本发明涉及合成化学和生物工程,具体涉及一种用于核酸(rna)的5’端加帽的化合物及其应用。
背景技术:
1、近年来,随着全球新冠疫情形势变化,信使rna(mrna)技术与其疫苗药物实现了从实验室到临床应用的突破。在对mrna药物及其功能的研究中,只有在合成的mrna在体内稳定表达目标蛋白时,特定效应才会显现。而在稳定表达目标蛋白过程中,mrna的5’端加帽反应是一种必不可少的修饰过程。在真核细胞中,5’端帽子结构能够保护mrna避免其被核酸外切酶降解,同时避免其被招募蛋白质因子剪切;该结构还可以调节蛋白质的合成;另外,5’端帽子结构还能降低mrna免疫原性、增强mrna体内稳定性。
2、在体外转录过程中,相较于传统的酶法加帽,mrna共转录加帽方法在工艺上更加简便,且易于提升成本效益和扩大mrna药物产能。与此同时,加帽类似物已经从最开始的mcap逐步发展到了arca第二代帽类似物和cap1第三代帽类似物,与之同步的,其转录产量和加帽效率也明显提升。
3、目前很多研究都致力于对帽结构进行化学修饰,以期进一步增强mrna的翻译效率同时降低其免疫原性。
技术实现思路
1、本发明提供了一种用于rna的5’端加帽的化合物及其应用,其中该类化合物包括其药学上可接受的盐、溶剂化物和其立体异构体。使用该化合物对mrna的5’端加帽后的产物具有较高的加帽率,并且具有较好的体外转录效率,同时,在细胞和活体水平都有较高的翻译表达效率。
2、本发明提供了一种用于核酸5’端加帽的化合物,或其药学上可接受的盐、或溶剂化物、或其立体异构体,所述化合物具有式(i)的结构:
3、
4、其中:
5、r0为-or8,其中r8为c1-7烷基、c2-7烯基或c2-7炔基;
6、r1为-h;
7、r2为-h,-oh,-o(ch2)mch3中任意一种,其中m为0-6的任意一个整数;
8、任选地r1与r2通过化学键连接成环,且-r1-r2-为-(ch2)q-o-或-o-(ch2)q-中的任意一种,其中q为1、2或3;
9、r3为h,-oh,-sh,-n3,-nh2,卤素,-cn,-o(ch2)tch3,-o(ch2)psh,-o(ch2)pn3,-o(ch2)pnh2中的任意一种,其中t为0-6的任意一个整数,p为1-6的任意一个整数,其中r3任选被取代;
10、r4、r5、r6、r7各自独立地选自h、oh、och3、卤素、-cn、-sh中的任意一种;
11、n01、n02、n03、n04各自独立地选自0或1,且四者不同时为0;
12、j1、j2、j3、j4、j5各自独立地选自天然或修饰的嘧啶核苷酸碱基、天然或修饰的嘌呤核苷酸碱基。
13、本发明的实施方式包括式(i)化合物,或其药学上可接受的盐、或溶剂化物、或其立体异构体,在式(i)中,j1、j2、j3、j4、j5中至少一个是修饰的核苷酸碱基,优选修饰的嘌呤核苷酸碱基,更优选甲基修饰的嘌呤核苷酸碱基,更优选6-n-甲基腺嘌呤。
14、本发明的实施方式包括式(i)化合物,或其药学上可接受的盐、或溶剂化物、或其立体异构体,在式(i)中,r3为h,-sh,-n3,-nh2,-o(ch2)tch3,-o(ch2)psh,-o(ch2)pn3,-o(ch2)pnh2中的任意一种,其中t和p各自独立地为1-6的任意一个整数,优选为1-4的任意一个整数。
15、本发明的实施方式包括式(ia)化合物,或其药学上可接受的盐、或溶剂化物、或其立体异构体,式(ia)中的基团具有如上所示的含义:
16、
17、本发明的优选实施方式包括式(ia)化合物,或其药学上可接受的盐、或溶剂化物、或其立体异构体,其中,
18、r0为-or8,其中r8为c1-5烷基,优选-ch3,和/或
19、r4选自h、oh、卤素中的任意一种,优选h或f。
20、本发明的实施方式包括式(ib)化合物,或其药学上可接受的盐、或溶剂化物、或其立体异构体:
21、
22、r3’为h,-oh,-sh,-n3,-nh2,-o(ch2)tch3,-o(ch2)psh,-o(ch2)pn3,-o(ch2)pnh2中的任意一种;其余基团具有如上所述的含义。
23、本发明的实施方式包括式(ic)化合物,或其药学上可接受的盐、或溶剂化物、或其立体异构体,式(ic)中的基团具有如上所示的含义:
24、
25、本发明的优选实施方式包括式(ic)化合物,或其药学上可接受的盐、或溶剂化物、或其立体异构体,其中,
26、r0为-or8,其中r8为c1-5烷基,优选-ch3,和/或
27、r4选自h、oh、卤素中的任意一种,优选h或f。
28、根据本发明的一些具体实施方案,其中,所述帽类似物具有以下所示的结构之一:
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31、
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40、
41、本发明还公开了上述化合物作为体外共转录rna加帽试剂的应用。
42、本发明还公开了一种rna分子,包含上述的化合物作为帽结构或帽结构片段。
43、可以理解的,上述rna分子,既可以作为mrna疫苗,也可以作为rna药物使用,或精准医疗的细胞治疗中。
44、本发明还公开了一种药物组合物,包含上述的rna分子,以及药学上可接受的载体。
45、本发明还公开了一种合成rna分子的方法,包括以下步骤:将上述化合物,与多核苷酸模板共孵育,进行模板转录。
46、本发明还公开了一种加帽rna转录反应系统,包括:多核苷酸模板,上述化合物,ntps,rna聚合酶。
1.一种用于核酸5’端加帽的化合物,或其药学上可接受的盐、或溶剂化物、或其立体异构体,所述化合物具有式(i)的结构:
2.如权利要求1所述的化合物,或其药学上可接受的盐、或溶剂化物、或其立体异构体,其特征在于,j1、j2、j3、j4、j5中至少一个是修饰的核苷酸碱基,优选修饰的嘌呤核苷酸碱基,更优选甲基修饰的嘌呤核苷酸碱基,更优选6-n-甲基腺嘌呤。
3.如权利要求1或2所述的化合物,或其药学上可接受的盐、或溶剂化物、或其立体异构体,其中,
4.如权利要求1至3中任一项所述的化合物,或其药学上可接受的盐、或溶剂化物、或其立体异构体,其中所述化合物具有式(ia)的结构:
5.如权利要求4所述的化合物,或其药学上可接受的盐、或溶剂化物、或其立体异构体,其中,
6.如权利要求1至3中任一项所述的化合物,或其药学上可接受的盐、或溶剂化物、或其立体异构体,其中所述化合物具有式(ib)的结构:
7.如权利要求6所述的化合物,或其药学上可接受的盐、或溶剂化物、或其立体异构体,其中所述化合物具有式(ic)的结构:
8.如权利要求7所述的化合物,或其药学上可接受的盐、或溶剂化物、或其立体异构体,其中,
9.如权利要求1所述的化合物,或其药学上可接受的盐、或溶剂化物、或其立体异构体,其中所述化合物具有如下结构之一:
10.如权利要求1-9中任一项所述的化合物作为体外共转录rna加帽试剂的应用。
11.一种rna分子,其特征在于,包含权利要求1-9中任一项所述的化合物作为帽结构或帽结构片段。
12.一种药物组合物,其特征在于,包含权利要求11所述的rna分子,以及药学上可接受的载体。
13.一种合成rna分子的方法,其特征在于,包括以下步骤:将权利要求1-9任一项所述的化合物,与多核苷酸模板共孵育,进行模板转录。
14.一种加帽rna转录反应系统,其特征在于,包括:多核苷酸模板,权利要求1-9任一项所述的化合物,ntps和rna聚合酶。
