-6-烷基)2-、-n=n-吡啶基或–br。
153、在某些实施方式中,e选自哌啶基、哌嗪基、吡啶基、嘧啶基、哒嗪基、-nh-c1-6-烷基、-n(c1-6-烷基)2-或–br。
154、在某些实施方式中,e选自吡啶基、嘧啶基、哒嗪基、-nh-c1-6-烷基、-n(c1-6-烷基)2-或–br。
155、在某些实施方式中,e选自吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-n=n-苯基、-n=n-r8、-f、-cl、-br、-i、-cn、-no2、-n3、-cf3、-so3h、-co2h、-c(=o)nh2、-so2me、-some、-so2et、-soet,其中r8是吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-c1-c6-烷基或-(ch2)p-nme2,特别是吡啶基或-c1-c6-烷基,其中p是1、2、3或4。
156、在某些实施方式中,e选自吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-n=n-苯基、-n=n-r8、-f、-cl、-br、-i、-cn、-no2、-n3、-cf3、-so3h、-co2h,其中r8是吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-c1-c6-烷基或-(ch2)p-nme2,特别是吡啶基或-c1-c6-烷基,其中p是1、2、3或4。
157、在某些实施方式中,e选自哌啶基、哌嗪基、吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-(ch2)r-nh-c1-6-烷基、-(ch2)r-n(c1-6-烷基)2-,特别是-(ch2)r-nh-c1-3-烷基、-(ch2)r-n(c1-3-烷基)2-、-f、-cl、-br、-i、-cn、-no2、-n3、-cf3、-so3h、-co2h、-c(=o)nh2、-so2me、-some、-so2et、-soet,其中r是0、1或2,特别是0。
158、在某些实施方式中,e选自吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-f、-cl、-br、-i、-cn、-no2、-n3、-cf3、-so3h、-co2h、-c(=o)nh2、-so2me、-some、-so2et、-soet。
159、在某些实施方式中,e选自哌啶基、哌嗪基、吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-(ch2)r-nh-c1-6-烷基、-(ch2)r-n(c1-6-烷基)2-,特别是-(ch2)r-nh-c1-3-烷基、-(ch2)r-n(c1-3-烷基)2-、-f、-cl、-br、-i、-cn、-no2、-n3、-cf3、-so3h、-co2h。
160、在某些实施方式中,e选自哌啶基、哌嗪基、吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-f、-cl、-br、-i、-cn、-no2、-n3、-cf3、-so3h、-co2h,其中r是0、1或2,特别是0。
161、在某些实施方式中,e选自吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-f、-cl、-br、-i、-cn、-no2、-n3、-cf3、-so3h、-co2h。
162、在某些实施方式中,e选自吡啶基、嘧啶基、哒嗪基、-nh-c1-6-烷基、-n(c1-6-烷基)2-,特别是-nh-c1-3-烷基、-n(c1-3-烷基)2-或-br。
163、在某些实施方式中,e选自吡啶基、嘧啶基、哒嗪基或-br。
164、在某些实施方式中,n是0、1或2。
165、在某些实施方式中,e选自吡啶基、嘧啶基、哒嗪基并且n是1或者e是–br并且n是1或2。
166、经由胺开关(图5、6和7)的肽释放需要可以被质子化的碱性氮。这样的碱性氮可以由部分e提供。
167、在某些实施方式中,e选自-(ch2)r-nh-c1-6-烷基、-(ch2)r-n(c1-6-烷基)2-,特别是-(ch2)r-nh-c1-3-烷基、-(ch2)r-n(c1-3-烷基)2-、哌啶基、哌嗪基、吡啶基、嘧啶基和哒嗪基,其中r是0、1或2,特别是0,其中特别地n是1。
168、在某些实施方式中,e选自-(ch2)r-nh-c1-6-烷基、-(ch2)r-n(c1-6-烷基)2-,特别是-(ch2)r-nh-c1-3-烷基、-(ch2)r-n(c1-3-烷基)2-、吡啶基、嘧啶基和哒嗪基,r是0、1或2,特别是0,并且n是1。
169、特别地,通过氨基甲酸酯开关(图8)释放肽的接头分子包括不被用于还原部分w的还原剂还原的吸电子部分。用于氨基甲酸酯开关的合适的取代基e可以是非可质子化的,诸如卤素或硝基取代基。同样,特征在于相应的酸的pka<0的取代基是用于氨基甲酸酯开关的合适的取代基e。
170、在某些实施方式中,e是–f、-cl、-br、-i、-no2、-cf3、-cn、-nc、bf2、-pf4、-ocf3、-socf3、-sor8、-so2r8。
171、在某些实施方式中,e是-br。
172、在某些实施方式中,e是–br并且n是1或2。
173、如果接头在酸性条件下的溶解性应增加,例如用于纯化疏水性肽,则e可以选自可质子化的部分。在某些实施方式中,e选自哌啶基、哌嗪基、吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-n(c2h4)2nh2、-n(c2h4)2n-b、-n=n-r8、-(ch2)r-nh-c1-6-烷基、-(ch2)r-n(c1-6-烷基)2-、-so3h、-co2h、-c(=o)nh2、-so2me、-some、-so2et、-soet,其中r8选自吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-(ch2)p-nme2,其中p是1、2、3或4,特别是1或2。
174、在某些实施方式中,b选自
175、-boc(-c(=o)otbu)、eei(=cmeoet、1-乙氧基乙亚基)、三苯甲基(-c(ph)3)、-c(=o)cph3、mmt(-c(ph)2c6h4ome)、dmt(-c(ph)(c6h4ome)2)、cbz(-c(=o)och2ph)、苯甲亚基胺(=cph)、邻苯二甲酰亚胺(=(co)2c6h4)、对甲苯磺酰胺(-so2c6h4me)、苄胺(-ch2ph)、乙酰胺(-come)、三氟乙酰胺(-cocf3)、dde(1-(4,4-二甲基-2,6-二氧代环己-1-亚基)-3-乙基)和1-(4,4-二甲基-2,6-二氧代环己-1-亚基)-3-甲基丁基(ivdde),其中特别地b是boc或eei,其中更特别地b是boc,或者
176、-缩醛-或缩酮保护基团选自
177、
178、其中r是0至12,特别是0至6,更特别是0、1或2,并且
179、r10是-c1-c12-烷基-,特别是c1-6-烷基,更特别是c1-3-烷基。
180、在某些实施方式中,b选自
181、-boc(-c(=o)otbu)、eei(=cmeoet、1-乙氧基乙亚基)、三苯甲基(-c(ph)3)、mmt(-c(ph)2c6h4ome)、dmt(-c(ph)(c6h4ome)2)、cbz(-c(=o)och2ph)、苯甲亚基胺(=cph)、邻苯二甲酰亚胺(=(co)2c6h4)、对甲苯磺酰胺(-so2c6h4me)、苄胺(-ch2ph)、乙酰胺(-come)、三氟乙酰胺(-cocf3)、dde(1-(4,4-二甲基-2,6-二氧代环己-1-亚基)-3-乙基)和1-(4,4-二甲基-2,6-二氧代环己-1-亚基)-3-甲基丁基(ivdde),其中特别地b是boc或eei,其中更特别地b是boc,或者
182、-缩醛-或缩酮保护基团选自
183、
184、其中r是0至12,特别是0至6,更特别是0、1或2,并且
185、r10是-c1-c12-烷基-,特别是c1-6-烷基,更特别是c1-3-烷基。
186、在某些实施方式中,b选自boc(-c(=o)otbu)、eei(=cmeoet、1-乙氧基乙亚基)、三苯甲基(-c(ph)3)、mmt(-c(ph)2c6h4ome)、dmt(-c(ph)(c6h4ome)2)、cbz(-c(=o)och2ph)、苯甲亚基胺(=cph)、邻苯二甲酰亚胺(=(co)2c6h4)、对甲苯磺酰胺(-so2c6h4me)、苄胺(-ch2ph)、乙酰胺(-come)、三氟乙酰胺(-cocf3)、dde(1-(4,4-二甲基-2,6-二氧代环己-1-亚基)-3-乙基)和1-(4,4-二甲基-2,6-二氧代环己-1-亚基)-3-甲基丁基(ivdde)。
187、在某些实施方式中,b是boc或eei(=cmeoet、1-乙氧基乙亚基)。
188、在某些实施方式中,b是boc。
189、在某些实施方式中,b选自缩醛-或缩酮保护基团,其选自
190、
191、其中r是0至12,特别是0至6,更特别是0、1或2,并且r10是-c1-c12-烷基-,特别是c1-6-烷基。
192、在某些实施方式中,t是直链或支链间隔基,其包括以下部分中的至少一个:-c1-12-烷基-、(-c2h4o-)1-12、-c(=o)-、-c(=o)-jr9-、-jr9-c(=o)-、-jr9-、苯基、5元或6元杂芳基,其中j是ch或n,特别是n,其中r9独立地选自h、c1-4-烷基、-c1-6-烷基-nh2、-c1-6-烷基-nhb、-c1-6-烷基-nb2,特别地选自h和c1-2-烷基,更特别地r9是h,其中b是独立选择的酸不稳定的胺保护基团。
193、在某些实施方式中,t是直链或支链间隔基,特别是直链间隔基,其包括1至5个独立地选自以下的部分:-c1-12-烷基-、(-c2h4o-)1-12、-c(=o)-、-c(=o)-jr9-、-jr9-c(=o)-、-jr9-、苯基、5元或6元杂芳基,
194、在某些实施方式中,t是直链或支链间隔基,其包括以下部分中的至少一个,特别是1至5个:-c1-12-烷基-、-c(=o)-、-c(=o)-nr9-、-nr9-c(=o)-、-nr9-、苯基、哌嗪基、吡咯基、吡唑基、咪唑基、吡啶基、嘧啶基、吡嗪基和哒嗪基,
195、在某些实施方式中,t是直链或支链间隔基,其包括以下部分中的至少一个,特别是1至5个:-c1-12-烷基-、-c(=o)-、-c(=o)-nr9-、-nr9-c(=o)-、-nr9-、苯基、咪唑基、吡啶基、嘧啶基、吡嗪基和哒嗪基,
196、在某些实施方式中,t是直链间隔基。
197、在某些实施方式中,t是直链或支链间隔基,其包括以下部分中的至少一个:-c1-12-烷基-、(-c2h4o-)1-12、-c(=o)-、-c(=o)-jr9-、-jr9-c(=o)-、-jr9-,其中j是c或n,特别是n,其中r9独立地选自h、c1-4-烷基、-c1-6-烷基-nh2、-c1-6-烷基-nhb、-c1-6-烷基-nb2,特别地选自h和c1-2-烷基,更特别地r9是h,其中b是独立选择的酸不稳定的胺保护基团。
198、在某些实施方式中,间隔基t的总长度是0.5和100nm之间。
199、在某些实施方式中,t选自-c1-c12-烷基-,特别是c1-6-烷基、更特别是c1-3-烷基,-r5-c(=o)-,-r5-c(=o)-nr9-r6-,-r5-c(=o)-nr9-,-c(=o)-nr9-r6-,-r5-nr9-c(=o)-r6-,-r5-nr9-r5’-nr9’c(=o)-r6-,-r5-c(=o)-nr9-r5’-nr9’-c(=o)-r6-,-r5-nr9-,-r5-nr9-r6-,-r5-nr9-r5’-nr9’-r6-,-r5-c(=o)-nr9-r5’-nr9’-r6-,-r5-c(=o)-o-r6-,-c(=o)-o-r6-,-r5-苯基-r6-,-r5-苯基-,-苯基-r6-,-苯基-,-r5-吡咯基,-r5-吡唑基,-r5-咪唑基,r5-哌嗪基-,-r5-吡啶基,-r5-嘧啶基,-r5-吡嗪基,-r5-哒嗪基,-r5-吡咯基-r6-,-r5-吡唑基-r6-,-r5-咪唑基-r6-,-r5-哌嗪基-r6-,-r5-吡啶基-r6-,-r5-嘧啶基-r6-,-r5-吡嗪基-r6-,-r5-哒嗪基-r6-,吡咯基-r6-,吡唑基-r6-,咪唑基-r6-哌嗪基-r6-,吡啶基-r6-,嘧啶基-r6-,吡嗪基-r6-,哒嗪基-r6-,吡咯基,吡唑基,咪唑基,哌嗪基,吡啶基,嘧啶基,吡嗪基和哒嗪基。
200、在某些实施方式中,t选自-c1-c12-烷基-(特别是c1-6-烷基、更特别是c1-3-烷基)、-r5-c(=o)-、-r5-c(=o)-nr9-r6-、-r5-c(=o)-nr9-、-c(=o)-nr9-r6-、-r5-nr9-c(=o)-r6-、-r5-nr9-r5’-nr9’c(=o)-r6-、-r5-c(=o)-nr9-r5’-nr9’-c(=o)-r6-、-r5-nr9-、-r5-nr9-r6-、-r5-nr9-r5’-nr9’-r6-、-r5-c(=o)-nr9-r5’-nr9’-r6-、-r5-c(=o)-o-r6-、-c(=o)-o-r6-、-r5-苯基-r6-、-r5-苯基-、-苯基-r6-、-苯基-、-r5-咪唑基、-、-r5-咪唑基-r6-、咪唑基-r6-、咪唑基。
201、在某些实施方式中,t选自-c1-c12-烷基-(特别是c1-6-烷基、更特别是c1-3-烷基)、-r5-c(=o)-、-r5-c(=o)-nr9-r6-、-r5-c(=o)-nr9-、-c(=o)-nr9-r6-、-r5-nr9-c(=o)-r6-、-r5-nr9-r5’-nr9’c(=o)-r6-、-r5-c(=o)-nr9-r5’-nr9’-c(=o)-r6-、-r5-nr9-、-r5-nr9-r6-、-r5-nr9-r5’-nr9’-r6-、-r5-c(=o)-nr9-r5’-nr9’-r6-、-r5-c(=o)-o-r6-、-c(=o)-o-r6-、-r5-咪唑基、-、-r5-咪唑基-r6-、咪唑基-r6-、咪唑基。
202、在某些实施方式中,t选自-c1-c12-烷基-(特别是c1-6-烷基、更特别是c1-3-烷基)、-r5-c(=o)-、-r5-c(=o)-nr9-r6-、-r5-c(=o)-nr9-、-c(=o)-nr9-r6-、-r5-nr9-c(=o)-r6-、-r5-nr9-r5’-nr9’c(=o)-r6-、-r5-c(=o)-nr9-r5’-nr9’-c(=o)-r6-、-r5-nr9-、-r5-nr9-r6-、-r5-nr9-r5’-nr9’-r6-、-r5-c(=o)-nr9-r5’-nr9’-r6-、-r5-c(=o)-o-r6-、-c(=o)-o-r6-。
203、在某些实施方式中,t选自-c1-c12-烷基-(特别是c1-6-烷基、更特别是c1-3-烷基)、-r5-c(=o)-、-r5-c(=o)-nr9-、-r5-nr9-c(=o)-r6-、-r5-c(=o)-nr9-r6-、-r5-c(=o)-nr9-r5’-nr9’c(=o)-r6-,特别是c1-3-烷基、-r5-c(=o)-nr9-、-r5-nr9-c(=o)-r6-,更特别是c1-3-烷基或-r5-c(=o)-nr9-,其中r5、r5*、r6、r9’和r9如以上定义。
204、在某些实施方式中,t是直链或支链间隔基,其包括以下部分中的至少一个,特别是1至5个:-c1-12-烷基-、-c(=o)-、-c(=o)-nr9-、-nr9-c(=o)-、-nr9-、苯基、5元至6元杂芳基,其中r9独立地选自h、c1-4-烷基、-c1-6-烷基-nh2、-c1-6-烷基-nhb、-c1-6-烷基-nb2、-r15、-c1-6-烷基-r15、-c1-6-烷基-nh-r15,特别地选自h和c1-2-烷基,更特别地r9是h,其中b是独立选择的酸不稳定的胺保护基团,其中,
205、r15是能与醛部分反应的封闭剂,特别地r15选自半胱氨酰基、苏氨酰基、2-巯基乙醇、半胱胺、乙二硫醇、羟胺、o-甲基羟胺、n-甲基羟胺、二硫苏糖醇、肼,特别是半胱氨酰基和n-甲基羟胺,更特别是半胱氨酰基,其中,
206、所述封闭剂的胺和/或硫醇部分可被独立选择的酸不稳定的胺保护基团b,特别是boc,和/或酸不稳定的硫醇保护基团,特别是三苯甲基保护。
207、在某些实施方式中,t是直链或支链间隔基,其包括以下部分中的至少一个,特别是1至5个:-c1-12-烷基-、-c(=o)-、-c(=o)-nr9-、-nr9-c(=o)-、-nr9-、苯基、吡咯基、吡唑基、咪唑基、哌嗪基、吡啶基、嘧啶基、吡嗪基和哒嗪基,
208、在某些实施方式中,t是直链或支链间隔基,其包括以下部分中的至少一个,特别是1至5个:-c1-12-烷基-、-c(=o)-、-c(=o)-nr9-、-nr9-c(=o)-、-nr9-、苯基、咪唑基、吡啶基、嘧啶基、吡嗪基和哒嗪基,
209、在某些实施方式中,t是直链或支链间隔基,其包括以下部分中的至少一个:-c1-12-烷基-、-c(=o)-、-c(=o)-nr9-、-nr9-c(=o)-、-nr9-,其中r9独立地选自h、c1-4-烷基、-c1-6-烷基-nh2、-c1-6-烷基-nhb、-c1-6-烷基-nb2、-r15、-c1-6-烷基-r15、-c1-6-烷基-nh-r15,特别地选自h和c1-2-烷基,更特别地r9是h,其中b是独立选择的酸不稳定的胺保护基团,
210、r15是能与醛部分反应的封闭剂,特别地r15选自半胱氨酰基、苏氨酰基、2-巯基乙醇、半胱胺、乙二硫醇、羟胺、o-甲基羟胺、n-甲基羟胺、二硫苏糖醇、肼,特别是半胱氨酰基和n-甲基羟胺,更特别是半胱氨酰基,其中,
211、所述封闭剂的胺和/或硫醇部分可被独立选择的酸不稳定的胺保护基团b,特别是boc,和/或酸不稳定的硫醇保护基团,特别是三苯甲基保护。
212、如上所述,间隔基t在通常应用的纯化条件下通常是非反应性的,除了在酸性条件下去除保护基团外。间隔基t可以增强接头分子的溶解性。特别地,在r9处包括受保护的或未保护的胺部分的支链间隔基有助于增强溶解性。在酸性条件下,去除胺保护基团b,并使胺质子化。
213、在某些实施方式中,t是直链或支链间隔基,其包括以下部分中的至少一个:-c1-12-烷基-、-c(=o)-、-c(=o)-nr9-、-nr9-c(=o)-、-nr9-,其中r9独立地选自h、c1-4-烷基、-c1-6-烷基-nh2、-c1-6-烷基-nhb、-c1-6-烷基-nb2,特别地选自h和c1-2-烷基,更特别地r9是h,其中b是独立选择的酸不稳定的胺保护基团。
214、间隔基t也可以包括封闭功能。特别地,支链间隔基可以包括适于结合醛部分的封闭剂。当用于肽纯化的固相包括醛部分时,例如琼脂糖珠,接头化合物的部分x可以例如通过形成肟键共价结合到固相上。未反应的醛部分可能在后续纯化期间引起不想要的副反应。为防止这样的副反应,固相的未反应的醛部分可通过间隔基的封闭功能封闭,例如半胱氨酰基部分。
215、在某些实施方式中,t是直链或支链间隔基,其包括以下部分中的至少一个:-c1-12-烷基-、-c(=o)-、-c(=o)-nr9-、-nr9-c(=o)-、-nr9-,其中r9独立地选自h、c1-4-烷基、-r15、-c1-6-烷基-r15、-c1-6-烷基-nh-r15,特别地选自h和c1-2-烷基,更特别地r9是h,其中b是独立选择的酸不稳定的胺保护基团,
216、r15是能与醛部分反应的封闭剂,特别地r15选自半胱氨酰基、苏氨酰基、2-巯基乙醇、半胱胺、乙二硫醇、羟胺、o-甲基羟胺、n-甲基羟胺、二硫苏糖醇、肼,特别是半胱氨酰基和n-甲基羟胺,更特别是半胱氨酰基,其中,
217、所述封闭剂的胺和/或硫醇部分可被独立选择的酸不稳定的胺保护基团b,特别是boc,和/或酸不稳定的硫醇保护基团,特别是三苯甲基保护。
218、在某些实施方式中,t选自-c1-c12-烷基-(特别是c1-6-烷基、更特别是c1-3-烷基)、-r5-c(=o)-nr9-r6-、-c(=o)-nr9-r6-、-r5-nr9-c(=o)-r6-、-r5-c(=o)-o-r6-、-c(=o)-o-r6-、-r5-nr9-r5-nr9c(=o)-r6-,特别地选自-c1-c12-烷基-,特别是c1-6-烷基,更特别是c1-3-烷基、-r5-nr9-c(=o)-r6-、-r5-c(=o)-nr9-r6-、-r5-nr9-r5-nr9c(=o)-r6-,最特别是-r5-nr9-c(=o)-r6-,其中r5、r6和r9如以上定义。
219、如上所述,部分u、v、w和e有助于接头在酸性条件下的稳定性。例如,当胺或杂环被质子化时,包括部分u或v的接头在酸性条件下(特别地tfa>50%,在水存在下,ph<0)是稳定的,该部分u或v包括胺或杂环,诸如吡啶。此外,质子化的接头改善了接头-肽复合物的溶解性。如果ph高于接头的pka,则接头将在所期望的肽释放期间中作为最后步骤迅速分解。
220、在某些实施方式中,v是吸电子部分,其选自-nr11-c(=o)-、-c(=o)-nr11-、-s(=o)-、-nr12-(ch2)p-、-哌嗪基-(ch2)p-、-吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-c(=o)-、-c(=o)-o-,其中,
221、r11选自h和c1-4-烷基,特别地选自h和c1-2-烷基,更特别地r11是h,
222、r12选自h和c1-4-烷基,特别地选自h和c1-2-烷基,更特别地r12是甲基,
223、p是0、1或2,特别是0或1。
224、在某些实施方式中,v是吸电子部分,其选自-nr11-c(=o)-、-c(=o)-nr11-、-s(=o)-、-nr12-(ch2)p-、-哌嗪基-(ch2)p-、-吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-c(=o)-、-c(=o)-o-,其中吡啶基部分在位置3处连接至u。
225、在某些实施方式中,v选自-nr11-c(=o)-、-c(=o)-nr11-、-s(=o)-、-nr12-(ch2)p-、-哌嗪基-(ch2)p-。
226、在某些实施方式中,v选自-nr11-c(=o)-、-c(=o)-nr11-、-nr12-(ch2)p-、-哌嗪基-(ch2)p-。
227、在某些实施方式中,v选自-nh-c(=o)-、-c(=o)-nh-、-n-(ch3)-、-nh-、-哌嗪基-(ch2)p-。
228、在某些实施方式中,v选自-nh-c(=o)-、-c(=o)-nh-、-n-(ch3)-、-哌嗪基-(ch2)p-。
229、在某些实施方式中,v选自-nh-c(=o)-、-c(=o)-nh-、-n-(ch3)-、-哌嗪基-(ch2)p-,其中p是0或1。
230、在某些实施方式中,v选自-nh-c(=o)-、-c(=o)-nh-和-哌嗪基-(ch2)p-,其中p是0或1,特别地p是0。
231、特别地经由氨基甲酸酯开关(图8)释放肽的接头分子不包括碱性氮原子,其中这样的原子具有低于2的相应的酸的pka。在某些实施方式中,v选自-nr11-c(=o)-、-c(=o)-nr11-和-s(=o)-,特别地选自-nh-c(=o)-和–c(o=)-nh-,更特别地v是–nh-c(=o)-。
232、v是吸电子部分,其选自-nr11-c(=o)-、-c(=o)-nr11-、-s(=o)-、-nr12-、-哌嗪基-、-吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-c(=o)-、-c(=o)-o-,其中r11选自h和c1-4-烷基,特别地选自h和c1-2-烷基,更特别地r11是h,r12选自h和c1-4-烷基,特别地选自h和c1-2-烷基,更特别地r12是甲基。
233、v是吸电子部分,其选自-nr11-c(=o)-、-c(=o)-nr11-、-s(=o)-、-nr12-、-哌嗪基-、-吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-c(=o)-、-c(=o)-o-,其中r11选自h和c1-4-烷基,特别地选自h和c1-2-烷基,更特别地r11是h,r12选自h和c1-4-烷基,特别地选自h和c1-2-烷基,更特别地r12是甲基。
234、v是吸电子部分,其选自-nr11-c(=o)-、-c(=o)-nr11-、-s(=o)-、-nr12-、-哌嗪基-、-吡啶基-、嘧啶基,其中r11选自h和c1-4-烷基,特别地选自h和c1-2-烷基,更特别地r11是h,r12选自h和c1-4-烷基,特别地选自h和c1-2-烷基,更特别地r12是甲基。
235、v是吸电子部分,其选自-nr11-c(=o)-、-c(=o)-nr11-、-nr12-、-哌嗪基-、-吡啶基-、嘧啶基,其中r11选自h和c1-4-烷基,特别地选自h和c1-2-烷基,更特别地r11是h,r12选自h和c1-4-烷基,特别地选自h和c1-2-烷基,更特别地r12是甲基。
236、v是吸电子部分,其选自-nh-c(=o)-、-c(=o)-hn-、-n-(ch3)-、-哌嗪基-、-吡啶基-、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基。
237、v是吸电子部分,其选自-nh-c(=o)-、-c(=o)-hn-、-n-(ch3)-、-哌嗪基-、-吡啶基-、嘧啶基。
238、在某些实施方式中,v是吸电子部分,其选自-nr11-c(=o)-、-c(=o)-nr11-、-s(=o)-、-nr12-、-吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-c(=o)-、-c(=o)-o-。
239、在某些实施方式中,v选自-nr11-c(=o)-、-c(=o)-nr11-、-s(=o)-、-nr12-和-吡啶基-、嘧啶基,其中r11选自h和c1-4-烷基,特别地选自h和c1-2-烷基,更特别地r11是h,并且r12选自h和c1-4-烷基,特别地选自h和c1-2-烷基,更特别地r12是甲基。
240、在某些实施方式中,v选自-nr11-c(=o)-、s(=o)-、-nr12-、-吡啶基-、嘧啶基,其中r11选自h和c1-4-烷基,并且r12选自h和c1-4-烷基。
241、在某些实施方式中,v选自-nr11-c(=o)-、s(=o)-、-nr12-、-吡啶基-、嘧啶基,其中r11选自h和c1-2-烷基,并且r12选自h和c1-2-烷基。
242、在某些实施方式中,v选自-nh-c(=o)-、-n-(ch3)-、-吡啶基-、嘧啶基。
243、特别地,经由胺开关释放肽的接头分子需要碱性氮原子。碱性氮原子可以经由部分v、e或u(u=杂芳基)提供。如果u是苯基,则碱性氮原子可以经由部分v或e提供。
244、在某些实施方式中,e和v如上所述选择,其中在u是苯基的情况下,至少一个部分e或v选自
245、-e:哌啶基、哌嗪基、吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-n(c2h4)2nh2、-n(c2h4)2n-b、-n=n-r8、-(ch2)r-nh-c1-6-烷基、-(ch2)r-n(c1-6-烷基)2-、-n3、-so3h、-co2h、-c(=o)nh2、-so2me、-some、-so2et、-soet,其中r8选自吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-(ch2)p-nme2,p和b如本文所述定义,并且
246、-v:-nr12-(ch2)p-、-哌嗪基-(ch2)p-、-吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、特别是-nr12-(ch2)p-、-哌嗪基-(ch2)p-、-吡啶基-、嘧啶基,其中r12和p如本文所述定义。
247、如上所述,w是可还原部分。在w还原时,还原的中间体进一步以ph依赖性方式衰变以释放具有游离的n-末端的肽。
248、在某些实施方式中,w选自-n3、-no2、-s(=o)-r8、-s-s-r8、-o-ch2-n3、-o-c(=o)-o-ch2-n3、-n=n-苯基、-n=n-r8、其中,
249、r8是吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-c1-c6-烷基或-(ch2)p-nme2,特别是吡啶基或-c1-c6-烷基,其中p是1、2、3或4。c1-6-烷基可以是直链或支链的,例如,丁基或叔丁基。
250、在某些实施方式中,w选自-n3、-no2、-s(=o)-r8、-s-s-r8、-o-ch2-n3、-o-c(=o)-o-ch2-n3、-n=n-苯基、-n=n-r8、
251、在某些实施方式中,w选自-n3、-s(=o)-r8、-s-s-r8、-o-ch2-n3、-n=n-r8,特别是-n3、-n=n-r8、-o-ch2-n3、-s-s-r8,其中r8是吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-c1-c6-烷基或-(ch2)p-nme2,特别是吡啶基或-c1-c6-烷基,其中p是1、2、3或4。
252、在某些实施方式中,w选自-n3、-s(=o)-r8、-s-s-r8、-o-ch2-n3、-n=n-r8,特别是-n3、-n=n-r8、-o-ch2-n3、-s-s-r8,其中r8是吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-c1-c6-烷基或-(ch2)p-nme2,特别是吡啶基或-c1-c6-烷基,其中p是1、2、3或4。
253、在r8是c1-6-烷基的情况下,烷基部分可以是直链或支链的,例如叔丁基。特别是在w是-s-s-r8的情况下,r8可以是吡啶基或-c1-c4-烷基,特别是吡啶基或叔丁基。
254、包括部分w=-s-s-r8的接头可以用硫醇裂解。因此,当这样的接头用于肽纯化时,在酸性条件下(例如,tfa>50%,在水存在下,ph<0)从在spps期间使用的合成树脂上裂解肽-接头复合物可以在没有硫醇的情况下进行。
255、在某些实施方式中,w选自-n3、-s(=o)-r8、-s-s-r8、-o-ch2-n3、-n=n-r8,特别是-n3、-n=n-r8、-o-ch2-n3、-s-s-r8,其中r8是吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基或-c1-c6-烷基,或者,特别是嘧啶基、吡啶基或-c1-c6-烷基,更特别是吡啶基或-c1-c6-烷基。
256、在某些实施方式中,w选自–n3、-s-s-r8,其中r8是-c1-c6-烷基和–no2。
257、经由具有叠氮基还原性安全锁的胺开关(图5)或通过氨基甲酸酯开关(图8)释放肽的接头分子包括可还原部分–n3。在某些实施方式中,w是–n3。
258、经由具有没有叠氮基的还原性安全锁的胺开关(图6)释放肽的接头分子包括可还原部分,诸如–no2或–s-s-叔丁基。在某些实施方式中,w选自–s-s-r8(其中r8是-c1-c6-烷基)、-no2、--n=n-r8(其中r8是吡啶基、嘧啶基、吡嗪基或哒嗪基),
259、在某些实施方式中,w选自–s-s-r8(其中r8是-c1-c6-烷基)、-no2、-n=n-r8(其中r8是吡啶基、嘧啶基、吡嗪基或哒嗪基),特别是-no2或–s-s-r8(其中r8是-c1-c6-烷基)。
260、经由具有亲核释放的胺开关(图7)释放肽的接头分子包括可还原部分,诸如–n3、-s-s-r8,其中r8是c1-6-烷基,特别是叔丁基,或者r8是吡啶基。
261、如上所述,接头分子可以有助于接头-肽构建体在酸性条件下的溶解性,特别是在疏水性肽的纯化期间。溶解性还可以通过部分w来调节,即,w选自向将在0-7的ph范围内纯化的肽引入增强的溶解性的基团。
262、在某些实施方式中,w选自-s(=o)-r8、-s-s-r8、-n=n-r8、其中,
263、r8是吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-(ch2)p-nhboc或-(ch2)p-nme2,特别是吡啶基或-(ch2)p-nhboc-,其中p是1、2、3或4。
264、在某些实施方式中,u选自苯基或五元或六元杂环,其中五元或六元杂环包括1或2个杂原子。
265、在某些实施方式中,u选自苯基或五元或六元杂环,其中五元或六元杂环包括1个杂原子。
266、在某些实施方式中,u选自苯基或六元杂环。
267、在某些实施方式中,u选自苯基或六元杂环,其中六元杂环包括1或2个杂原子。
268、在某些实施方式中,u的五元或六元杂芳基部分包括1或2个杂原子,特别地部分u的五元杂芳基部分选自吡唑、咪唑,并且部分u的六元杂芳基部分选自吡啶、哒嗪、嘧啶、吡嗪,特别是吡啶。
269、在某些实施方式中,u选自苯基或六元杂环,其中六元杂环包括1个杂原子。在某些实施方式中,部分u的五元杂环选自吡唑、咪唑,并且部分u的六元杂环选自吡啶、哒嗪、嘧啶、吡嗪。
270、在某些实施方式中,u选自苯基、吡啶、哒嗪、嘧啶、吡嗪,特别是苯基或吡啶,更特别是苯基。
271、根据本发明的接头可以通过胺开关(图5至图7)或氨基甲酸酯开关(图8)释放肽。这些释放机理需要可还原取代基w在相对于部分y的邻位或对位,
272、在某些实施方式中,u选自式5或6的部分,
273、
274、其中,
275、t、v、y、w和e如上所述定义,
276、u结合至部分t或v,
277、a1、a2、a3、a4和d1、d2、d3、d4彼此独立地选自c、n、s和o,特别地选自c和n,并且
278、n是0和3之间的整数,特别是0、1或2。
279、在某些实施方式中,a1、a2、a3和a4或d1、d2、d3和d4中的2至4个部分是c,特别地a1、a2、a3和a4或d1、d2、d3和d4中的3或4个部分是c。
280、在某些实施方式中,所有部分a1、a2、a3和a4或d1、d2、d3和d4是c,
281、在某些实施方式中,u选自式5、6、7或8的部分,
282、
283、其中,
284、t、v、y、w和e如上所述定义,
285、在式5和6的情况下,u结合至所述部分t或v,
286、在式7和8的情况下,u结合至所述部分v,
287、a1、a2、a3、a4和d1、d2、d3、d4彼此独立地选自c、n、s和o,特别地选自c和n,其中a1、a2、a3和a4或d1、d2、d3和d4中的2至4个部分是c,特别地a1、a2、a3和a4或d1、d2、d3和d4中的3或4个部分是c,更特别地所有部分a1、a2、a3和a4或d1、d2、d3和d4是c,n是
288、在式5和6的情况下,0和3之间的整数,
289、在式7和8的情况下,0和4之间的整数,
290、q是0和4之间的整数,其中n和q之和等于或小于4。
291、在某些实施方式中,u选自式5或6的部分。
292、在某些实施方式中,u选自式5、6、7或8的部分,其中,
293、t、v、y、w和e如上所述定义,
294、在式5和6的情况下,u结合至所述部分t或v,
295、在式7和8的情况下,u结合至所述部分v,
296、a1、a2、a3、a4和d1、d2、d3、d4彼此独立地选自c、n、s和o,特别地选自c和n,
297、n是
298、在式5和6的情况下,0和2之间的整数,
299、在式7和8的情况下,0和2之间的整数,特别是0和1,
300、q是0和2之间的整数,特别是0和1。
301、在某些实施方式中,u选自式9、10、11或12的部分,特别是式9或10的部分,
302、
303、其中,
304、t、v、y、w、e、q和n如上所述定义,
305、在式9和10的情况下,u结合至所述部分t或v,
306、在式11和12的情况下,u结合至所述部分v,
307、所有部分a2、a3和a4是c或a2、a3和a4中的两个是c并且a2、a3和a4中的其他两个是n,特别地a2和a3均是c,并且
308、d2是c或n,特别是c。
309、在某些实施方式中,u选自式9、10、11或12的部分,特别是式9或10的部分,
310、
311、其中,
312、t、v、y、w、e、q和n如上所述定义,
313、在式9和10的情况下,u结合至所述部分t或v,
314、在式11和12的情况下,u结合至所述部分v,
315、a2和a3均是c或a2和a3中的一个是c并且a2和a3中的另一个是n,d2是c或n。
316、如果部分u包括含n的杂芳基,则n原子在酸性条件下被质子化并因此增加了接头分子的溶解性。
317、在某些实施方式中,u选自式13、14、15、16、17、18、19、20或21的部分,特别是式13至19的部分,更特别是式15或19的部分,
318、
319、
320、其中,
321、t、v、y、w、e、q和n如上所述定义,
322、在式13、14和15的情况下,u结合至所述部分t或v,
323、在式16、17和18的情况下,u结合至所述部分v,
324、a2、a3和a4是c、n或n+me,特别是c,
325、d2是c或n。
326、在某些实施方式中,u选自式13、14、15、16、17、18、19、20、21或22的部分,
327、其中t、v、y、w、e、q和n如上所述定义,
328、在式13、14、15、19、20、21和22的情况下,u结合至部分t或v,
329、在式16、17和18的情况下,u结合至所述部分v,
330、a2、a3和a4是c或n,特别是c,
331、d2是c或n。在某些实施方式中,u选自式13、14、15、16、17或18的部分,
332、
333、其中,
334、t、v、y、w、e、q和n如上所述定义,
335、在式13、14和15的情况下,u结合至所述部分t或v,
336、在式16、17和18的情况下,u结合至所述部分v,
337、a3是c或n,
338、d2是c或n。
339、在某些实施方式中,u选自式13、14、15、21或22的部分,其中,
340、t、v、y、w、e和n如上所述定义,
341、u结合至部分t或v,
342、a3和a4是c或n,特别是c,
343、d2是c或n。
344、在某些实施方式中,u选自式13、21或22的部分。
345、特别是对于经由氨基甲酸酯开关释放肽的接头分子,u是苯基。在某些实施方式中,u如上所述选择并且所有a和所有d都是c。
346、对于具有还原性安全锁的胺开关(图5和6)和氨基甲酸酯开关(图8),部分y特别是-(ch2)m-o-c(=o)-以允许当接头的衰变被ph变化触发以释放具有游离的n-末端的肽时释放co2。
347、在某些实施方式中,u是式13、14、15、16、17、18、19、20、21或22的部分并且y是-(ch2)m-o-c(=o)-。
348、在某些实施方式中,u是式13、14、15、21或22的部分,并且y是-(ch2)m-o-c(=o)-。
349、在某些实施方式中,u是式13或21的部分,并且y是-(ch2)m-o-c(=o)-。
350、对于具有亲核释放的胺开关(图7),如果部分y与肽形成酰胺键,接头仅在酸性条件下稳定。在某些实施方式中,y是-(ch2)m-c(=o)-。
351、如果接头分子以–cooh结束,则肽可以经由普通氨基酸偶联偶联至肽。在某些实施方式中,y是-(ch2)m-c(=o)-并且z是–oh。
352、对于具有亲核释放的胺开关,特别地u是式22的部分,y是-(ch2)m-c(=o)-并且z是–oh。
353、在某些实施方式中,z选自:-f、-cl、-br、-i、-n3、-oh、-o(c=o)ch2(c=o)oh-sr14、-ocf3、-och2cf3、-oso2cf3、-so2c6h4ch3、-so2cf3、-so2ch3
354、
355、特别是-oh、-cl、特别是-oh、
356、
357、其中r14是c1-c6-烷基-、芳基-或苄基取代基。
358、适用于通过具有叠氮基还原性安全锁的胺开关(图5)释放肽的类型1的接头分子可以由以下部分构成:
359、u是苯基或嘧啶基,特别地u是式13、14、15、21或22,
360、w是–n3,
361、e的n是1并且e选自吡啶基、嘧啶基、哒嗪基、-n(ch3)2、-n=n-吡啶基或n是0,特别地n是0,
362、v的a是1并且v选自–哌嗪基-、-哌嗪基-ch2-、-n(ch3)-、嘧啶基、吡啶基,特别地选自–哌嗪基-、-哌嗪基-ch2-、-n(ch3)-,并且
363、y是-(ch2)m-o-c(=o)-,其中m是1、2或3,特别是1或2,更特别是1。
364、吡啶基部分在位置3或5处连接至u。
365、在某些实施方式中,u选自式13、14、15、21或22的部分,
366、适用于通过没有叠氮基的胺开关(图6)释放肽的类型2的接头分子可以由以下部分构成:
367、u是吡啶基或苯基,特别地u是式13、14或21,
368、w选自–s-s-叔丁基、-no2、-n=n-吡啶基、特别地选自–s-s-叔丁基、-no2,
369、e的n是0,
370、v的a是1并且v选自–c(=o)-nh-和哌嗪基,并且
371、y是-(ch2)m-o-c(=o)-,其中m是1、2或3,特别是1或2,更特别是1。
372、在某些实施方式中,u选自式13、14或21的部分,
373、适用于通过具有亲核释放的胺开关(图7)释放肽的类型3的接头分子可以由以下部分构成:
374、u是苯基或吡啶基,特别是苯基,更特别地u是式13或14的部分,
375、w是–n3、-s-s-叔丁基、-s-s-吡啶基,特别是–n3,
376、e的n是0,
377、v的a是1并且v是哌嗪基、-nh-、-c(=o)-nh-,特别是哌嗪基,并且
378、y是-(ch2)m-c(=o)-,其中m是1、2或3,特别是1或2,更特别是1。
379、在某些实施方式中,u选自式13或14的部分,其中特别地所有部分d和a是c。
380、适用于通过氨基甲酸酯开关(图8)释放肽的类型4的接头分子可以由以下部分构成:
381、u是苯基,特别地u是式13或15,其中特别地部分a是c,
382、w是–n3,
383、e的n是1或2并且e是–br,
384、v的a是1并且v是–nh-c(=o)-,并且
385、y是-(ch2)m-o-c(=o)-,其中m是1、2或3,特别是1或2,更特别是1。
386、在某些实施方式中,u选自式13或15的部分,其中特别地部分a是c,
387、在某些实施方式中,z选自:-f、-cl、-br、-i、-n3、-oh、-sr14、-ocf3、-och2cf3、-oso2cf3、-so2c6h4ch3、-so2cf3、-so2ch3
388、
389、特别是-oh、-cl、特别是-oh、
390、
391、其中r14是c1-c6-烷基-、芳基-或苄基取代基。
392、在z是–oh的情况下,–oh部分被如通常用于例如固相肽合成的偶联试剂活化,并且用作离去基团。
393、在某些实施方式中,式1的化合物选自式x1、x2、x3、x4、x5、x6、x7、x8、x9、x10、x11、x12、x14、x15、x16、x17、x18、x19、x20、x21、x22、x23、x24、x25、x26、x27、x28、x29、x30、x31、x32、x33、x34、x35、x36、x37、x38、x39、x40、x41、x42、x43、x44、x45、x46或x47的化合物。
394、
395、
396、
397、
398、
399、
400、
401、
402、本发明的第二方面旨在用于纯化肽的方法。
403、根据本发明的第二方面,提供了一种用于纯化肽的方法。所述方法包括以下步骤:
404、-提供接头修饰的粗肽,其中所述粗肽共价结合至根据本发明的第一方面的接头分子,
405、-在偶联步骤中,将所述接头修饰的肽与固体载体偶联,产生固定的接头修饰的肽,
406、-在释放步骤中,通过在酸性条件下添加还原剂来释放所述肽。
407、根据本发明的第一方面的接头分子可以用于纯化肽的方法。在第一步骤中,使粗肽混合物与根据本发明的第一方面的接头分子接触,并将粗肽偶联至接头分子,产生接头修饰的粗肽。通过化学、生物化学或药学领域的普通专家通常已知的标准方法将粗肽偶联至接头分子。
408、在纯化期间,可以通过调节ph来解决接头分子的稳定性。在酸性条件下(特别是在ph低于接头分子最碱性杂原子的pka下),由于该杂原子被质子化并吸出电子的事实,因此接头分子是稳定的(图5、6、7)。当将接头结合至肽并且固定在固体载体上时,在还原条件下经由还原的中间体释放肽,例如在酸性条件下添加还原剂,诸如三苯基膦。还原的中间体特征在于还原的接头部分,例如azalide。还原的中间体的接头部分随时间推移或经触发(诸如增加ph,特别是至ph>还原的中间体的接头部分的最碱性杂原子的pka)衰变。因此,肽释放之前的所有步骤(偶联、任选的洗涤和接头的还原)在酸性条件下进行。当ph增加到高于还原的中间体的接头部分的最碱性杂原子的pka的ph时,还原的中间体接头部分通过1.4/1.6消除反应或亲核攻击而衰变并且释放肽。
409、还原的中间体的接头分子/接头部分的最碱性杂原子涉及以下:例如,部分u由被-n3取代的吡啶组成。吡啶的杂原子n具有~5的pka,其高于-n3部分或还原的-n3部分的pka(-nh3的pka为约4.6)。因此,最碱性杂原子是吡啶部分的n。通过将ph变换为ph>5,还原的中间体的接头部分经历消除反应并释放肽。该机理称为胺开关。
410、替代地,接头分子可以通过氨基甲酸酯开关(图8)而衰变。合适的接头分子包括吸电子部分(诸如-br)和可还原部分(例如–n3)。由于吸电子,接头分子在tfa条件下是稳定的。经还原,接头分子在ph高于氨基甲酸酯的pka时是稳定的。最后,通过将ph降低至ph<氨基甲酸酯的pka,经由1.6消除来释放肽。
411、在某些实施方式中,在添加还原剂之前的所有步骤中的ph是ph<接头部分的最碱性杂原子的pka。
412、在某些实施方式中,肽经由中间体释放。
413、在某些实施方式中,通过在酸性条件下添加还原剂,肽经由还原的中间体释放,该还原的中间体特征在于固定的接头修饰的肽的还原的接头部分。
414、在某些实施方式中,在释放步骤中,实现了特征在于固定的接头修饰的肽的还原的接头部分的还原的中间体,并且通过触发使肽从所述还原的中间体释放,该触发特别是温度和/或ph的变化,更特别地,在胺开关的情况下,通过将ph增加至ph>还原的中间体的接头部分的最碱性杂原子的pka,或者在氨基甲酸酯开关的情况下,通过将ph降低至ph<氨基甲酸酯的pka。
415、在某些实施方式中,在释放步骤中,实现了特征在于固定的接头修饰的肽的还原的接头部分的还原的中间体,并且通过触发使肽从所述还原的中间体释放,该触发特别是温度和/或ph的变化,更特别地,通过将ph增加至ph>还原的中间体的接头部分的最碱性杂原子的pka。
416、肽自发地或通过触发从中间体释放。
417、在某些实施方式中,触发是温度和/或ph的变化。
418、在某些实施方式中,温度的变化是将温度从环境温度(20℃至30℃)增加至较高温度,其中较高温度不超过100℃,特别是70℃,更特别是50℃。
419、如上所述,当ph增加至高于最碱性杂原子的pka的ph时,适用于胺开关的接头如果它们被还原则衰变。
420、在某些实施方式中,触发是ph的变换,特别是增加ph。
421、在某些实施方式中,通过将ph增加至ph>还原的中间体的接头部分的最碱性杂原子的pka,使肽从还原的中间体释放。
422、当ph降低至低于氨基甲酸酯的pka的ph时,适用于氨基甲酸酯开关的接头如果它们被还原则衰变。
423、在某些实施方式中,触发是ph的变换,特别是降低ph。
424、在某些实施方式中,通过将ph降低至ph<接头部分的氨基甲酸酯的pka,使肽从还原的中间体释放。
425、如果还原的中间体在酸性条件下(胺开关)或在ph>氨基甲酸酯的pka下(氨基甲酸酯开关)是稳定的,可以进行额外的洗涤步骤以去除过量的还原剂。因为还原剂可以不仅与接头部分反应而且还与肽反应,所以通过额外的洗涤步骤减少了还原剂和肽之间的不想要的副反应。此外,非挥发性还原剂或其使用产物也是杂质,其将必须通过额外的纯化步骤来去除。
426、在某些实施方式中,在形成还原的中间体之后且在使肽从还原的中间体释放之前,通过洗涤去除还原剂。
427、在某些实施方式中,使用mecn去除还原剂。
428、在某些实施方式中,根据本发明的第一方面的接头分子包括部分w和/或e,其包括叠氮基(-n3)部分。
429、在某些实施方式中,将接头修饰的肽另外结合至合成树脂,并且在进行偶联步骤之前将合成树脂裂解下来,特别是在ph<接头分子的最碱性杂原子的pka下。
430、通过使用tfa实现了将肽从合成载体上裂解下来,通过从tfa混合物中沉淀肽(例如2-8h后)来提供粗肽混合物来结束。对于沉淀,可以使用冷醚(et2o、ipr2o、meotbu、thf/己烷(1:1))。
431、将粗肽混合物溶解在合适的有机溶剂,特别是dmso中,并且添加缓冲系统,特别是10体积百分比的ph 4.5的0.1m柠檬酸钠缓冲液。
432、用于偶联步骤的固体载体是醛修饰的固体载体,特别是琼脂糖珠、聚赖氨酸、聚乙二醇、聚酰胺、聚苯乙烯及它们的共聚物,将溶解的粗肽混合物添加至其中。
433、在某些实施方式中,固体载体包括醛部分。
434、在某些实施方式中,在进行偶联步骤之后,使用封闭剂封闭固体载体的未反应的醛部分。
435、在某些实施方式中,封闭剂与固体载体的醛部分反应,并且包括硫醇和/或胺部分。
436、在某些实施方式中,封闭剂选自半胱氨酸、苏氨酸、2-巯基乙醇、半胱胺、乙二硫醇、羟胺、o-甲基羟胺、n-甲基羟胺、二硫苏糖醇、肼。
437、在某些实施方式中,封闭剂选自半胱氨酸和n-甲基羟胺。
438、特别地,用dmso、6m盐酸胍(guanidium hydrochloride)、具有0.1mnacl的etoh/水(7:3)、水、mecn洗涤偶联产物。
439、在某些实施方式中,在ph<接头分子的最碱性杂原子的pka下进行释放步骤。
440、在某些实施方式中,在ph<接头分子的氨基甲酸酯的pka下进行释放步骤。
441、在某些实施方式中,还原剂选自三苯基膦、三甲基膦、三乙基膦、三丁基膦或三(2-羧基乙基)膦、亚磷酸三甲酯、亚磷酸三乙酯、三丁基膦、亚磷酸二乙酯、5,5′-二硫代双(2-硝基苯甲酸)、连二亚硫酸钠(na2s2o4)、乙二硫醇、丙二硫醇、二硫赤藓糖醇、二硫苏糖醇、na2s、nash、谷胱甘肽、2,2'-二硫二吡啶、bh3、4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷、儿茶酚硼烷、硼烷四氢呋喃、硼烷二甲基硫醚、硼烷二甲基胺络合物、硼烷三苯基膦络合物、硼烷叔丁基胺、lialh4、libh4、nabh4、nabh3cn、nabh(ome)3、nabh(occh3)3、lialh(ocme3)3、氢醌、抗坏血酸钠、抗坏血酸、具有ki的抗坏血酸、肼、nh=nh、甲醛。
442、在某些实施方式中,还原剂选自二硫赤藓糖醇、二硫苏糖醇、三苯基膦、具有ki的抗环血酸、三丁基膦、三甲基膦、三(2-羧基乙基)膦、连二亚硫酸钠(na2s2o4)、硼烷二甲基硫醚、硼烷三苯基膦络合物、nabh4、抗坏血酸
443、在某些实施方式中,还原剂选自二硫赤藓糖醇、二硫苏糖醇、具有ki的抗环血酸、三苯基膦和三甲基膦。
444、在某些实施方式中,还原剂选自三苯基膦、三甲基膦、三乙基膦、三丁基膦或三(2-羧基乙基)膦、亚磷酸三甲酯、亚磷酸三乙酯、三丁基膦、亚磷酸二乙酯、5,5′-二硫代双(2-硝基苯甲酸)、连二亚硫酸钠(na2s2o4)、乙二硫醇、丙二硫醇、二硫苏糖醇、na2s、nash、谷胱甘肽、2,2'-二硫二吡啶、bh3、4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷、儿茶酚硼烷、硼烷四氢呋喃、硼烷二甲基硫醚、硼烷二甲基胺络合物、硼烷三苯基膦络合物、硼烷叔丁基胺、lialh4、libh4、nabh4、nabh3cn、nabh(ome)3、nabh(occh3)3、lialh(ocme3)3、氢醌、抗坏血酸钠、抗坏血酸、肼、nh=nh、甲醛。
445、在某些实施方式中,还原剂选自三苯基膦、三丁基膦、三甲基膦、三乙基膦或三(2-羧基乙基)膦、连二亚硫酸钠(na2s2o4)、硼烷二甲基硫醚、硼烷三苯基膦络合物、nabh4、抗坏血酸。
446、在某些实施方式中,还原剂选自三苯基膦、三甲基膦、三乙基膦或三(2-羧基乙基)膦、连二亚硫酸钠(na2s2o4)、硼烷二甲基硫醚、硼烷三苯基膦络合物、nabh4、抗坏血酸。
447、在某些实施方式中,还原剂选自三苯基膦、连二亚硫酸钠(na2s2o4)、硼烷二甲基硫醚、硼烷三苯基膦络合物、nabh4、抗坏血酸。
448、在某些实施方式中,还原剂选自三苯基膦和三甲基膦。
449、在某些实施方式中,还原剂是三苯基膦。
450、在某些实施方式中,方法包括以下步骤:
451、-提供接头修饰的粗肽,其中所述粗肽共价结合至根据本发明的第一方面的接头分子,其中所述接头分子包括包含叠氮基部分的部分w和/或e,
452、-在偶联步骤中,将所述接头修饰的肽与固体载体偶联,产生固定的接头修饰的肽,
453、-在释放步骤中,通过在酸性条件下添加还原剂来释放所述肽。
454、在某些实施方式中,方法包括以下步骤:
455、-提供接头修饰的粗肽,其中所述粗肽共价结合至根据本发明的第一方面的接头分子,其中所述接头分子包括包含叠氮基部分的部分w和/或e,
456、-在偶联步骤中,将所述接头修饰的肽与固体载体偶联,产生固定的接头修饰的肽,
457、-在释放步骤中,通过在酸性条件下添加还原剂产生还原的中间体,随后将ph增加至ph>所述还原的中间体的接头部分的最碱性杂原子的pka来释放所述肽。
458、在某些实施方式中,方法包括以下步骤:
459、-提供接头修饰的粗肽,其中所述粗肽共价结合至根据本发明的第一方面的接头分子,其中所述接头分子包括包含叠氮基部分的部分w和/或e,
460、-在偶联步骤中,将所述接头修饰的肽与固体载体偶联,产生固定的接头修饰的肽,
461、-在释放步骤中,通过在酸性条件下添加三苯基膦、三甲基膦、三乙基膦或三(2-羧基乙基)膦,特别是三苯基膦产生还原的中间体,随后将ph增加至ph>所述还原的中间体的接头部分的最碱性杂原子的pka来释放所述肽。
462、根据本发明的第二方面的子方面,提供了用于纯化通过固相肽合成制备的粗肽的方法。
463、在某些实施方式中,用于纯化肽的方法包括以下步骤:
464、a)提供结合至合成树脂的肽,其中肽另外共价结合至根据本发明的第一方面所述的接头分子,其中接头分子包括包含叠氮基部分的部分w和/或e,
465、b)将肽从合成树脂上裂解下来
466、c)将裂解的肽混合物与固体载体偶联
467、d)用三苯基膦或三甲基膦、三乙基膦或三(2-羧基乙基)膦,特别是三苯基膦释放肽。
468、通过使用tfa实现了将肽从合成载体上裂解下来,通过从tfa混合物中沉淀肽(例如2-8h后)来提供粗肽混合物来结束。对于沉淀,可以使用冷醚(et2o、ipr2o、meotbu、thf/己烷(1:1))。
469、将粗肽混合物溶解在合适的有机溶剂,特别是dmso中,并且添加缓冲系统,特别是10体积百分比的ph 4.5的0.1m柠檬酸钠缓冲液。
470、用于偶联步骤的固体载体是醛修饰的固体载体,特别是琼脂糖珠、聚赖氨酸、聚乙二醇、聚酰胺、聚苯乙烯及它们的共聚物,将溶解的粗肽混合物添加至其中。
471、特别地,用dmso、6m盐酸胍、具有0.1m nacl的etoh/水(7:3)、水、mecn洗涤偶联产物。
472、在某些实施方式中,将三苯基膦、三甲基膦、三乙基膦或三(2-羧基乙基)膦,特别是三苯基膦添加在mecn/acoh(9:1)中。在某些实施方式中,添加进行15min。
473、在某些实施方式中,将三苯基膦、三甲基膦、三乙基膦或三(2-羧基乙基)膦添加在mecn/acoh/h2o(90:5:5)中,和/或其中在添加三苯基膦、三甲基膦、三乙基膦或三(2-羧基乙基)膦,特别是三苯基膦之后,特别用mecn或mecn/h2o(9:1)洗去形成的azaylide。
474、在某些实施方式中,将三苯基膦、三甲基膦、三乙基膦或三(2-羧基乙基)膦,特别是三苯基膦添加在mecn/acoh/h2o(90:5:5)中。在某些实施方式中,添加进行15min。
475、在某些实施方式中,在添加三苯基膦、三甲基膦、三乙基膦或三(2-羧基乙基)膦之后,特别用mecn或mecn/h2o(9:1)洗涤形成的azaylide。
476、在某些实施方式中,在添加三苯基膦、三甲基膦、三乙基膦或三(2-羧基乙基)膦之后,特别用mecn洗涤形成的azaylide。
477、在某些实施方式中,特别用h2o/tfa使形成的azaylide水解。定量可以是99.95%水至50%水。
478、当接头,特别是u、e、w或v是含氮杂环时,ph应高于杂环部分的pka,在tfa-水水解混合物中或通过添加具有所期望的ph的缓冲溶液已经可能是这种情况。
479、在某些实施方式中,在水解之后进行洗脱步骤,特别是用tfa/h2o,更特别地以9:1的比率。
480、在某些实施方式中,在水解之后进行洗脱步骤,特别是用tfa/h2o,更特别地以95:5的比率。
481、在某些实施方式中,水解产物沉淀,特别是通过添加冷醚,更特别地是et2o、ipr2o、meotbu、thf/己烷(1:1)。
482、术语和定义
483、在本发明的上下文中,“吸电子基团”或“ewg”是能够通过诱导效应或中介效应将电子从其连接的原子或芳基体系中吸走的任何化学基团。
484、在本发明的上下文中,哈米特常数是如hansch and taft(1991),chem.rev.91:165-195中计算和描述的常量。正的哈米特常数反映了取代基对苯基部分施加吸电子作用的能力,而负值表示取代基施加给电子作用。吸电子作用越强,哈米特常数越大。哈米特常数是苯基部分在间位(σm)和对位(σp)的取代基的凭经验确定的常数。在本发明的上下文中,相对于结合的部分y确定位置。对于邻位的取代基,对位的哈米特值是良好的近似值,并且因此在本发明的上下文中用于计算取代基v、w和e的哈米特值之和。
485、在本发明的上下文中,术语“在酸性条件下”涉及ph低于ph 7,特别地ph低于接头的pka,更特别地tfa>50%,在水存在下,ph<0。
486、在本发明的上下文中,术语烷基是指直链或支链饱和烃。例如,术语c1-12烷基表示具有1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个碳原子的饱和的直链或支链烃。c1-c4烷基的非限制性实例是甲基、乙基、丙基、正丁基、2-甲基丙基和叔丁基。
1.一种式1:x-tb-va-u-y-z(1)的化合物,其中,
2.根据权利要求1所述的化合物,其中,e选自哌啶基、哌嗪基、吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、-n(c2h4)2nh2、-n(c2h4)2n-b、-n=n-苯基、
3.根据前述权利要求中任一项所述的化合物,其中,
4.根据前述权利要求中任一项所述的化合物,其中,t选自
5.根据前述权利要求中任一项所述的化合物,其中,u的所述五元或六元杂芳基部分包括1或2个杂原子,特别地所述部分u的五元杂芳基部分选自吡唑、咪唑,并且所述部分u的六元杂芳基部分选自吡啶、哒嗪、嘧啶、吡嗪,特别是吡啶。
6.根据前述权利要求中任一项所述的化合物,其中,u选自式5、6、7或8的部分,特别是式5或6的部分,
7.根据权利要求5所述的化合物,其中,u选自式9、10、11或12的部分,特别是式9或10的部分,
8.根据前述权利要求中任一项所述的化合物,其中,u选自式13、14、15、16、17、18、19、20或21的部分,特别是式13至19的部分,更特别是式15或19的部分,
9.根据权利要求1至3中任一项所述的化合物,其中,z选自:-f、-cl、-br、-i、-n3、-oh、-o(c=o)ch2(c=o)oh、-sr14、-ocf3、-och2cf3、-oso2cf3、-so2c6h4ch3、-so2cf3、-so2ch3
10.一种用于纯化肽的方法,所述方法包括以下步骤:
